หัวใจสำคัญของกระบวนการนี้คือ: ขั้นแรก ใช้การค้นหาหลายครั้งเพื่อทำการคัดกรองเบื้องต้นที่ทำซ้ำได้ใน PubMed/NCBI E-utilities จากนั้นใช้ PMID สำหรับการกำจัดข้อมูลซ้ำซ้อนและการจัดระดับหลักฐานบทคัดย่อ มีเพียงเอกสารสำคัญจำนวนเล็กน้อยเท่านั้นที่จะเข้าสู่การตรวจสอบฉบับเต็มใน PMC/BioC การอ้างอิงในเนื้อหาต้องสามารถคลิกได้ ข้อมูลบรรณานุกรมที่ครบถ้วนต้องแสดงไว้ท้ายบทความ ค่า IF สามารถตรวจสอบได้อย่างระมัดระวังผ่านแหล่งข้อมูลที่เข้าถึงได้โดยสาธารณะเท่านั้น และไม่สามารถสันนิษฐานได้ว่ามีอยู่ใน JCR หรือฐานข้อมูลท้องถิ่น ไม่สามารถคาดเดาได้ และการจับคู่ที่มีความน่าเชื่อถือต่ำไม่สามารถถือเป็นผลลัพธ์ที่แน่นอนได้

1. การประมวลผลเบื้องต้นหลังจากผู้ใช้เริ่มการค้นหา

1.1 ขั้นแรก วิเคราะห์คำถามของผู้ใช้

หลังจากได้รับคำถามจากผู้ใช้ คำถามที่เป็นภาษาธรรมชาติจะถูกแยกย่อยออกเป็นองค์ประกอบที่มีโครงสร้างก่อน

ต้องระบุตัวตน:

• หัวข้อวิจัย: ยีน โปรตีน ยา ช่องสัญญาณ ชนิดเซลล์ เนื้อเยื่อ โรค และแบบจำลอง

• ระบบชีวภาพ: มนุษย์ หนู หนูแรต ปลาซีบราฟิช ออร์แกนอยด์ จอประสาทตา บริเวณสมอง เซลล์ไลน์ ฯลฯ

• ประเภทของความสัมพันธ์: การแสดงออก, การควบคุม, หน้าที่, กลไก, ลักษณะทางฟีโนไทป์, การตาย, การอยู่รอด, การรักษา, ความเป็นพิษ, การพัฒนา, การเสื่อมสภาพ เป็นต้น

• ข้อกำหนดด้านหลักฐาน: จำเป็นต้องมีหลักฐานโดยตรง หลักฐานเชิงกลไก หลักฐานฉบับเต็ม แผนภูมิ พารามิเตอร์ปริมาณยา และวิธีการทดลองหรือไม่

• ช่วงเวลา: ไม่จำกัดเวลา, 5 ปีที่ผ่านมา, 1 ปีที่ผ่านมา, ความคืบหน้าล่าสุด และวรรณกรรมคลาสสิก

• รูปแบบผลลัพธ์: คำตอบสั้น ๆ, เอกสารอ้างอิงที่เป็นตัวแทน, บทสรุปการทบทวน, ข้อเสนอแนะในการออกแบบการทดลอง, ตารางแสดงหลักฐาน, แผนภาพกลไก

ตัวอย่าง:

ปัญหาของผู้ใช้:

"กรุณาช่วยค้นหาเอกสารที่เกี่ยวข้องกับการตายของออร์แกนอยด์จอประสาทตาให้ด้วยครับ/ค่ะ"

การแยกส่วนโครงสร้าง (ตัวอย่าง):

• โมเดลหลัก: ออร์แกนอยด์จอประสาทตา, ออร์แกนอยด์จอประสาทตาที่ได้จากเซลล์ต้นกำเนิดแบบเหนี่ยวนำจากมนุษย์ (hPSC), ออร์แกนอยด์ถ้วยตา

• ลักษณะที่ปรากฏ: การตายของเซลล์, อะพอพโทซิส, การเสื่อมสภาพ, การสูญเสียการอยู่รอด, ความเครียด, เนโครซิส

• เซลล์ที่เกี่ยวข้อง: เซลล์รับแสง, เซลล์รูปกรวย, เซลล์รูปแท่ง, เซลล์ปมประสาทจอประสาทตา, เซลล์กลียาของมุลเลอร์

• กลไกที่เป็นไปได้: ภาวะเครียดออกซิเดชัน, ภาวะเครียดใน ER, ความผิดปกติของไมโทคอนเดรีย, ภาวะขาดออกซิเจน, การอักเสบ, เฟอร์โรพโทซิส, เนโครพโทซิส

• วัตถุประสงค์ของการรวบรวมหลักฐาน: ให้ความสำคัญกับงานวิจัยต้นฉบับที่สังเกตการตายของเซลล์/อะพอพโทซิส/การเสื่อมสภาพในออร์แกนอยด์จอประสาทตาของมนุษย์หรือสัตว์โดยตรง จากนั้นจึงค้นหาเอกสารเกี่ยวกับกลไกทางอ้อม

1.2 หลักการแบ่งกลุ่มคำหลัก (ตัวอย่าง)

