Recherche approfondie et fiable en bio/médecine

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Recherche approfondie et fiable en bio/médecine

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Why we love this skill

Cette compétence constitue un guide fiable pour la recherche biomédicale, garantissant des informations de recherche très précises et vérifiables grâce à des recherches structurées, un examen de la littérature en plusieurs étapes et des vérifications rigoureuses du facteur d'impact (FI).

Instructions

Ce processus repose sur trois piliers : premièrement, l’utilisation de plusieurs requêtes pour effectuer un premier tri reproductible dans les utilitaires électroniques PubMed/NCBI ; deuxièmement, l’utilisation de PMID pour la déduplication et l’évaluation des preuves dans les résumés ; seul un petit nombre de documents clés sont soumis à l’examen du texte intégral dans PMC/BioC ; les citations dans le texte doivent être cliquables ; les informations bibliographiques complètes doivent figurer à la fin de l’article ; le facteur d’impact (FI) ne peut être vérifié qu’avec prudence à partir de sources accessibles au public et ne peut être présumé présent dans le JCR ou les bases de données locales, ni être deviné, et les correspondances de faible confiance ne peuvent être considérées comme des résultats définitifs.

1. Prétraitement après qu'un utilisateur a initié une recherche

1.1 Tout d'abord, analysez la question de l'utilisateur.

Après réception de la question d'un utilisateur, celle-ci, formulée en langage naturel, est d'abord décomposée en éléments structurés.

Doit être identifié :

• Sujets de recherche : gènes, protéines, médicaments, canaux, types cellulaires, tissus, maladies et modèles.

• Systèmes biologiques : humains, souris, rats, poissons-zèbres, organoïdes, rétine, régions du cerveau, lignées cellulaires, etc.

• Types de relations : expression, régulation, fonction, mécanisme, phénotype, mort, survie, traitement, toxicité, développement, dégénérescence, etc.

• Exigences en matière de preuves : Sont-elles requises des preuves directes, des preuves mécanistiques, des preuves en texte intégral, des graphiques, des paramètres de dosage et des méthodes expérimentales ?

• Période : illimitée, les 5 dernières années, la dernière année, les développements les plus récents et la littérature classique.

• Types de résultats : réponse courte, littérature représentative, résumé de l’analyse, suggestions de conception expérimentale, tableau des preuves, schéma du mécanisme.

Exemple:

Problème utilisateur :

« Veuillez m'aider à trouver de la documentation relative à la mort des organoïdes rétiniens. »

Décomposition structurée (exemple) :

• Modèles de base : organoïde rétinien, organoïde de rétine, organoïde rétinien dérivé de hPSC, organoïde de la cupule optique.

• Phénotype : mort cellulaire, apoptose, dégénérescence, perte de survie, stress, nécrose.

• Cellules apparentées : photorécepteur, cône, bâtonnet, cellule ganglionnaire rétinienne, glie de Müller.

• Mécanismes potentiels : stress oxydatif, stress du réticulum endoplasmique, dysfonctionnement mitochondrial, hypoxie, inflammation, ferroptose, nécroptose.

• Objectifs de recherche de preuves : Prioriser les études originales qui observent directement la mort cellulaire/l'apoptose/la dégénérescence dans les organoïdes rétiniens humains ou animaux ; puis rechercher des publications sur les mécanismes indirects.

1.2 Principes de segmentation par mots clés (Exemple)

Ne vous contentez pas d'une seule requête de recherche. Préparez au moins trois catégories de termes pour chaque concept.

Catégorie 1 : Mots précis.

• organoïde rétinien

• organoïde rétinien humain

• Organoïde rétinien dérivé de hPSC

• Organoïde rétinien dérivé de cellules iPSC

La deuxième catégorie : les synonymes et les hyperonymes.

• organoïde de la cupule optique

• Culture rétinienne 3D

• rétine dérivée de cellules souches

• Différenciation rétinienne

• Modèle de tissu rétinien

La troisième catégorie : termes liés au mécanisme et au phénotype.

• apoptose

• mort cellulaire

• dégénérescence

• survie

• stresser

• stress oxydatif

• Stress des ER

• dysfonctionnement mitochondrial

• hypoxie

• nécroptose

• ferroptose

Si l'utilisateur spécifie le type de cellule, ajoutez :

• photorécepteur

• cône

• tige

• cellule ganglionnaire rétinienne

• Müller glia

• cellule bipolaire

• cellule amacrine

Si l'utilisateur précise l'espèce ou l'origine, ajoutez :

• humain

• souris

• rat

• poisson-zèbre

• cellules souches embryonnaires humaines

• iPSC

• cellules souches pluripotentes

1.3 Génération de requêtes de recherche hiérarchiques

Générez au moins 3 à 6 requêtes. Chaque requête correspond à un objectif de recherche.

Première étape : Collecte directe des preuves.

Utilisé pour trouver la littérature qui correspond directement au modèle et au phénotype cibles.

```text

("organoïde rétinien" OU "organoïde de la rétine" OU "organoïde rétinien humain") ET (apoptose OU "mort cellulaire" OU dégénérescence)

```

Deuxième couche : Récupération de modèle étendue.

Utilisé pour recenser les publications où l'auteur n'utilise pas le terme précis « organoïde rétinien », mais où celui-ci est en réalité pertinent.

```text

(« organoïde de la coupe optique » OU « culture rétinienne 3D » OU « rétine dérivée de cellules souches ») ET (survie OU apoptose OU stress)

```

Troisième niveau : Recherche spécifique au mécanisme.

Utilisé pour vérifier des voies ou des mécanismes spécifiques.

```text

(« organoïde rétinien » OU « organoïde de la rétine ») ET (« stress oxydatif » OU « stress du RE » OU hypoxie OU mitochondries)

```

Quatrième niveau : Recherche spécifique au type cellulaire.

```text

(« organoïde rétinien » OU « organoïde de la rétine ») ET (photorécepteur OU cône OU bâtonnet OU « cellule ganglionnaire rétinienne ») ET (mort OU apoptose OU dégénérescence)

```

Cinquième niveau : Récupération du modèle de maladie.

```text

(« organoïde rétinien » OU « organoïde de la rétine ») ET (maladie OU dégénérescence OU dystrophie OU rétinite OU glaucome)

```

Sixième niveau : Examen/Recherche de renseignements.

```text

("organoïde rétinien" OU "organoïde de la rétine") ET (revue OU protocole OU modèle)

```

リサーチ

2. Quelles méthodes et quels sites web ont été utilisés pour la recherche ?

2.1 Outils préférés : PubMed / NCBI E-utilities

PubMed est l'outil privilégié pour la recherche de littérature biomédicale. Évitez d'utiliser systématiquement l'extraction de données des pages PubMed. Privilégiez plutôt l'API NCBI E-utilities.

2.1.1 ESearch : Récupération du PMID à l’aide d’une requête

interface:

```text

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi

```

paramètre:

```text

db=publié

terme=

retmode=json

retmax=20

trier=pertinence

```

Vous pouvez également trier par date :

```text

trier=publication+date

```

Exemple:

```text

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pubmed&term=(%22retinal%20organoid%22%20OR%20%22retina%20organoid%22)%20AND%20(apoptosis%20OR%20%22cell%20death%22)&retmode=json&retmax=20&sort=relevance

```

Lisez le texte de retour :

```text

esearchresult.idlist

```

Voici la liste des PMID.

