Há dez dias, recebi um e-mail da Anthropic. Meu projeto foi selecionado para o programa AI for Science deles, com US$ 30.000 em créditos do Claude. Obrigada a todos do programa por apoiarem isso 🫶
O projeto é o meu próprio tumor 🥹
Tenho 35 anos e câncer de mama em estágio 4. Sou engenheira de software e, desde março, venho criando ferramentas para entender meu câncer. Hoje consigo digitar o nome de um gene e vê-lo em milhares de células do meu tumor.
Minha metástase no fígado, célula por célula. Cada ponto é uma célula, e a cor mostra quanto ela tem de um determinado gene (ESR1).
Também preciso de alguém que consiga fabricar uma vacina personalizada para mim e de um hospital que possa aplicá-la. Falo mais sobre isso no final.
Como tudo começou
Por muito tempo, os médicos disseram que minha dor era ciática. Ela só piorava, então acabei pagando uma ressonância magnética do meu próprio bolso. O resultado chegou por e-mail em janeiro de 2024, e eu li sozinha. Tive certeza de que era um erro.
Em março deste ano, meu câncer progrediu, e decidi aprender tudo o que pudesse sobre meu tumor.
Como estão as coisas
Meu câncer está no fígado e nos ossos. Meu tumor é de um tipo raro. Não existe um protocolo específico para um caso como o meu, e cada resposta demora semanas.
Meu fígado em 3D, criado a partir da minha própria tomografia. As manchas amarelas são lesões. Algumas foram encontradas pela IA e ainda não foram confirmadas por um radiologista.
O objetivo é uma vacina personalizada, feita a partir do meu próprio tumor, para que meu sistema imunológico aprenda o que atacar.
Quando comecei, eu nem sabia direito o que era um neoantígeno. Agora consigo ler um laudo de sequenciamento e conversar com pesquisadores sem me perder tanto.
Como é construído
Eu construo tudo com o Claude Code. É uma equipe de mais de 30 agentes, e cada um tem uma função. Um lê artigos científicos e busca ensaios clínicos em outros países. Outro só verifica se cada número bate com a fonte original. Quando uma pergunta é difícil, dois ou três agentes respondem por conta própria e, se discordarem, eu vejo. Relatórios e arquivos chegam ao meu celular pelo Telegram, e nada sai sem a minha aprovação.
Meus médicos tomam todas as decisões médicas. Os agentes me ajudam a chegar a cada consulta com perguntas melhores, e os especialistas revisam essas perguntas. Às vezes, eles mudam bastante.
O protocolo de biópsia
Eu precisava de uma nova biópsia, em Zurique. Não é fácil repetir uma biópsia. Se a amostra não for coletada, ou não for armazenada do jeito certo, ela se perde.
Então escrevi o protocolo com o meu sistema: quais amostras e como conservar cada uma, dependendo do que queremos analisar depois. Depois, a equipe do laboratório da Dra. Paloma Cejas no Dana-Farber, que analisaria as amostras, revisou e melhorou o protocolo.
Meu tumor, célula por célula
Isso ainda me dá arrepios.
O laboratório da Dra. Cejas sequenciou minhas metástases no fígado e nos ossos célula por célula, com uma tecnologia chamada 10x Flex, que funciona em tecidos armazenados. Tenho os dados no meu notebook.
Ainda sem conclusões. Estamos analisando tudo aos poucos com a equipe.
Um mapa 3D da minha doença
Eu tinha dois PET scans e muitos laudos, mas não conseguia enxergar o quadro completo.
Esquerda: todas as lesões ósseas dos meus dois PET scans, coloridas por traçador. Direita: uma das minhas vértebras em 3D, vista em cada PET e na tomografia.
Então criei um mapa 3D das minhas metástases a partir desses dois exames. Usamos esse mapa com minha equipe médica para discutir qual lesão seria biopsiada. A decisão foi deles. Ajudou muito estarmos todos olhando para o mesmo mapa.
Quando meu cateter totalmente implantável (port) parou de funcionar, recriei tudo em 3D a partir de três tomografias feitas com meses de diferença, para ver se o cateter havia saído do lugar.
Meu port e seu cateter em 3D, reconstruídos a partir de três tomografias. O dispositivo roxo é apenas uma ilustração.
Dois anos de exames de sangue em uma única tela
Cada exame de sangue chega em PDF. Depois de alguns meses, você tem dezenas, e ninguém lê todos.
Coloquei tudo em um único painel: mais de 1.800 valores de mais de 70 coletas de sangue desde dezembro de 2023. Um médico consegue ver rapidamente como cada valor mudou ao longo do tempo.
Preciso de um fabricante de vacinas e de um hospital
O próximo passo é o exoma completo do meu tumor comparado com meu DNA saudável. Depois disso, a IA não pode me ajudar muito.
Obrigada a todos que doaram ou me escreveram. Se você pode fabricar a vacina ou aplicá-la, ou sabe quem pode, me escreva. Minhas mensagens diretas estão abertas, e tudo está em helpmiriam.com 💜