อย่าเขียนแค่คำค้นหาเดียว เตรียมคำค้นหาอย่างน้อยสามหมวดหมู่สำหรับแต่ละแนวคิด

หมวดที่ 1: คำที่แม่นยำ

• ออร์แกนอยด์จอประสาทตา

• ออร์แกนอยด์เรตินา

• ออร์แกนอยด์จอประสาทตาของมนุษย์

• ออร์แกนอยด์จอประสาทตาที่ได้มาจาก hPSC

• ออร์แกนอยด์จอประสาทตาที่ได้จาก iPSC

หมวดที่สอง: คำพ้องความหมายและคำที่มีความหมายกว้างกว่า

• ออร์แกนอยด์ถ้วยตา

• การเพาะเลี้ยงจอประสาทตาแบบ 3 มิติ

• จอประสาทตาที่ได้จากสเต็มเซลล์

• การแยกแยะจอประสาทตา

• แบบจำลองเนื้อเยื่อจอประสาทตา

หมวดที่สาม: กลไกและคำศัพท์ทางลักษณะภายนอก

• อะพอพโทซิส

• การตายของเซลล์

• การเสื่อมสภาพ

• การอยู่รอด

• ความเครียด

• ภาวะเครียดออกซิเดชัน

• ภาวะเครียดของ ER

• ความผิดปกติของไมโตคอนเดรีย

• ภาวะขาดออกซิเจน

• เนโครพโทซิส

• เฟอร์โรพโทซิส

หากผู้ใช้ระบุประเภทเซลล์ ให้เพิ่ม:

• ตัวรับแสง

• กรวย

• แท่ง

• เซลล์แกงลีออนเรตินา

• มุลเลอร์ กลีอา

• เซลล์ไบโพลาร์

• เซลล์อะมาครีน

หากผู้ใช้ระบุชนิดหรือแหล่งกำเนิด ให้เพิ่มข้อมูลต่อไปนี้:

• มนุษย์

• หนู

• หนู

• ปลาซีบราฟิช

• เซลล์ต้นกำเนิดตัวอ่อนมนุษย์ (hESC)

• iPSC

• เซลล์ต้นกำเนิดที่มีศักยภาพในการเปลี่ยนแปลงเป็นเซลล์ชนิดต่างๆ

1.3 การสร้างคำค้นหาแบบลำดับชั้น

สร้างคำค้นหาอย่างน้อย 3-6 คำ โดยแต่ละคำค้นหาจะสอดคล้องกับวัตถุประสงค์การค้นหา

ชั้นแรก: การดึงข้อมูลหลักฐานโดยตรง

ใช้ในการค้นหาเอกสารที่ตรงกับแบบจำลองเป้าหมายและลักษณะฟีโนไทป์เป้าหมายโดยตรง

```ข้อความ

("retinal organoid" หรือ "retina organoid" หรือ "human retinal organoid") และ (apoptosis หรือ "cell death" หรือ degeneration)

```

ชั้นที่สอง: การดึงข้อมูลโมเดลแบบขยาย

ใช้เพื่อรวบรวมงานวิจัยที่ผู้เขียนไม่ได้ใช้คำว่า "retinal organoid" อย่างตรงตัว แต่คำนี้มีความเกี่ยวข้องอย่างแท้จริง

```ข้อความ

("ออร์แกนอยด์ถ้วยตา" หรือ "การเพาะเลี้ยงเรตินาแบบ 3 มิติ" หรือ "เรตินาที่ได้จากเซลล์ต้นกำเนิด") และ (การอยู่รอด หรือ การตายของเซลล์ หรือ ความเครียด)

```

ชั้นที่สาม: การค้นหาเฉพาะกลไก

ใช้เพื่อตรวจสอบเส้นทางหรือกลไกเฉพาะต่างๆ

```ข้อความ

("retinal organoid" หรือ "retina organoid") และ ("oxidative stress" หรือ "ER stress" หรือ hypoxia หรือ mitochondria)

```

ชั้นที่สี่: การค้นหาตามประเภทเซลล์

```ข้อความ

("ออร์แกนอยด์เรตินา" หรือ "ออร์แกนอยด์เรตินา") และ (เซลล์รับแสง หรือ เซลล์รูปกรวย หรือ เซลล์รูปแท่ง หรือ "เซลล์แกงลีออนเรตินา") และ (การตาย หรือ อะพอพโทซิส หรือ การเสื่อมสภาพ)

```

ชั้นที่ห้า: การดึงข้อมูลแบบจำลองโรค

```ข้อความ

("อวัยวะเทียมจอประสาทตา" หรือ "อวัยวะเทียมจอประสาทตา") และ (โรค หรือ ความเสื่อม หรือ โรคกล้ามเนื้อเสื่อม หรือ โรคจอประสาทตาอักเสบ หรือ โรคต้อหิน)

```

ชั้นที่หก: การตรวจสอบ/การค้นหาข้อมูลเบื้องหลัง

```ข้อความ

("retinal organoid" หรือ "retina organoid") และ (review หรือ protocol หรือ model)

```

2. ใช้วิธีการและเว็บไซต์ใดบ้างในการค้นหาข้อมูล?