2.1.2 ESummary : Obtention des métadonnées de la littérature

interface:

```text

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi

```

paramètre:

```text

db=publié

id=PMID1,PMID2,PMID3

retmode=json

```

Champs extraits :

• PMID

• titre

• nom complet du journal

• abréviation de la source/de la revue

• date de publication

• auteurs

• DOI et PMCID dans les identifiants d'article

• volume, numéro, pages

2.1.3 EFetch : Récupération du résumé et des détails XML

interface:

```text

https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi

```

paramètre:

```text

db=publié

id=PMID1,PMID2

retmode=xml

rettype=abstrait

```

Champs extraits :

• Titre de l'article

• Texte abstrait

• Titre de la revue

• Abréviation ISO

• ISSN / eISSN

• Date de publication

• DOI

• PMCID

• Termes MeSH

2.1.4 Stratégie de récupération par lots

Processus recommandé :

1. Appelez ESearch pour chaque requête.

2. Pour chaque requête, sélectionnez les 5 à 20 premiers résultats.

3. Fusionner tous les PMID.

4. Utilisez PMID pour supprimer les doublons.

5. Utilisez ESummary / EFetch pour récupérer les métadonnées et les données abstraites par lots.

6. Lors de la phase de sélection initiale, ne lisez que les métadonnées et le résumé ; ne commencez pas par lire le texte intégral.

────────────────

2.2 Deuxième phase : Examen complet des documents PMC/BioC

Le texte intégral ne sera inclus que dans les cas suivants :

• Les utilisateurs demandent à lire attentivement le texte intégral.

• Le résumé est insuffisant pour déterminer le mécanisme.

• Nécessite des graphiques, des méthodes expérimentales, des concentrations, des dosages, IC50, EC50, Kd et Ki.

• Un petit nombre de PMID clés ont été identifiés et nécessitent un examen au cas par cas.

2.2.1 PMID vers PMCID

interface:

```text

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/utils/idconv/v1.0/?ids=&format=json

```

Si le PMCID est renvoyé, cela signifie que le PMC peut avoir un accès au texte intégral.

2.2.2 Prioriser le JSON BioC

interface:

```text

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/bionlp/RESTful/pmcoa.cgi/BioC_json//unicode

```

Avantages : Très structuré, convient à l'extraction des principaux paragraphes du texte.

2.2.3 Essayez PMC XML lorsque BioC n'est pas disponible

interface:

```text

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles//?report=xml

```

Ignorer lors de l'extraction du texte principal :

• références

• bibliographie

• Remerciements

• Contributions des auteurs

• intérêts concurrents

L'examen du texte intégral doit inclure un critère d'arrêt :

• Chaque document n'est scanné qu'une seule fois.

• Par défaut, seuls les paragraphes relatifs à la question sont extraits.

• Si le champ cible ne correspond pas, indiquez « Aucune preuve directe trouvée ».

• Évitez de récupérer des mots-clés de manière répétée.

────────────────

2.3 bioRxiv / medRxiv

Utilisé pour compléter les prépublications les plus récentes.

Vous pouvez utiliser l'API officielle :

```text

https://api.biorxiv.org/details/biorxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD

https://api.biorxiv.org/details/medrxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD

```

Vous pouvez également utiliser une recherche classique en complément :

```text

site:biorxiv.org apoptose des organoïdes rétiniens

site:medrxiv.org dégénérescence des organoïdes rétiniens

```

Les prépublications doivent être étiquetées :

```text

Il s'agit d'une prépublication qui n'a pas encore été évaluée par des pairs.

```

────────────────

2.4 Crossref/OpenAlex/Unpaywall

Utilisé pour compléter le DOI, l'adresse d'accès au texte intégral et les informations de publication.

