Vor zehn Tagen habe ich eine E-Mail von Anthropic bekommen. Mein Projekt wurde in ihr „AI for Science“-Programm aufgenommen, mit 30.000 $ an Claude-Guthaben. Danke an alle im Programm für die Unterstützung 🫶
Das Projekt ist mein eigener Tumor 🥹
Ich bin 35 und habe Brustkrebs im Stadium 4. Ich bin Softwareentwicklerin und baue seit März Tools, um meinen Krebs zu verstehen. Heute kann ich den Namen eines Gens eingeben und es in Tausenden Zellen meines Tumors sichtbar machen.
Meine Lebermetastase, Zelle für Zelle. Jeder Punkt ist eine Zelle, und die Farbe zeigt, wie viel von einem bestimmten Gen (ESR1) sie enthält.
Ich brauche außerdem jemanden, der einen personalisierten Impfstoff für mich herstellen kann, und ein Krankenhaus, das ihn verabreicht. Mehr dazu am Ende.
Wie alles begann
Lange Zeit sagten die Ärzte, meine Schmerzen seien Ischias. Es wurde immer schlimmer, also habe ich am Ende selbst ein MRT bezahlt. Das Ergebnis kam im Januar 2024 per E-Mail, und ich habe es allein gelesen. Ich war sicher, dass es ein Fehler war.
Im März dieses Jahres hat sich mein Krebs weiterentwickelt, und ich beschloss, alles über meinen Tumor zu lernen, was ich konnte.
Wo wir heute stehen
Mein Krebs sitzt in meiner Leber und in meinen Knochen. Mein Tumor ist eine seltene Form. Für einen Fall wie meinen gibt es keine spezifische Leitlinie, und jede Antwort dauert Wochen.
Meine Leber in 3D, erstellt aus meinem eigenen CT-Scan. Die gelben Flecken sind Läsionen. Einige wurden von einer KI gefunden und noch nicht von einem Radiologen bestätigt.
Das Ziel ist ein personalisierter Impfstoff, hergestellt aus meinem eigenen Tumor, damit mein Immunsystem lernt, was es angreifen muss.
Als ich anfing, wusste ich nicht wirklich, was ein Neoantigen ist. Jetzt kann ich einen Sequenzierbericht lesen und mit Forschern sprechen, ohne ständig den Faden zu verlieren.
Wie das Ganze gebaut ist
Ich baue es mit Claude Code. Es ist ein Team aus mehr als 30 Agenten, und jeder hat genau eine Aufgabe. Einer liest Fachartikel und sucht nach Studien in anderen Ländern. Ein anderer prüft ausschließlich jede Zahl gegen ihre Quelle. Wenn eine Frage schwierig ist, antworten zwei oder drei Agenten unabhängig voneinander – und wenn sie sich widersprechen, sehe ich das. Berichte und Dateien kommen per Telegram auf mein Handy, und nichts geht raus, bevor ich Ja sage.
Alle medizinischen Entscheidungen treffen meine Ärzte. Die Agenten helfen mir, mit besseren Fragen in jeden Termin zu gehen, und die Experten prüfen sie. Manchmal ändern sie sehr viel daran.
Das Biopsieprotokoll
Ich brauchte eine neue Biopsie, in Zürich. Eine Biopsie lässt sich nicht einfach wiederholen. Wenn eine Probe nicht entnommen oder nicht richtig gelagert wird, ist sie verloren.
Also habe ich das Protokoll mit meinem System geschrieben: welche Proben und wie jede einzelne aufbewahrt werden muss, je nachdem, was wir später analysieren wollen. Danach hat das Team im Labor von Dr. Paloma Cejas am Dana-Farber, das die Proben auswerten sollte, alles geprüft und verbessert.
Mein Tumor, Zelle für Zelle
Das hier gibt mir immer noch Gänsehaut.
Dr. Cejas' Labor hat meine Leber- und Knochenmetastasen Zelle für Zelle sequenziert, mit einer Technologie namens 10x Flex, die auch bei eingelagertem Gewebe funktioniert. Ich habe die Daten auf meinem Laptop.
Noch keine Schlussfolgerungen. Wir gehen sie langsam gemeinsam mit dem Team durch.
Eine 3D-Karte meiner Erkrankung
Ich hatte zwei PET-Scans und unzählige Befunde, aber ich konnte das große Ganze nicht erkennen.
Links: jede Knochenläsion aus meinen beiden PET-Scans, eingefärbt nach Tracer. Rechts: einer meiner Wirbel in 3D, dargestellt mit jedem PET und mit CT.
Also habe ich aus diesen beiden Scans eine 3D-Karte meiner Metastasen gebaut. Wir haben sie zusammen mit meinem Ärzteteam genutzt, um zu besprechen, welche Läsion biopsiert werden soll. Die Entscheidung lag bei ihnen. Es hat geholfen, dass wir alle auf dieselbe Karte geschaut haben.
Als mein Port nicht mehr funktionierte, habe ich ihn aus drei CT-Scans, die Monate auseinanderlagen, in 3D rekonstruiert, um zu sehen, ob der Katheter verrutscht war.
Mein Port und sein Katheter in 3D, rekonstruiert aus drei CT-Scans. Das lilafarbene Gerät ist eine Illustration.
Zwei Jahre Bluttests auf einem Bildschirm
Jeder Bluttest kommt als PDF. Nach ein paar Monaten hat man Dutzende davon, und niemand liest sie alle.
Ich habe sie in einem einzigen Dashboard zusammengefasst: mehr als 1.800 Werte aus über 70 Blutentnahmen seit Dezember 2023. So kann ein Arzt sofort sehen, wie sich jeder Wert im Laufe der Zeit verändert hat.
Ich brauche einen Impfstoffhersteller und ein Krankenhaus
Der nächste Schritt ist das gesamte Exom meines Tumors im Vergleich mit meiner gesunden DNA. Danach kann mir KI nicht mehr viel helfen.
Danke an alle, die gespendet oder mir geschrieben haben. Wenn du den Impfstoff herstellen oder verabreichen kannst oder weißt, wer das kann, schreib mir. Meine DMs sind offen, und alles Weitere steht auf helpmiriam.com 💜