2.1 แหล่งข้อมูลที่แนะนำ: PubMed / NCBI E-utilities

PubMed เป็นเครื่องมือที่นิยมใช้สำหรับการค้นหาเอกสารทางชีวการแพทย์ อย่าใช้การคัดลอกข้อมูลจากหน้า PubMed โดยตรง ให้ใช้ API ของ NCBI E-utilities แทน

2.1.1 ESearch: การดึงข้อมูล PMID โดยใช้คำค้นหา

อินเทอร์เฟซ:

```ข้อความ

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi

```

พารามิเตอร์:

```ข้อความ

db=pubmed

คำศัพท์ = <คำค้นหา>

retmode=json

retmax=20

เรียงลำดับตามความเกี่ยวข้อง

```

คุณสามารถเรียงลำดับตามเวลาได้เช่นกัน:

```ข้อความ

เรียงลำดับ = วันที่ตีพิมพ์

```

ตัวอย่าง:

```ข้อความ

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pubmed&term=(%22retinal%20organoid%22%20OR%20%22retina%20organoid%22)%20AND%20(apoptosis%20OR%20%22cell%20death%22)&retmode=json&retmax=20&sort=relevance

```

อ่านจากเอกสารการส่งคืน:

```ข้อความ

รายการรหัสผลการวิจัย

```

นี่คือรายการ PMID

2.1.2 สรุป: การขอรับข้อมูลเมตาของเอกสารทางวิชาการ

อินเทอร์เฟซ:

```ข้อความ

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi

```

พารามิเตอร์:

```ข้อความ

db=pubmed

id=PMID1,PMID2,PMID3

retmode=json

```

ข้อมูลที่ดึงมา:

• พีเอ็มไอดี

• ชื่อ

• ชื่อวารสารฉบับเต็ม

• ตัวย่อของแหล่งที่มา/วารสาร

• วันที่เผยแพร่

• ผู้เขียน

• DOI และ PMCID ใน articleids

• เล่ม, ฉบับ, หน้า

2.1.3 EFetch: การดึงข้อมูลสรุปและรายละเอียด XML

อินเทอร์เฟซ:

```ข้อความ

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi

```

พารามิเตอร์:

```ข้อความ

db=pubmed

id=PMID1,PMID2

retmode=xml

rettype=abstract

```

ข้อมูลที่ดึงมา:

• ชื่อบทความ

• บทคัดย่อ

• ชื่อวารสาร

• ตัวย่อ ISO

• ISSN / eISSN

• วันที่เผยแพร่

• DOI

• พีเอ็มซีไอดี

• คำศัพท์ MeSH

2.1.4 กลยุทธ์การเรียกค้นข้อมูลแบบกลุ่ม

ขั้นตอนที่แนะนำ:

1. เรียกใช้ ESearch สำหรับแต่ละคำค้นหา

2. สำหรับแต่ละคำค้นหา ให้เลือกผลลัพธ์ 5-20 รายการแรก

3. รวม PMID ทั้งหมดเข้าด้วยกัน

4. ใช้ PMID เพื่อลบข้อมูลที่ซ้ำกัน

5. ใช้ ESummary / EFetch เพื่อดึงข้อมูลเมตาและข้อมูลสรุปเป็นชุดๆ

6. ในขั้นตอนการคัดกรองเบื้องต้น ให้อ่านเฉพาะข้อมูลเมตาและบทคัดย่อเท่านั้น อย่าเพิ่งเริ่มอ่านเนื้อหาฉบับเต็ม

───────────────

2.2 ขั้นตอนที่สอง: การตรวจสอบเอกสาร PMC/BioC อย่างละเอียด

ข้อความฉบับเต็มจะปรากฏเฉพาะในกรณีต่อไปนี้:

• ผู้ใช้ขอให้อ่านข้อความทั้งหมดอย่างละเอียด

• บทคัดย่อไม่เพียงพอที่จะระบุกลไกได้

• ต้องใช้แผนภูมิ วิธีการทดลอง ความเข้มข้น ปริมาณยา IC50 EC50 Kd และ Ki

• มีการระบุ PMID ที่สำคัญจำนวนเล็กน้อย ซึ่งจำเป็นต้องได้รับการตรวจสอบเป็นรายกรณี

2.2.1 การแปลง PMID เป็น PMCID

อินเทอร์เฟซ:

```ข้อความ

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/utils/idconv/v1.0/?ids=&format=json

```

หากพบ PMCID แสดงว่า PMC อาจเปิดให้เข้าถึงข้อความฉบับเต็มได้

2.2.2 จัดลำดับความสำคัญของ BioC JSON

อินเทอร์เฟซ:

```ข้อความ

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/bionlp/RESTful/pmcoa.cgi/BioC_json//unicode

```

ข้อดี: มีโครงสร้างที่ดี เหมาะสำหรับการดึงข้อความหลักออกมาเป็นย่อหน้าๆ

2.2.3 ลองใช้ PMC XML เมื่อ BioC ไม่พร้อมใช้งาน

อินเทอร์เฟซ:

```ข้อความ

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles//?report=xml

```

ข้ามขั้นตอนนี้เมื่อทำการแยกข้อความหลัก:

• เอกสารอ้างอิง

• บรรณานุกรม

• คำขอบคุณ

• การมีส่วนร่วมของผู้เขียน

• ผลประโยชน์ทับซ้อน

การตรวจสอบข้อความฉบับเต็มต้องมีเกณฑ์การหยุด:

• เอกสารแต่ละฉบับจะถูกสแกนเพียงครั้งเดียวเท่านั้น

• โดยค่าเริ่มต้น ระบบจะดึงเฉพาะย่อหน้าที่เกี่ยวข้องกับคำถามเท่านั้น

• หากไม่พบข้อมูลที่ตรงกันในช่องเป้าหมาย ให้ระบุว่า "ไม่พบหลักฐานโดยตรง"

• หลีกเลี่ยงการดึงข้อมูลคำหลักซ้ำๆ

───────────────

2.3 bioRxiv / medRxiv

ใช้เพื่อเสริมข้อมูลในเอกสารฉบับร่างล่าสุด

คุณสามารถใช้ API อย่างเป็นทางการได้:

```ข้อความ

https://api.biorxiv.org/details/biorxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD

https://api.biorxiv.org/details/medrxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD

```

คุณสามารถใช้การค้นหาแบบปกติเป็นส่วนเสริมได้เช่นกัน:

```ข้อความ

site:biorxiv.org การตายของเซลล์ออร์แกนอยด์จอประสาทตา

site:medrxiv.org การเสื่อมสภาพของออร์แกนอยด์จอประสาทตา

```

เอกสารฉบับร่างต้องติดป้ายกำกับ:

```ข้อความ

นี่เป็นฉบับร่างและยังไม่ได้รับการตรวจสอบโดยผู้ทรงคุณวุฒิ

```

───────────────

2.4 Crossref/OpenAlex/Unpaywall

ใช้เพื่อกรอกข้อมูล DOI ให้ครบถ้วน, ที่อยู่สำหรับเข้าถึงเอกสารฉบับเต็ม และข้อมูลการตีพิมพ์

ครอสเรฟ:

```ข้อความ

https://api.crossref.org/works?query.title=<title>

```

OpenAlex:

```ข้อความ

https://api.openalex.org/works?search=<title or topic>

```

ยกเลิกการเก็บค่าธรรมเนียม:

```ข้อความ

https://api.unpaywall.org/v2/?email=

```

ใช้:

• กรอกข้อมูล DOI ครบถ้วน

• ค้นหาลิงก์ OA PDF

• การตรวจสอบชื่อวารสาร

• การตรวจสอบปีที่ตีพิมพ์

───────────────

2.5 หน้าสำนักพิมพ์

เข้าถึงหน้าของผู้เผยแพร่เฉพาะในกรณีที่ข้อมูล API ไม่เพียงพอเท่านั้น

กฎการเข้าถึง:

• URL ของผู้เผยแพร่แต่ละรายจะถูกทดลองใช้เพียงครั้งเดียวเท่านั้น

• หากคุณพบ CAPTCHA, ระบบป้องกันการเข้าสู่ระบบ, Cloudflare, ข้อความ "ปฏิเสธการเข้าถึง" หรือระบบป้องกันการเข้าถึงจากสถาบัน ให้หยุดทันที

• หลีกเลี่ยงการรีเฟรชหน้าเว็บซ้ำๆ การเปลี่ยนเส้นทางภายในเว็บไซต์เดียวกัน หรือการรอวนลูป

• ใช้ข้อมูลจาก PubMed, PMC, Crossref, OpenAlex, Unpaywall และ DOI เป็นแหล่งข้อมูลสำรอง

3. วิธีการจัดระเบียบข้อมูลหลังจากดึงข้อมูลมาแล้ว

3.1 จัดตั้งโครงสร้างบันทึกข้อมูลที่เป็นมาตรฐานเดียวกัน

เอกสารแต่ละฉบับจะถูกรวบรวมไว้ในบันทึกที่เป็นเอกภาพ

ฟิลด์:

```ข้อความ

พีเอ็มไอดี

โดอิ

พีเอ็มซีดี

ชื่อ

ผู้เขียน

วารสาร

วารสารย่อ

อิสเอ็น

ไอส์เอ็น

ปี

เชิงนามธรรม

แหล่งที่มาของการค้นหา

ระดับหลักฐาน

แท็กหลักฐาน

ประเภทกระดาษ

URL

```

3.2 การกำจัดข้อมูลซ้ำซ้อน

ลำดับความสำคัญ:

1. การลบข้อมูลซ้ำซ้อนของ PMID

2. ใช้ DOI เพื่อลบข้อมูลซ้ำซ้อนหากไม่มี PMID

3. หากไม่มี DOI ให้ใช้ lower(title) + year + first_author เพื่อลบรายการที่ซ้ำกัน

เก็บ query_source ที่ถูกเรียกใช้ในครั้งแรกไว้ และบันทึกว่า query ใดบ้างที่เรียกใช้เอกสารนั้น

3.3 การจำแนกประเภทหลักฐาน

จำเป็นต้องแยกแยะความแตกต่างดังนี้:

หลักฐานโดยตรง:

สายพันธุ์เป้าหมาย เนื้อเยื่อ ชนิดของเซลล์ แบบจำลอง และสภาวะการรักษาจะถูกจับคู่กันโดยตรง

หลักฐานทางอ้อม:

ระบบที่อยู่ใกล้เคียง รูปแบบที่คล้ายกัน และกลไกที่คล้ายกันได้รับการสนับสนุน แต่ไม่ใช่ระบบที่แก้ปัญหาของผู้ใช้โดยตรง

ไม่พบหลักฐานโดยตรง:

มีเพียงข้อมูลพื้นฐาน การคาดเดา บทวิจารณ์ หรือแบบจำลองที่เกี่ยวข้องเท่านั้น ไม่มีผลการทดลองโดยตรง

3.4 การติดฉลากประเภทเอกสาร

อย่างน้อยที่สุดควรทราบสิ่งต่อไปนี้:

• งานวิจัยต้นฉบับ

• ทบทวน

• โปรโตคอล

• บทความก่อนตีพิมพ์

• ชุดข้อมูล/แหล่งข้อมูล

• การศึกษาทางคลินิก

• เอกสารวิธีการ

3.5 กฎการเรียงลำดับ

คำแนะนำในการจัดเรียง:

1. งานวิจัยต้นฉบับที่มีหลักฐานโดยตรง

2. การวิจัยเกี่ยวกับกลไกสำคัญ

3. งานวิจัยสำคัญล่าสุด

4. การศึกษาพื้นฐานแบบดั้งเดิม

5. รีวิวคุณภาพสูง

6. หลักฐานทางอ้อม

อย่าจัดเรียงตามค่า IF เพียงอย่างเดียว ค่า IF เป็นตัวบ่งชี้ระดับวารสารและไม่ได้บ่งบอกถึงคุณภาพของบทความแต่ละบทความ