Crossref :

```text

https://api.crossref.org/works?query.title=</p><p> ```</p><p> OpenAlex :</p><p> ```text</p><p> https://api.openalex.org/works?search=<titre ou sujet></p><p> ```</p><p> Dépaywall :</p><p> ```text</p><p> https://api.unpaywall.org/v2/<DOI>?email=<votre_email></p><p> ```</p><p> utiliser:</p><p> • Achèvement du DOI.</p><p> • Recherche de liens PDF OA.</p><p> • Vérification du nom du journal.</p><p> • Vérification de l'année de publication.</p><p> ────────────────</p><p> 2.5 Page de l'éditeur</p><p> N'accédez à la page de l'éditeur que lorsque les informations de l'API sont insuffisantes.</p><p> Règles d'accès :</p><p> • Chaque URL d'éditeur ne sera testée qu'une seule fois.</p><p> • Si vous rencontrez des CAPTCHA, des barrières de connexion, des messages Cloudflare, d'accès refusé ou des barrières d'accès institutionnelles, arrêtez immédiatement.</p><p> • Évitez d’actualiser sans cesse, de changer de chemin d’accès au sein du même site ou de rester bloqué dans une boucle.</p><p> • Utilisez les métadonnées PubMed, PMC, Crossref, OpenAlex, Unpaywall et DOI comme solution de repli.</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-microscope" aria-hidden="true"><path d="M6 18h8"></path><path d="M3 22h18"></path><path d="M14 22a7 7 0 1 0 0-14h-1"></path><path d="M9 14h2"></path><path d="M9 12a2 2 0 0 1-2-2V6h6v4a2 2 0 0 1-2 2Z"></path><path d="M12 6V3a1 1 0 0 0-1-1H9a1 1 0 0 0-1 1v3"></path></svg>リサーチ</div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>3. Comment organiser les informations après leur récupération</p><p> 3.1 Établir une structure d'enregistrement unifiée</p><p> Chaque document est compilé dans un enregistrement unifié.</p><p> Champs :</p><p> ```text</p><p> PMID</p><p> doi</p><p> pmcid</p><p> titre</p><p> auteurs</p><p> journal</p><p> abréviation du journal</p><p> ISSN</p><p> eissn</p><p> année</p><p> abstrait</p><p> source de requête</p><p> niveau de preuve</p><p> balises de preuve</p><p> type_de_papier</p><p> URL</p><p> ```</p><p> 3.2 Déduplication</p><p> Priorité:</p><p> 1. Déduplication PMID.</p><p> 2. Utilisez le DOI pour supprimer les doublons si le PMID n'est pas disponible.</p><p> 3. S'il n'y a pas de DOI, utilisez lower(title) + année + premier_auteur pour supprimer les doublons.</p><p> Conservez la source de requête qui a été utilisée la première fois et enregistrez les requêtes qui ont accédé au document.</p><p> 3.3 Classification des preuves</p><p> Il est nécessaire de distinguer :</p><p> Preuve directe :</p><p> L’espèce cible, le tissu, le type cellulaire, le modèle et les conditions de traitement sont parfaitement alignés.</p><p> Preuves indirectes :</p><p> Les systèmes adjacents, les modèles similaires et les mécanismes similaires sont pris en charge, mais il ne s'agit pas de systèmes destinés directement à résoudre les problèmes des utilisateurs.</p><p> Aucune preuve directe n'a été trouvée :</p><p> On ne trouve que des informations générales, des spéculations, des analyses ou des modèles connexes ; il n'existe aucun résultat expérimental direct.</p><p> 3.4 Étiquetage des types de documents</p><p> Il convient au moins de noter les points suivants :</p><p> • recherche originale</p><p> • revoir</p><p> • protocole</p><p> • prépublication</p><p> • ensemble de données/ressource</p><p> • étude clinique</p><p> • document de méthodologie</p><p> 3.5 Règles de tri</p><p> Tri recommandé :</p><p> 1. Recherche originale fondée sur des preuves directes.</p><p> 2. Recherche sur les mécanismes clés.</p><p> 3. Dernières recherches importantes.</p><p> 4. Études fondamentales classiques.</p><p> 5. Avis de haute qualité.</p><p> 6. Preuve indirecte.</p><p> Ne triez pas uniquement selon le facteur d'impact. Le facteur d'impact est un indicateur au niveau de la revue et ne reflète pas la qualité d'un article individuel.</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-pen-tool" aria-hidden="true"><path d="M15.707 21.293a1 1 0 0 1-1.414 0l-1.586-1.586a1 1 0 0 1 0-1.414l5.586-5.586a1 1 0 0 1 1.414 0l1.586 1.586a1 1 0 0 1 0 1.414z"></path><path d="m18 13-1.375-6.874a1 1 0 0 0-.746-.776L3.235 2.028a1 1 0 0 0-1.207 1.207L5.35 15.879a1 1 0 0 0 .776.746L13 18"></path><path d="m2.3 2.3 7.286 7.286"></path><circle cx="11" cy="11" r="2"></circle></svg>書く</div><div class="flex h-[32px] items-center gap-1 px-2 rounded-[20px] min-w-0 max-md:w-[32px] max-md:justify-center max-md:px-0" type="button" aria-haspopup="dialog" aria-expanded="false" aria-controls="radix-_R_mec9inpfivabtkqivb_" data-state="closed" disabled=""><div class="flex-shrink-0"><div class="overflow-hidden bg-cover bg-center bg-no-repeat" style="background-image:url(https://cdn.gooo.ai/assets/select_model_claude.png);width:16px;height:16px;border-radius:8px" role="img" aria-label="Claude Sonnet 4.5"></div></div><span class="text-sm font-normal px-[1px] truncate min-w-0 text-foreground max-md:hidden">Claude Sonnet 4.5</span></div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>4. Comment organiser les citations dans une réponse</p><p> 4.1 Format de citation du texte</p><p> Toutes les citations textuelles doivent être cliquables.</p><p> Format:</p><p> ```markdown</p><p> [[1. **Journal**, Année]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)</p><p> ```</p><p> Exemple:</p><p> ```markdown</p><p> Des études antérieures ont observé un stress et une dégénérescence des photorécepteurs liés au stade de développement dans les organoïdes rétiniens humains [[1. **Cell Stem Cell**, 2019]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/xxxxxxx/).</p><p> ```</p><p> Ne l'écrivez pas comme ceci :</p><p> ```text</p><p> [1]</p><p> (PMID : xxxxx)</p><p> Voir la référence 1</p><p> ```</p><p> 4.2 Structure de réponse recommandée</p><p> Premier paragraphe : Conclusion directe.</p><p> ```text</p><p> Conclusion : Des rapports pertinents ont été publiés, mais les preuves directes portent principalement sur… ; les preuves directes concernant… font encore défaut.</p><p> ```</p><p> Deuxième paragraphe : Classification des preuves.</p><p> ```text</p><p> Preuve directe :</p><p> - Référence A : ...</p><p></p><p> Preuves indirectes :</p><p> - Référence B : ...</p><p></p><p> Aucune preuve directe n'a été trouvée :</p><p> - Non trouvé lors de cette session...</p><p> ```</p><p> Troisième paragraphe : Résumé du mécanisme.</p><p> Regrouper par sujet, par exemple :</p><p> • voie d'apoptose/caspase</p><p> • stress oxydatif</p><p> • dysfonctionnement mitochondrial</p><p> • Stress des ER</p><p> • hypoxie/stress métabolique</p><p> • inflammation</p><p> • inadéquation du développement</p><p> Quatrième paragraphe : Lacune en matière de recherche.</p><p> Indiquez clairement les points qui manquent de preuves directes.</p><p> Cinquième paragraphe : Inspiration tirée de l'expérience.</p><p> Si l'utilisateur a besoin d'un plan expérimental, veuillez fournir le marqueur, le dosage, le point temporel et le contrôle.</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-pen-tool" aria-hidden="true"><path d="M15.707 21.293a1 1 0 0 1-1.414 0l-1.586-1.586a1 1 0 0 1 0-1.414l5.586-5.586a1 1 0 0 1 1.414 0l1.586 1.586a1 1 0 0 1 0 1.414z"></path><path d="m18 13-1.375-6.874a1 1 0 0 0-.746-.776L3.235 2.028a1 1 0 0 0-1.207 1.207L5.35 15.879a1 1 0 0 0 .776.746L13 18"></path><path d="m2.3 2.3 7.286 7.286"></path><circle cx="11" cy="11" r="2"></circle></svg>書く</div><div class="flex h-[32px] items-center gap-1 px-2 rounded-[20px] min-w-0 max-md:w-[32px] max-md:justify-center max-md:px-0" type="button" aria-haspopup="dialog" aria-expanded="false" aria-controls="radix-_R_mic9inpfivabtkqivb_" data-state="closed" disabled=""><div class="flex-shrink-0"><div class="overflow-hidden bg-cover bg-center bg-no-repeat" style="background-image:url(https://cdn.gooo.ai/assets/select_model_claude.png);width:16px;height:16px;border-radius:8px" role="img" aria-label="Claude Sonnet 4.5"></div></div><span class="text-sm font-normal px-[1px] truncate min-w-0 text-foreground max-md:hidden">Claude Sonnet 4.5</span></div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>5. Liste complète des références à la fin de l'article</p><p> Si une référence spécifique est citée dans le texte, une liste complète doit être jointe à la fin de l'article.</p><p> Format:</p><p> ```markdown</p><p> ## Liste complète des informations de référence</p><p></p><p> 1. Smith J et al., **Nom du journal** (2021), [PMID : 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF＝X，Qn}*</p><p> 2. Wang X et al., **Nom de la revue** (2022), [DOI : 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *{IF=À vérifier}*</p><p> ```</p><p> Format de l'auteur :</p><p> • 1 à 3 auteurs : Veuillez tous les énumérer.</p><p> • Plus de 3 auteurs : Premier auteur et al.</p><p> Le PMID / DOI / URL doit être cliquable.</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-microscope" aria-hidden="true"><path d="M6 18h8"></path><path d="M3 22h18"></path><path d="M14 22a7 7 0 1 0 0-14h-1"></path><path d="M9 14h2"></path><path d="M9 12a2 2 0 0 1-2-2V6h6v4a2 2 0 0 1-2 2Z"></path><path d="M12 6V3a1 1 0 0 0-1-1H9a1 1 0 0 0-1 1v3"></path></svg>リサーチ</div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>6. Vérification et étiquetage du FI</p><p> 6.1 Tout d’abord, expliquons les limites pratiques des contrôles IF.</p><p> Normalement, le facteur d'impact officiel d'une revue est fourni par Clarivate Journal Citation Reports (JCR). Cependant, les organismes externes ne disposent généralement pas de compte Clarivate/JCR ni d'une table JCR locale ; il est donc déconseillé de le vérifier par cette voie.</p><p> ```</p><p> 6.2 Méthodes pratiques d'utilisation des compétences en intelligence artificielle</p><p> Route principale :</p><p> 1. Si l'entrée est un PMID, utilisez d'abord les utilitaires électroniques du NCBI pour obtenir les métadonnées PubMed.</p><p> - Récupérer le nom complet de la revue. - Récupérer la source/l'abréviation ISO. - Récupérer l'ISSN/eISSN. - Récupérer les champs auxiliaires tels que le titre, l'année et le DOI.</p><p> 2. Utilisez l'interface JSON mobile iikx/iscience, accessible au public, pour interroger les revues.</p><p> API de recherche :</p><p> ```text</p><p> https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci&c=index&a=info&keyword=<journal_query></p><p> ```</p><p> API de détails :</p><p> ```text</p><p> https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail&id=<id>&classid=<classid></p><p> ```</p><p> 3. Effectuer une correspondance prudente sur les résultats de la recherche.</p><p> - Priorise les correspondances exactes avec les titres normalisés des revues. - Priorise ensuite les correspondances exactes avec les abréviations. - Fait preuve d'une grande prudence avec les termes courts et généraux. - N'accepte pas les erreurs manifestes de correspondance avec des sous-chaînes, comme la confusion entre « Nature » et la série « Nature Reviews ». - Renvoie des résultats ambigus ou introuvables si la correspondance est instable, plutôt que de tenter une estimation.</p><p> 4. Si PubMed fournit une abréviation, essayez de la développer en nom complet ou en titre alternatif à l'aide du catalogue NLM.</p><p> L'interface de recherche du catalogue NLM reste NCBI E-utilities :</p><p> ```text</p><p> https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog&term=<abbr>[Abréviation du titre]&retmode=xml&retmax=1</p><p> ```</p><p> Utilisez ensuite ESummary pour obtenir le titre / le titre alternatif.</p><p> 5. Lisez les résultats détaillés de iikx :</p><p> - Facteur d'impact. - Année IF. - Quartile JCR. - Quartile CAS/CAS, le cas échéant. - URL source. - Niveau de confiance de la correspondance.</p><p> 6. N’incluez pas l’année IF dans le texte principal lors de l’annotation ; utilisez des annotations concises.</p><p> La dernière annotation devrait simplement indiquer :</p><p> ```text</p><p> *{SI＝X，Qn}*</p><p> ```</p><p> En cas d'échec :</p><p> ```text</p><p> *{IF=Vérification en attente}*</p><p> ```</p><p> ou:</p><p> ```text</p><p> *{IF=Non détecté}*</p><p> ```</p><p> 6.3 Étapes spécifiques</p><p> Effectuez la procédure suivante pour chaque document.</p><p> Étape 1 : Préparer le nom de la recherche dans la revue.</p><p> Prioriser la récupération des métadonnées PubMed :</p><p> ```text</p><p> Nom complet du journal</p><p> Abréviation ISO / Source</p><p> ISSN</p><p> eISSN</p><p> ```</p><p> Si seul un DOI est disponible, utilisez d'abord Crossref ou OpenAlex pour obtenir le nom de la revue.</p><p> Crossref :</p><p> ```text</p><p> https://api.crossref.org/works/<DOI></p><p> ```</p><p> OpenAlex :</p><p> ```text</p><p> https://api.openalex.org/works/https://doi.org/<DOI></p><p> ```</p><p> Étape 2 : Normaliser les noms des revues.</p><p> Règles de normalisation :</p><p> • Tout en minuscules.</p><p> • Décompression HTML.</p><p> • Remplacez & par et.</p><p> • Supprimez la ponctuation.</p><p> • Combiner plusieurs espaces.</p><p> • Pour faire des comparaisons, vous pouvez également utiliser la forme compacte, qui supprime tous les espaces.</p><p> Exemple de pseudocode :</p><p> Python</p><p> importer re, html</p><p></p><p> def norm(s) :</p><p> s = html.unescape(s ou '').lower()</p><p> s = re.sub(r'&', ' et ', s)</p><p> s = re.sub(r'[^a-z0-9]+', ' ', s)</p><p> retourner re.sub(r'\s+', ' ', s).strip()</p><p></p><p> def compact(s) :</p><p> retourner norm(s).replace(' ', '')</p><p> ```</p><p> Étape 3 : Interroger l'interface de recherche iikx.</p><p> ```text</p><p> https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci&c=index&a=info&keyword=<journal_query></p><p> ```</p><p> Il est recommandé de définir un User-Agent, par exemple :</p><p> ```text</p><p> Mozilla/5.0</p><p> ```</p><p> Si aucune correspondance exacte n'est trouvée sur la première page, vous pouvez feuilleter un nombre limité de pages, par exemple, jusqu'à 8 pages.</p><p> Les paramètres de changement de page sont généralement les suivants :</p><p> ```text</p><p> page=2</p><p> page=3</p><p> ```</p><p> Étape 4 : Sélectionner les candidats parmi les résultats de la recherche.