4. วิธีจัดเรียงข้อความที่ยกมาในข้อความตอบกลับ

4.1 รูปแบบการอ้างอิงข้อความ

ข้อความอ้างอิงทั้งหมดต้องสามารถคลิกได้

รูปแบบ:

```มาร์คดาวน์

[[1. **วารสาร**, ปี]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)

```

ตัวอย่าง:

```มาร์คดาวน์

การศึกษาก่อนหน้านี้ได้สังเกตพบความเครียดและการเสื่อมสภาพของเซลล์รับแสงที่เกี่ยวข้องกับระยะพัฒนาการในออร์แกนอยด์จอประสาทตาของมนุษย์ [[1. **Cell Stem Cell**, 2019]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/xxxxxxx/)

```

อย่าเขียนแบบนี้:

```ข้อความ

[1]

(PMID: xxxxx)

ดูเอกสารอ้างอิงที่ 1

```

4.2 โครงสร้างคำตอบที่แนะนำ

ย่อหน้าแรก: สรุปโดยตรง

```ข้อความ

สรุป: มีรายงานที่เกี่ยวข้องอยู่บ้าง แต่หลักฐานโดยตรงส่วนใหญ่มุ่งเน้นไปที่...; หลักฐานโดยตรงเกี่ยวกับ... ยังคงขาดอยู่

```

ย่อหน้าที่สอง: การจำแนกประเภทหลักฐาน

```ข้อความ

หลักฐานโดยตรง:

- เอกสารอ้างอิง A: ...

หลักฐานทางอ้อม:

- เอกสารอ้างอิง B: ...

ไม่พบหลักฐานโดยตรง:

- ไม่พบในรอบนี้...

```

ย่อหน้าที่สาม: สรุปกลไกการทำงาน

จัดกลุ่มตามหัวข้อ เช่น:

• วิถีอะพอพโทซิส/แคสเปส

• ภาวะเครียดออกซิเดชัน

• ความผิดปกติของไมโตคอนเดรีย

• ภาวะเครียดของ ER

• ภาวะขาดออกซิเจน/ความเครียดทางเมตาบอลิซึม

• การอักเสบ

• ความไม่สอดคล้องกันด้านพัฒนาการ

ย่อหน้าที่สี่: ช่องว่างทางการวิจัย

ระบุให้ชัดเจนว่าประเด็นใดบ้างที่ขาดหลักฐานโดยตรง

ย่อหน้าที่ห้า: แรงบันดาลใจจากการทดลอง

หากผู้ใช้ต้องการข้อมูลการออกแบบการทดลอง โปรดระบุตัวบ่งชี้ วิธีการวิเคราะห์ จุดเวลา และกลุ่มควบคุม

5. รายชื่อเอกสารอ้างอิงทั้งหมดอยู่ท้ายบทความ

หากมีการอ้างอิงแหล่งอ้างอิงเฉพาะเจาะจงในเนื้อหา จะต้องแนบรายการอ้างอิงทั้งหมดไว้ท้ายบทความด้วย

รูปแบบ:

```มาร์คดาวน์

## รายชื่อข้อมูลอ้างอิงทั้งหมด

1. Smith J และคณะ, **ชื่อวารสาร** (2021), [PMID: 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF＝X，Qn}*

2. Wang X และคณะ, **ชื่อวารสาร** (2022), [DOI: 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *{IF=ต้องตรวจสอบ}*

```

รูปแบบผู้เขียน:

• ผู้เขียน 1-3 คน: ระบุชื่อผู้เขียนทั้งหมด

• มีผู้เขียนมากกว่า 3 คน: ผู้เขียนคนแรกและคณะ

PMID / DOI / URL ต้องสามารถคลิกได้

6. การตรวจสอบและการติดฉลาก IF

6.1 ก่อนอื่น เรามาอธิบายข้อจำกัดในทางปฏิบัติของการตรวจสอบ IF กันก่อน

โดยปกติแล้ว ค่า Journal Impact Factor อย่างเป็นทางการจะมาจาก Clarivate Journal Citation Reports (JCR) อย่างไรก็ตาม โดยทั่วไปแล้ว ตัวแทนภายนอกใดๆ ก็ตามมักไม่มีบัญชี Clarivate/JCR หรือตาราง JCR ในเครื่อง ดังนั้นอย่าตรวจสอบผ่านช่องทางนี้

```

6.2 วิธีการปฏิบัติในการใช้ทักษะ IF

เส้นทางหลัก:

1. หากข้อมูลที่ป้อนเป็น PMID ให้ใช้ NCBI E-utilities เพื่อดึงข้อมูลเมตาจาก PubMed ก่อน

- ดึงข้อมูลชื่อวารสารแบบเต็ม - ดึงข้อมูลชื่ออ้างอิง/ตัวย่อ ISO - ดึงข้อมูล ISSN/eISSN - ดึงข้อมูลฟิลด์เสริม เช่น ชื่อเรื่อง ปี และ DOI

2. ใช้ส่วนติดต่อผู้ใช้ JSON บนมือถือของ iikx/iscience ที่เปิดให้ใช้งานได้ทั่วไปในการค้นหาวารสาร

API ค้นหา:

```ข้อความ

https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci&c=index&a=info&keyword=

```

รายละเอียด API:

```ข้อความ

https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail&id=&classid=

```

3. ทำการค้นหาโดยใช้เกณฑ์การจับคู่แบบอนุรักษ์นิยมกับผลการค้นหา

- ให้ความสำคัญกับการจับคู่ชื่อวารสารที่ตรงกันทุกประการเป็นอันดับแรก - รองลงมาคือการจับคู่คำย่อที่ตรงกันทุกประการ - ใช้ความระมัดระวังเป็นพิเศษกับคำสั้นและคำกว้าง - ไม่ยอมรับการจับคู่ที่ไม่ตรงกันอย่างเห็นได้ชัด เช่น การจับคู่ "Nature" กับ "Nature Reviews" - ส่งคืนผลลัพธ์ที่ไม่ชัดเจน/ไม่พบ หากการจับคู่ไม่เสถียร แทนที่จะคาดเดา

4. หาก PubMed ให้ชื่อย่อมา ให้ลองขยายชื่อย่อนั้นให้เป็นชื่อเต็มหรือชื่อเรื่องอื่นโดยใช้แคตตาล็อกของ NLM

ส่วนติดต่อการค้นหาในแคตตาล็อกของ NLM ยังคงเป็น NCBI E-utilities:

```ข้อความ

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog&term=[Title Abbreviation]&retmode=xml&retmax=1

```

จากนั้นใช้ ESummary เพื่อรับชื่อเรื่อง/ชื่อเรื่องสำรอง

5. อ่านรายละเอียดผลลัพธ์จาก iikx:

- ค่า Impact Factor - ปีของ Impact Factor - อันดับควอไทล์ของ JCR - อันดับควอไทล์ของ CAS/CAS (ถ้ามี) - URL ของแหล่งข้อมูล - ระดับความมั่นใจในการจับคู่

6. อย่าใส่ปี IF ไว้ในเนื้อหาหลักเมื่อทำการอธิบายเพิ่มเติม ให้ใช้คำอธิบายแบบกระชับแทน

คำอธิบายประกอบสุดท้ายควรระบุเพียง:

```ข้อความ

*{IF＝X，Qn}*

```

หากล้มเหลว:

```ข้อความ

*{IF=รอการตรวจสอบ}*

```

หรือ:

```ข้อความ

*{IF=ไม่พบ}*

```

6.3 ขั้นตอนเฉพาะ

ดำเนินการตามขั้นตอนต่อไปนี้สำหรับเอกสารแต่ละฉบับ

ขั้นตอนที่ 1: เตรียมชื่อสำหรับการค้นหาในวารสาร

ให้ความสำคัญกับการดึงข้อมูลจากเมตาเดต้าของ PubMed เป็นอันดับแรก:

```ข้อความ

ชื่อวารสารฉบับเต็ม

ISOAbbreviation / Source

ISSN

อีอิสเอ็น

```

หากมีเพียง DOI ให้ใช้ Crossref หรือ OpenAlex เพื่อค้นหาชื่อวารสารก่อน

ครอสเรฟ:

```ข้อความ

https://api.crossref.org/works/

```

OpenAlex:

```ข้อความ

https://api.openalex.org/works/https://doi.org/

```

ขั้นตอนที่ 2: กำหนดมาตรฐานชื่อวารสาร

กฎเกณฑ์การกำหนดมาตรฐาน:

• ตัวพิมพ์เล็กทั้งหมด

• การถอดรหัส HTML

• แทนที่ & ด้วย and

• ลบเครื่องหมายวรรคตอนออก

• รวมพื้นที่หลายๆ แห่งเข้าด้วยกัน

• เมื่อทำการเปรียบเทียบ คุณสามารถใช้รูปแบบย่อ ซึ่งจะลบช่องว่างทั้งหมดออกไปได้

ตัวอย่างรหัสเทียม:

ไพธอน

นำเข้า re, html

นิยามบรรทัดฐาน:

s = html.unescape(s หรือ '').lower()

s = re.sub(r'&', ' และ ', s)

s = re.sub(r'[^a-z0-9]+', ' ', s)

return re.sub(r'\s+', ' ', s).strip()

def compact(s):

คืนค่าค่าปกติ (norm(s)) แล้วแทนที่ด้วย ' ', ''

```

ขั้นตอนที่ 3: ค้นหาข้อมูลผ่านอินเทอร์เฟซการค้นหาของ iikx

```ข้อความ

https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci&c=index&a=info&keyword=

```

ขอแนะนำให้ตั้งค่า User-Agent ตัวอย่างเช่น:

```ข้อความ

มอซซาโกลา/5.0

```

หากไม่พบผลลัพธ์ที่ตรงกันเป๊ะในหน้าแรก คุณสามารถเลื่อนดูได้เพียงจำนวนหน้าจำกัด เช่น ไม่เกิน 8 หน้า

โดยทั่วไปแล้วพารามิเตอร์สำหรับการเปลี่ยนหน้ามีดังนี้:

```ข้อความ

หน้า=2

หน้า=3

```

ขั้นตอนที่ 4: เลือกผู้สมัครจากผลการค้นหา

สาขาอาชีพที่ผู้สมัครมักพิจารณา ได้แก่:

```ข้อความ

รหัส

คลาส

ชื่อ

คำบรรยายขนาดเล็ก

IF หรือ IF2024

zky2020

URL

```

กฎการจับคู่:

• ถ้า compact(query) == compact(candidate.title) ให้ยอมรับ

• ถ้า norm(query) == norm(candidate.title) ให้ยอมรับ

• ถ้า compact(query) == compact(candidate.smalltitle) ให้ยอมรับ

• ถ้า norm(query) == norm(candidate.smalltitle) ให้ยอมรับ

• ห้ามรับสตริงย่อยเว้นแต่ว่าคำค้นหาจะยาวเพียงพอและไม่กำกวม

• ควรระมัดระวังเป็นพิเศษกับคำสั้นๆ เช่น Nature, Science, Cell, Brain, Vision และ Retina

ขั้นตอนที่ 5: หากไม่พบรายการที่ตรงกัน ให้ใช้ตัวย่อแบบขยายของแคตตาล็อก NLM

ตัวอย่างเช่น ใน PubMed แหล่งที่มาคือ:

```ข้อความ

รังสีอิสระ ชีวการแพทย์

```

คุณสามารถตรวจสอบได้ที่:

```ข้อความ

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog&term=Free%20Radic%20Biol%20Med%5BTitle%20Abbreviation%5D&retmode=xml&retmax=1

```

หลังจากได้รับรหัสแคตตาล็อกของ NLM แล้ว ให้ใช้งานดังนี้:

```ข้อความ

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi?db=nlmcatalog&id=&retmode=xml

```

อ่าน:

```ข้อความ

ชื่อ

ชื่อเรื่องทางเลือก

```

จากนั้นใช้ชื่อเต็มเหล่านี้ในการค้นหา iikx

ขั้นตอนที่ 6: ตรวจสอบรายละเอียดอินเทอร์เฟซ iikx

หากผลการค้นหามีข้อมูลดังต่อไปนี้:

```ข้อความ

id=

คลาส = <คลาส>

```

เรียก:

```ข้อความ

https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail&id=&classid=

```

อ่านรายละเอียดเพิ่มเติม:

```ข้อความ

IF2024, IF2023, IF2022 ...

ถ้า

zky2020 หรือฟิลด์ควอไทล์ JCR อื่นๆ

jcr22 / jcr12 หรือฟิลด์พาร์ติชัน

อิสเอ็น

ไอส์เอ็น

ชื่อ

คำบรรยายขนาดเล็ก

หมวดหมู่

```

ขั้นตอนที่ 7: เลือกคำสั่ง IF ล่าสุด

ค้นหาข้อมูลในฟิลด์ที่ส่งคืนเพื่อหารูปแบบทั้งหมดที่พบ:

```ข้อความ

IF20xx

```

ตัวอย่างเช่น:

```ข้อความ

ไอเอฟ2024

ไอเอฟ2023

ไอเอฟ2022

```

เลือกปีที่มีตัวเลขหลักสำคัญมากที่สุด

หากไม่พบ IF20xx ให้ลองอ่าน:

```ข้อความ

ถ้า

ถ้าค่า

```

หากไม่พบค่าที่ถูกต้อง ระบบจะระบุว่าไม่พบข้อมูล

ขั้นตอนที่ 8: แสดงระดับความเชื่อมั่นและป้ายกำกับ

หากชื่อเรื่อง/ชื่อย่อตรงกันทุกประการ และรายละเอียดส่งค่า IF ที่ถูกต้องกลับมา:

```ข้อความ

*{IF＝X，Qn}*

```

หากผลการแข่งขันไม่แน่ชัด:

```ข้อความ

*{IF=รอการตรวจสอบ}*

```

หาก API สาธารณะไม่แสดงผลลัพธ์ใดๆ:

```ข้อความ

*{IF=ไม่พบ}*

```

6.4 รูปแบบคำอธิบายประกอบ IF

รูปแบบคงที่:

```ข้อความ

*{IF＝X，Qn}*

```

ตัวอย่าง:

```มาร์คดาวน์

Smith J และคณะ, **Neuron** (2020), [PMID: 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF＝15.0, Q1}*

```

สังเกต:

• ปีของ JCR ไม่ได้ถูกเขียนไว้ในคำอธิบายประกอบ IF

• ห้ามเขียนว่า "2024 JCR IF"

• ห้ามเขียน "JCR 2024"

• จะเก็บรักษาไว้เฉพาะปีที่ตีพิมพ์เท่านั้น

• หากค่า IF เป็น 0.0, เป็นค่าว่าง, มีแหล่งที่มาไม่เสถียร หรือมีการจับคู่ที่ไม่เสถียร ตัวเลขนั้นจะไม่แสดง

6.5 การจัดการมาตรฐานสำหรับความล้มเหลวในการตรวจสอบ IF

อย่าเดา

ห้ามใช้ชื่อวารสารในการกรอกตัวเลข

อย่าใช้แบบจำลองขนาดใหญ่เพื่อจดจำและกรอกคำสั่ง IF

เมื่อเกิดความล้มเหลว จะอนุญาตให้มีสถานะได้เพียงสามสถานะเท่านั้น:

```ข้อความ

*{IF=รอการตรวจสอบ}*

```

ใช้สำหรับ:

• ผลการค้นหาไม่ชัดเจน

มีวารสารที่คล้ายคลึงกันหลายฉบับ

• พบเพียงชื่อย่อ แต่ไม่สามารถยืนยันชื่อเต็มได้

• ค่า IF ที่ได้จากแหล่งข้อมูลสาธารณะนั้นน่าสงสัย

```ข้อความ

*{IF=ไม่พบ}*

```

ใช้สำหรับ:

• การค้นหาข้อมูลในส่วนติดต่อสาธารณะไม่พบผลลัพธ์ใดๆ

• วารสารนี้ไม่อยู่ในขอบเขตการคุ้มครองของ SCI/JCR

• ฉบับใหม่นี้ยังไม่มีรหัส IF

```ข้อความ

*{IF=ไม่สามารถตรวจสอบได้โดยสาธารณะ}*

```

ใช้สำหรับ:

• ผู้ใช้จำเป็นต้องมี JCR อย่างเป็นทางการ แต่เอเจนต์ปัจจุบันไม่มีสิทธิ์เข้าถึง Clarivate/JCR

7. รายการตรวจสอบตนเองขั้นสุดท้าย

ต้องตรวจสอบก่อนจัดส่ง:

• ควรตอบคำถามหลักของผู้ใช้ก่อนหรือไม่?