</p><p> Les domaines candidats comprennent généralement :</p><p> ```text</p><p> identifiant</p><p> classifié</p><p> titre</p><p> petit titre</p><p> SI ou SI2024</p><p> zky2020</p><p> URL</p><p> ```</p><p> Règles de correspondance :</p><p> • Si compact(query) == compact(candidate.title), accepter.</p><p> • Si norm(query) == norm(candidate.title), accepter.</p><p> • Si compact(query) == compact(candidate.smalltitle), accepter.</p><p> • Si norm(query) == norm(candidate.smalltitle), accepter.</p><p> • N’acceptez pas une sous-chaîne à moins que la requête ne soit suffisamment longue et non ambiguë.</p><p> • Soyez particulièrement prudent avec les mots courts tels que Nature, Science, Cellule, Cerveau, Vision et Rétine.</p><p> Étape 5 : Si aucune correspondance n’est trouvée, utilisez l’abréviation étendue du catalogue NLM.</p><p> Par exemple, dans PubMed, la source est :</p><p> ```text</p><p> Biol Médicament des radicaux libres</p><p> ```</p><p> Vous pouvez vérifier :</p><p> ```text</p><p> https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog&term=Free%20Radic%20Biol%20Med%5BTitle%20Abbreviation%5D&retmode=xml&retmax=1</p><p> ```</p><p> Après avoir obtenu l'identifiant du catalogue NLM, utilisez-le comme suit :</p><p> ```text</p><p> https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi?db=nlmcatalog&id=<id>&retmode=xml</p><p> ```</p><p> Lire:</p><p> ```text</p><p> Titre</p><p> Titre alternatif</p><p> ```</p><p> Utilisez ensuite ces noms complets pour rechercher iikx.</p><p> Étape 6 : Vérifiez l'interface des détails iikx.</p><p> Si les résultats de la recherche contiennent :</p><p> ```text</p><p> id=<id></p><p> classid=<classid></p><p> ```</p><p> Appel:</p><p> ```text</p><p> https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail&id=<id>&classid=<classid></p><p> ```</p><p> Lire les détails :</p><p> ```text</p><p> IF2024, IF2023, IF2022…</p><p> SI</p><p> zky2020 ou autres champs de quartile JCR</p><p> jcr22 / jcr12 ou champ de partition</p><p> ISSN</p><p> eissn</p><p> titre</p><p> petit titre</p><p> catégorie</p><p> ```</p><p> Étape 7 : Sélectionnez la dernière instruction IF.</p><p> Recherchez dans les champs renvoyés toutes les occurrences du formulaire :</p><p> ```text</p><p> IF20xx</p><p> ```</p><p> Par exemple:</p><p> ```text</p><p> IF2024</p><p> IF2023</p><p> IF2022</p><p> ```</p><p> Choisissez l'année avec le plus grand chiffre significatif.</p><p> Si IF20xx est absent, essayez de lire :</p><p> ```text</p><p> SI</p><p> valeur_si</p><p> ```</p><p> Si aucune valeur valide n'est trouvée, elle est marquée comme non détectée.</p><p> Étape 8 : Afficher le niveau de confiance et l'étiquette.</p><p> Si le titre/l'abréviation correspond exactement et que les détails renvoient un IF valide :</p><p> ```text</p><p> *{SI＝X，Qn}*</p><p> ```</p><p> Si le match est incertain :</p><p> ```text</p><p> *{IF=Vérification en attente}*</p><p> ```</p><p> Si l'API publique ne renvoie aucun résultat :</p><p> ```text</p><p> *{IF=Non détecté}*</p><p> ```</p><p> 6.4 Format d'annotation IF</p><p> Format fixe :</p><p> ```text</p><p> *{SI＝X，Qn}*</p><p> ```</p><p> Exemple:</p><p> ```markdown</p><p> Smith J et al., **Neuron** (2020), [PMID : 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF = 15,0, Q1}*</p><p> ```</p><p> Avis:</p><p> • L’année JCR n’est pas inscrite dans l’annotation IF.</p><p> • N’écrivez pas « 2024 JCR IF ».</p><p> • N’écrivez pas « JCR 2024 ».</p><p> • Seule l'année de publication est conservée.</p><p> • Si la valeur IF est 0,0, nulle, a une source instable ou une correspondance instable, le nombre ne sera pas affiché.</p><p> 6.5 Gestion standard des échecs de vérification IF</p><p> Ne devinez pas.</p><p> N’utilisez pas le nom de la revue pour renseigner les numéros.</p><p> N’utilisez pas de grands modèles pour mémoriser et remplir des instructions IF.</p><p> Seuls trois états sont autorisés en cas d'échec :</p><p> ```text</p><p> *{IF=Vérification en attente}*</p><p> ```</p><p> Utilisé pour :</p><p> • Les résultats de la recherche sont vagues.</p><p> Il existe plusieurs revues similaires.</p><p> • Seule l'abréviation a été trouvée, mais le nom complet n'a pas pu être confirmé.</p><p> • Le facteur d'impact (FI) fourni par les sources publiques est discutable.</p><p> ```text</p><p> *{IF=Non détecté}*</p><p> ```</p><p> Utilisé pour :</p><p> • L'interface publique n'a renvoyé aucun résultat.</p><p> • La revue n'est pas indexée dans SCI/JCR.</p><p> • Ce nouveau numéro n'a pas encore de condition suspensive.</p><p> ```text</p><p> *{IF=Non vérifiable publiquement}*</p><p> ```</p><p> Utilisé pour :</p><p> • L’utilisateur a besoin d’un JCR officiel, mais l’agent actuel ne dispose pas des autorisations Clarivate/JCR.</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-microscope" aria-hidden="true"><path d="M6 18h8"></path><path d="M3 22h18"></path><path d="M14 22a7 7 0 1 0 0-14h-1"></path><path d="M9 14h2"></path><path d="M9 12a2 2 0 0 1-2-2V6h6v4a2 2 0 0 1-2 2Z"></path><path d="M12 6V3a1 1 0 0 0-1-1H9a1 1 0 0 0-1 1v3"></path></svg>リサーチ</div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>7. Liste d'auto-vérification finale</p><p> À vérifier avant l'expédition :</p><p> • Faut-il répondre d'abord aux questions essentielles de l'utilisateur ?</p><p> • Faut-il faire une distinction entre preuves directes, preuves indirectes et absence de preuves directes ?</p><p> • Toutes les citations textuelles sont-elles cliquables ?</p><p> • L’article comporte-t-il une liste complète des références à la fin ?</p><p> • Chaque document comporte-t-il une étiquette IF (Entrée/Sortie) ou une étiquette indiquant une vérification en attente/non détectée ?</p><p> • Si le PMID/DOI/URL est cliquable.</p><p> • Permet-elle d'éviter de substituer des résultats globaux sur les tissus à des conclusions concernant des types cellulaires spécifiques ?</p><p> • Cela permet-il d'éviter de substituer l'activation/phosphorylation à une augmentation de l'expression totale ?</p><p> • Faut-il indiquer qu'il s'agit d'une prépublication ?</p><p> • Spécifie-t-il les limites de la recherche ?</p><p> • SI ce n'était pas basé sur la mémoire ou la conjecture.</p></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>8. Pseudocode reproductible</p><p> Python</p><p> requêtes = construire_requêtes(question_utilisateur)</p><p></p><p> tous_pmids = []</p><p> pour la requête dans les requêtes :</p><p> pmids = ncbi_esearch(query, retmax=20, sort='relevance')</p><p> all_pmids.extend(pmids)</p><p></p><p> pmids = deduplicate_keep_order(all_pmids)</p><p></p><p> métadonnées = ncbi_esummary(pmids)</p><p> résumés = ncbi_efetch_abstract(pmids)</p><p></p><p> enregistrements = fusionner_métadonnées_et_résumés(métadonnées, résumés)</p><p> enregistrements = étiquette_preuve(enregistrements, question_utilisateur)</p><p> enregistrements = rang_enregistrements(enregistrements)</p><p> sélectionné = sélectionner_meilleurs_enregistrements(enregistrements)</p><p></p><p> si besoin_texte_complet :</p><p> pour chaque enregistrement dans selected_key_records :</p><p> pmcid = idconv_pmid_to_pmcid(record.pmid)</p><p> si pmcid :</p><p> enregistrement.fulltext = fetch_bioc_or_pmc_xml(pmcid)</p><p></p><p> Pour enregistrer dans la sélection :</p><p> journal_query = record.full_journal_name ou record.journal_abbrev</p><p> si_résultat = lookup_if_public_iikx(requête_journal)</p><p> si_résultat.confiant :</p><p> record.if_annotation = f'*{IF＝{if_result.if_value}，{if_result.quartile}｝*'</p><p> elif if_result.ambiguous:</p><p> record.if_annotation = '*{IF＝Vérification en attente}*'</p><p> autre:</p><p> record.if_annotation = '*{IF＝Non détecté}*'</p><p></p><p> réponse = composer_réponse(</p><p> conclusion</p><p> groupes de preuves,</p><p> citations cliquables_corps,</p><p> liste_de_référence_complète_avec_si</p><p> )</p><p> ```</p></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>9. Modèle de livraison finale recommandé</p><p> ```markdown</p><p> en conclusion:</p><p> ...</p><p></p><p> Niveau de preuve :</p><p></p><p> Preuve directe :</p><p> - ……[[1. **Journal**, Année]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)</p><p></p><p> Preuves indirectes :</p><p> - …[[2. **Journal**, Année]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)</p><p></p><p> Aucune preuve directe n'a été trouvée :</p><p> - ……</p><p></p><p> Résumé du mécanisme :</p><p> 1. ……</p><p> 2. ……</p><p></p><p> Limites de recherche :</p><p> Cette série de recherches a principalement porté sur PubMed, PMC, BioC et bioRxiv ; la sélection initiale s’est basée sur les métadonnées et les résumés, seuls les documents clés faisant l’objet d’une analyse du texte intégral. Les annotations d’impact ont été établies à partir de sources accessibles au public ; les documents pour lesquels une correspondance avec certitude n’a pu être établie ont été marqués comme étant en attente de vérification ou non détectés.</p><p></p><p> Liste complète des informations bibliographiques :</p><p> 1. Smith J et al., **Nom du journal** (2021), [PMID : 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF＝X，Q1}*</p><p> 2. Wang X et al., **Nom de la revue** (2022), [DOI : 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *{IF=À vérifier}*</p><p> ```</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-pen-tool" aria-hidden="true"><path d="M15.707 21.293a1 1 0 0 1-1.414 0l-1.586-1.586a1 1 0 0 1 0-1.414l5.586-5.586a1 1 0 0 1 1.414 0l1.586 1.586a1 1 0 0 1 0 1.414z"></path><path d="m18 13-1.375-6.874a1 1 0 0 0-.746-.776L3.235 2.028a1 1 0 0 0-1.207 1.207L5.35 15.879a1 1 0 0 0 .776.746L13 18"></path><path d="m2.3 2.3 7.286 7.286"></path><circle cx="11" cy="11" r="2"></circle></svg>書く</div><div class="flex h-[32px] items-center gap-1 px-2 rounded-[20px] min-w-0 max-md:w-[32px] max-md:justify-center max-md:px-0" type="button" aria-haspopup="dialog" aria-expanded="false" aria-controls="radix-_R_n6c9inpfivabtkqivb_" data-state="closed" disabled=""><div class="flex-shrink-0"><div class="overflow-hidden bg-cover bg-center bg-no-repeat" style="background-image:url(https://cdn.gooo.ai/assets/select_model_claude.png);width:16px;height:16px;border-radius:8px" role="img" aria-label="Claude Sonnet 4.5"></div></div><span class="text-sm font-normal px-[1px] truncate min-w-0 text-foreground max-md:hidden">Claude Sonnet 4.5</span></div></div></div></div></div><div class="flex flex-col gap-4 w-full"><p class="text-xl font-semibold leading-7 text-primary">description</p><p class="text-sm leading-5 text-secondary-fg whitespace-pre-wrap break-words">Scénarios d'application : Effectuer une recherche bibliographique complète en biologie/biomédecine et fournir aux utilisateurs des résultats détaillés et fiables. 1. Après le lancement d'une recherche par l'utilisateur, le système analyse la question et les mots-clés. 2. Rechercher des publications à partir de sources de données publiques et reproductibles. 3. Dédupliquer, stratifier, classer et trier les résultats de recherche. 4. Intégrer des citations cliquables dans la réponse. 5. Lister les informations bibliographiques complètes à la fin du document et indiquer le facteur d'impact (FI) avec les liens de recherche publics ; si une vérification avec un haut degré de confiance est impossible, la publication doit être marquée comme « à vérifier » ou « non détectée ».</p></div></div><div class="flex flex-col gap-5 px-[168px]"><div class="flex items-center justify-between gap-3"><h3 class="font-semibold text-primary text-2xl">Related Skills</h3><a class="inline-flex items-center gap-1 text-sm font-semibold text-secondary-fg transition-colors hover:text-primary" href="/skills/category/learn">View all<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-arrow-right size-4" aria-hidden="true"><path d="M5 12h14"></path><path d="m12 5 7 7-7 7"></path></svg></a></div><div class="grid grid-cols-[repeat(auto-fill,minmax(270px,1fr))] gap-5"><div class="group relative flex flex-col gap-3 pt-5 pb-4 px-5 rounded-xl border border-material-card-border overflow-hidden cursor-pointer transition-colors bg-material-card"><div class="flex h-12 items-center gap-4"><div class="relative size-10 overflow-hidden shrink-0 rounded-[10px]"><img src="https://cdn.gooo.ai/web-images/1c599e4ae9e505d5ef0587144f0c6cc076dcf9010a2c46506be9135717f2bb87" alt="Analyse en trois éléments : Comprendre le document" class="size-full object-cover"/></div><h3 class="text-base font-semibold leading-6 text-primary line-clamp-2 min-w-0 flex-1">Analyse en trois éléments : Comprendre le document</h3></div><p class="text-xs leading-[18px] text-caption-fg line-clamp-3 h-[54px]">Utilisant une méthode de décomposition en trois étapes (identification des éléments clés, compréhension des boucles de raisonnement et maîtrise de la boucle d'argumentation globale), cet outil analyse automatiquement ou interactivement le cadre argumentatif de tout document. Il comprend 14 modèles d'invites IA intégrés, adaptés à tous les lecteurs universitaires.</p><div class="flex h-6 items-center gap-3"><div class="flex items-center gap-1 py-0.5 pr-1"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-user-round size-4 text-secondary-fg" aria-hidden="true"><circle cx="12" cy="8" r="5"></circle><path d="M20 21a8 8 0 0 0-16 0"></path></svg><span class="text-sm leading-5 text-secondary-fg">1</span></div></div></div><div class="group relative flex flex-col gap-3 pt-5 pb-4 px-5 rounded-xl border border-material-card-border overflow-hidden cursor-pointer transition-colors bg-material-card"><div class="flex h-12 items-center gap-4"><div class="relative size-10 overflow-hidden shrink-0 rounded-[10px]"><img src="https://cdn.gooo.ai/web-images/951c263fe03cfc65a1a35f6e0ed4aa832c9b819d03e6b0f3f3afb419be2ba60d" alt="Recherche bibliographique sur la méthode d'épluchage des oignons à l'envers" class="size-full object-cover"/></div><h3 class="text-base font-semibold leading-6 text-primary line-clamp-2 min-w-0 flex-1">Recherche bibliographique sur la méthode d'épluchage des oignons à l'envers</h3></div><p class="text-xs leading-[18px] text-caption-fg line-clamp-3 h-[54px]">Saisissez une expression-clé, et l'outil décompose automatiquement la structure du sujet selon la méthode de l'oignon → développe les synonymes → génère des requêtes de recherche à quatre niveaux (CNKI + WoS/Google Scholar) et fournit une liste d'exécution et une stratégie de filtrage. Applicables à toutes les disciplines, les requêtes de recherche peuvent être directement copiées-collées et utilisées. 