• ควรแยกแยะระหว่างหลักฐานโดยตรง หลักฐานโดยอ้อม และการไม่พบหลักฐานโดยตรงหรือไม่

• ข้อความอ้างอิงทั้งหมดสามารถคลิกได้หรือไม่?

• มีรายการอ้างอิงฉบับสมบูรณ์อยู่ท้ายบทความหรือไม่

• เอกสารทุกฉบับมีป้ายกำกับ IF (ข้อมูลเข้า/ข้อมูลออก) หรือป้ายกำกับที่ระบุว่ากำลังรอการตรวจสอบ/ไม่พบข้อมูลหรือไม่?

• สามารถคลิกดูได้หรือไม่ว่า PMID/DOI/URL นั้นถูกต้องหรือไม่

• วิธีนี้หลีกเลี่ยงการนำผลการวิเคราะห์เนื้อเยื่อโดยรวมมาแทนที่ข้อสรุปเกี่ยวกับเซลล์ชนิดเฉพาะหรือไม่?

• วิธีนี้ช่วยหลีกเลี่ยงการใช้การกระตุ้น/ฟอสโฟรีเลชันมาทดแทนการเพิ่มขึ้นของการแสดงออกโดยรวมหรือไม่?

• จะระบุว่าเป็นฉบับร่างก่อนตีพิมพ์หรือไม่

• มีการระบุขอบเขตการค้นหาหรือไม่?

• หากข้อมูลนั้นไม่ได้มาจากความทรงจำหรือการคาดเดา

8. รหัสเทียมที่สามารถสร้างซ้ำได้

ไพธอน

queries = build_queries(user_question)

pmid ทั้งหมด = []

สำหรับคำค้นหาในคำค้นหา:

pmids = ncbi_esearch(query, retmax=20, sort='relevance')

all_pmids.extend(pmids)

pmids = deduplicate_keep_order(all_pmids)

เมตาเดต้า = ncbi_esummary(pmids)

abstracts = ncbi_efetch_abstract(pmids)

records = merge_metadata_and_abstracts(metadata, abstracts)

records = tag_evidence(records, user_question)

records = rank_records(records)

เลือก = เลือกบันทึกยอดนิยม (บันทึก)

หากต้องการข้อความเต็ม:

สำหรับบันทึกใน selected_key_records:

pmcid = idconv_pmid_to_pmcid(record.pmid)

ถ้า pmcid:

record.fulltext = fetch_bioc_or_pmc_xml(pmcid)

สำหรับบันทึกในรายการที่เลือก:

journal_query = record.full_journal_name หรือ record.journal_abbrev

if_result = lookup_if_public_iikx(journal_query)

หากผลลัพธ์มีความมั่นใจ:

record.if_annotation = f'*{IF＝{if_result.if_value}，{if_result.quartile}｝*'

elif if_result.ambiguous:

record.if_annotation = '*{IF＝รอการตรวจสอบ}*'

อื่น:

record.if_annotation = '*{IF＝ไม่พบ}*'

คำตอบ = แต่งคำตอบ(

บทสรุป

กลุ่มหลักฐาน

การอ้างอิงเนื้อหาที่คลิกได้

รายการอ้างอิงแบบเต็มพร้อมเงื่อนไข

)

```

9. แม่แบบการส่งมอบขั้นสุดท้ายที่แนะนำ

```มาร์คดาวน์

สรุปแล้ว:

...

ระดับของหลักฐาน:

หลักฐานโดยตรง:

- ……[[1. **วารสาร**, ปี]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)

หลักฐานทางอ้อม:

- …[[2. **วารสาร**, ปี]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)

ไม่พบหลักฐานโดยตรง:

- ……

สรุปกลไกการทำงาน:

1. ……

2. ……

ขอบเขตการค้นหา:

การค้นหาในรอบนี้ส่วนใหญ่ใช้ฐานข้อมูล PubMed, PMC, BioC และ bioRxiv โดยการคัดกรองเบื้องต้นพิจารณาจากเมตาเดต้าและบทคัดย่อ และมีเพียงเอกสารสำคัญเท่านั้นที่จะได้รับการตรวจสอบเนื้อหาฉบับเต็ม การระบุข้อมูลโดยใช้ IF นั้นอ้างอิงจากแหล่งข้อมูลที่เข้าถึงได้โดยสาธารณะ เอกสารที่ไม่สามารถจับคู่ได้อย่างมั่นใจจะถูกทำเครื่องหมายว่าอยู่ระหว่างการตรวจสอบหรือตรวจไม่พบ

รายชื่อเอกสารอ้างอิงฉบับสมบูรณ์:

1. Smith J และคณะ, **ชื่อวารสาร** (2021), [PMID: 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF＝X，Q1}*

2. Wang X และคณะ, **ชื่อวารสาร** (2022), [DOI: 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *{IF=ต้องตรวจสอบ}*

```