🎯 Quels problèmes résout-il ? ❌ Saisie directe d'une phrase complète dans le champ de recherche → 0 résultat ❌ Recherche d'un seul mot-clé → 5000 résultats sans savoir par où commencer ❌ Ne pas savoir comment segmenter un sujet → Recherche sans orientation ✅ Saisie de « Anxiété scolaire de la classe moyenne et pratiques d'enseignement parallèle » → Plus de 30 requêtes de recherche directement utilisables + un thésaurus + une liste d'exécution par niveaux 📐 Méthode principale : La méthode de l'oignon se développe de l'intérieur vers l'extérieur, du plus étroit au plus large, en trois couches de profondeur croissante : la couche principale identifie précisément 4 articles de lecture essentiels, la couche d'expansion trouve 48 études directement liées et la couche panoramique établit une compréhension globale de la portée du domaine. 🔧 Les résultats comprennent : • Analyse des trois éléments de sélection du sujet (qualificatifs + unité de recherche + dimension de recherche) • 5 à 8 concepts associés pour chaque élément + comparaison chinois-anglais + concepts généraux/subordonnés • Premier niveau : 8 ensembles de formules de recherche par combinaison de trois éléments (titre → sujet, précis → général) • Deuxième niveau : 3 types de paires d’éléments (marquage des usages principaux/de fond) • Troisième niveau : Formule de recherche panoramique mono-élément • Quatrième niveau : Stratégie d’expansion des concepts généraux • 📋 Liste de contrôle d’exécution en six étapes + critères de sélection pour chaque niveau (articles fréquemment cités + articles de pointe) 👥 À qui s’adresse ce service ? Aux chercheurs débutants, aux étudiants de master et de doctorat, aux jeunes chercheurs – à toute personne souhaitant effectuer des recherches bibliographiques de manière systématique plutôt que de se fier à son intuition pour la recherche par mots-clés.</p><div class="flex h-6 items-center gap-3"><div class="flex items-center gap-1 py-0.5 pr-1"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-user-round size-4 text-secondary-fg" aria-hidden="true"><circle cx="12" cy="8" r="5"></circle><path d="M20 21a8 8 0 0 0-16 0"></path></svg><span class="text-sm leading-5 text-secondary-fg">1</span></div></div></div><div class="group relative flex flex-col gap-3 pt-5 pb-4 px-5 rounded-xl border border-material-card-border overflow-hidden cursor-pointer transition-colors bg-material-card"><div class="flex h-12 items-center gap-4"><div class="relative size-10 overflow-hidden shrink-0 rounded-[10px]"><img src="https://cdn.gooo.ai/web-images/7e758e98d4432be97cf48bea1a6bc163e8d876b076ef4a29f6a349b8e7bdb657" alt="stratégie d'investissement pour le démantèlement de chaînes et la détection des goulots d'étranglement" class="size-full object-cover"/></div><h3 class="text-base font-semibold leading-6 text-primary line-clamp-2 min-w-0 flex-1">stratégie d'investissement pour le démantèlement de chaînes et la détection des goulots d'étranglement</h3></div><p class="text-xs leading-[18px] text-caption-fg line-clamp-3 h-[54px]">Saisissez une tendance sectorielle et le système se connectera automatiquement à Internet pour analyser la chaîne d'approvisionnement, identifier les goulets d'étranglement physiques incontournables et mettre en évidence les entreprises qui en tirent réellement profit, ainsi que les mesures à contre-courant. L'objectif principal est de repérer les barrières physiques infranchissables lorsqu'une tendance prend de l'ampleur, plutôt que de suivre aveuglément les entreprises leaders.</p><div class="flex h-6 items-center gap-3"><div class="flex items-center gap-1 py-0.5 pr-1"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-user-round size-4 text-secondary-fg" aria-hidden="true"><circle cx="12" cy="8" r="5"></circle><path d="M20 21a8 8 0 0 0-16 0"></path></svg><span class="text-sm leading-5 text-secondary-fg">0</span></div></div></div></div></div></div><div class="flex md:hidden flex-col gap-5 w-full"><div class="flex items-center gap-4 px-5"><div class="relative size-14 shrink-0"><div class="relative size-full overflow-hidden bg-gray5 shadow-[0_1.658px_6.632px_0_rgba(2,4,26,0.07)] rounded-xl border border-subtle-border" style="background-image:linear-gradient(rgba(0,0,0,0.2), rgba(0,0,0,0.2)), url(https://cdn.gooo.ai/assets/skill-bg13-2.png);background-size:cover"><div class="absolute inset-0 flex items-center justify-center"><svg width="28" height="28" viewBox="0 0 24 24" fill="currentColor" xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" class="text-white" style="filter:drop-shadow(0 0 8.4px rgba(0, 0, 0, 0.20))"><g clip-path="url(#clip0_92_327)"><path fill-rule="evenodd" clip-rule="evenodd" d="M19.6757 14.6355C19.4792 14.6957 19.2627 14.7101 19.038 14.6651L17.3914 14.3358L16.5755 15.5038C16.1574 16.1022 15.3296 16.2413 14.739 15.8122L13.8726 15.1829L12.9903 16.3593C12.6193 16.854 11.952 17.0203 11.3922 16.7577L11.1252 16.6324L10.9522 17.4688C10.7978 18.2152 10.0392 18.6709 9.30773 18.4567L8.26116 18.1503L7.72946 19.232C7.71896 19.2533 7.70801 19.2743 7.69662 19.2947C7.88247 19.5117 8.1689 19.523 8.3166 19.4949C8.41437 19.4763 8.57038 19.4162 8.68809 19.2932C9.50745 19.4291 11.3719 19.7212 12.2879 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font-medium">李</span></span><span class="text-sm leading-5 font-medium text-foreground whitespace-nowrap truncate">李振龙</span></div></a></div><div class="flex items-center gap-2"><span class="text-sm leading-5 text-caption-fg whitespace-nowrap">installedBy</span><div class="flex items-center gap-[3.75px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="16" height="16" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-user-round shrink-0 text-foreground" aria-hidden="true"><circle cx="12" cy="8" r="5"></circle><path d="M20 21a8 8 0 0 0-16 0"></path></svg><span class="text-sm leading-5 font-medium text-foreground whitespace-nowrap">8</span></div></div><div class="flex items-center gap-2"><span class="text-sm leading-5 text-caption-fg whitespace-nowrap">categoryLabel</span><a class="hover:opacity-80 transition-opacity" href="/skills/category/learn"><span class="text-sm leading-5 font-medium text-foreground whitespace-nowrap">Apprendre</span></a></div><div class="flex items-center gap-2"><span class="text-sm leading-5 text-caption-fg whitespace-nowrap">from</span><span class="text-sm leading-5 font-medium text-foreground whitespace-nowrap">YouMind</span></div></div></div><div class="flex flex-col gap-4 px-4"><div><button type="button" class="relative shrink-0 overflow-hidden rounded-xl border border-new-border bg-muted h-60 w-full cursor-pointer"><img src="https://cdn.gooo.ai/web-images/a5f4973dccb5c12acd58034ffdea6d898802a4d4be1e9568bb3088c4f635cda2" alt="" class="absolute inset-0 size-full object-cover"/></button></div><div><button type="button" class="relative shrink-0 overflow-hidden rounded-xl border border-new-border bg-muted h-60 w-full cursor-pointer"><img src="https://cdn.gooo.ai/web-images/f697d3abe7d40284b9afc64c0ec008739ef2f24e668d3e36d7f7890b70206ad7" alt="" class="absolute inset-0 size-full object-cover"/></button></div></div><div class="px-5"><div class="relative overflow-hidden rounded-[28px] border border-black/[0.06] bg-card px-5 py-5"><div class="pointer-events-none absolute inset-0 bg-[radial-gradient(circle_at_top_left,rgba(191,219,254,0.1),transparent_28%),radial-gradient(circle_at_right_center,rgba(254,240,138,0.1),transparent_24%)] opacity-70"></div><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-quote pointer-events-none absolute bottom-5 right-5 size-12 text-black/[0.045] md:bottom-6 md:right-6 md:size-14" aria-hidden="true"><path d="M16 3a2 2 0 0 0-2 2v6a2 2 0 0 0 2 2 1 1 0 0 1 1 1v1a2 2 0 0 1-2 2 1 1 0 0 0-1 1v2a1 1 0 0 0 1 1 6 6 0 0 0 6-6V5a2 2 0 0 0-2-2z"></path><path d="M5 3a2 2 0 0 0-2 2v6a2 2 0 0 0 2 2 1 1 0 0 1 1 1v1a2 2 0 0 1-2 2 1 1 0 0 0-1 1v2a1 1 0 0 0 1 1 6 6 0 0 0 6-6V5a2 2 0 0 0-2-2z"></path></svg><div class="relative flex flex-col gap-4"><div class="flex justify-between gap-3 flex-col items-start"><div class="inline-flex w-fit items-center gap-2 rounded-full border border-sky-100 bg-sky-50 px-3 py-1"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-badge-check size-3.5 text-sky-600" aria-hidden="true"><path d="M3.85 8.62a4 4 0 0 1 4.78-4.77 4 4 0 0 1 6.74 0 4 4 0 0 1 4.78 4.78 4 4 0 0 1 0 6.74 4 4 0 0 1-4.77 4.78 4 4 0 0 1-6.75 0 4 4 0 0 1-4.78-4.77 4 4 0 0 1 0-6.76Z"></path><path d="m9 12 2 2 4-4"></path></svg><span class="text-xs font-semibold text-sky-700">Editor's Pick</span></div><a class="flex items-center gap-2.5 transition-opacity hover:opacity-80" href="/skills/bio/63edaf7c-2fec-49bd-9f2e-02f772e4a1d9"><span class="relative flex shrink-0 overflow-hidden rounded-full size-9 border border-white shadow-sm"><span class="flex h-full w-full items-center justify-center rounded-full bg-muted text-xs font-medium">Y</span></span><div class="min-w-0"><p class="text-[11px] font-semibold uppercase tracking-[0.08em] text-caption-fg">Featured by</p><p class="truncate text-sm font-semibold text-primary">YouMind</p></div></a></div><div class="flex flex-col gap-2"><p class="text-base font-semibold leading-6 text-primary">Why we love this skill</p><p class="text-sm italic leading-7 text-secondary-fg">Cette compétence constitue un guide fiable pour la recherche biomédicale, garantissant des informations de recherche très précises et vérifiables grâce à des recherches structurées, un examen de la littérature en plusieurs étapes et des vérifications rigoureuses du facteur d'impact (FI).</p></div></div></div></div><div class="flex flex-col gap-10 px-5"><div class="flex flex-col gap-4"><div class="flex items-center justify-between"><p class="text-xl font-semibold leading-7 text-primary">Instructions </p><button class="flex items-center gap-1 rounded-[20px] px-2.5 py-px "><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" width="14" height="14" class="shrink-0 text-caption-fg" viewBox="0 0 20 20" aria-hidden="true" fill="currentColor"><use xlink:href="#icon-translate"></use></svg><span class="text-xs leading-[18px] whitespace-nowrap text-caption-fg">showOriginal</span></button></div><div class="bg-snip-card rounded-3xl p-3 flex flex-col gap-2.5"><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>Ce processus repose sur trois piliers : premièrement, l’utilisation de plusieurs requêtes pour effectuer un premier tri reproductible dans les utilitaires électroniques PubMed/NCBI ; deuxièmement, l’utilisation de PMID pour la déduplication et l’évaluation des preuves dans les résumés ; seul un petit nombre de documents clés sont soumis à l’examen du texte intégral dans PMC/BioC ; les citations dans le texte doivent être cliquables ; les informations bibliographiques complètes doivent figurer à la fin de l’article ; le facteur d’impact (FI) ne peut être vérifié qu’avec prudence à partir de sources accessibles au public et ne peut être présumé présent dans le JCR ou les bases de données locales, ni être deviné, et les correspondances de faible confiance ne peuvent être considérées comme des résultats définitifs.</p><p></p><p> 1. Prétraitement après qu'un utilisateur a initié une recherche</p><p> 1.1 Tout d'abord, analysez la question de l'utilisateur.</p><p> Après réception de la question d'un utilisateur, celle-ci, formulée en langage naturel, est d'abord décomposée en éléments structurés.</p><p> Doit être identifié :</p><p> • Sujets de recherche : gènes, protéines, médicaments, canaux, types cellulaires, tissus, maladies et modèles.</p><p> • Systèmes biologiques : humains, souris, rats, poissons-zèbres, organoïdes, rétine, régions du cerveau, lignées cellulaires, etc.</p><p> • Types de relations : expression, régulation, fonction, mécanisme, phénotype, mort, survie, traitement, toxicité, développement, dégénérescence, etc.</p><p> • Exigences en matière de preuves : Sont-elles requises des preuves directes, des preuves mécanistiques, des preuves en texte intégral, des graphiques, des paramètres de dosage et des méthodes expérimentales ?</p><p> • Période : illimitée, les 5 dernières années, la dernière année, les développements les plus récents et la littérature classique.</p><p> • Types de résultats : réponse courte, littérature représentative, résumé de l’analyse, suggestions de conception expérimentale, tableau des preuves, schéma du mécanisme.</p><p> Exemple:</p><p> Problème utilisateur :</p><p> « Veuillez m'aider à trouver de la documentation relative à la mort des organoïdes rétiniens. »</p><p> Décomposition structurée (exemple) :</p><p> • Modèles de base : organoïde rétinien, organoïde de rétine, organoïde rétinien dérivé de hPSC, organoïde de la cupule optique.</p><p> • Phénotype : mort cellulaire, apoptose, dégénérescence, perte de survie, stress, nécrose.</p><p> • Cellules apparentées : photorécepteur, cône, bâtonnet, cellule ganglionnaire rétinienne, glie de Müller.</p><p> • Mécanismes potentiels : stress oxydatif, stress du réticulum endoplasmique, dysfonctionnement mitochondrial, hypoxie, inflammation, ferroptose, nécroptose.</p><p> • Objectifs de recherche de preuves : Prioriser les études originales qui observent directement la mort cellulaire/l'apoptose/la dégénérescence dans les organoïdes rétiniens humains ou animaux ; puis rechercher des publications sur les mécanismes indirects.</p><p> 1.2 Principes de segmentation par mots clés (Exemple)</p><p> Ne vous contentez pas d'une seule requête de recherche. Préparez au moins trois catégories de termes pour chaque concept.</p><p> Catégorie 1 : Mots précis.</p><p> • organoïde rétinien</p><p> • organoïde rétinien</p><p> • organoïde rétinien humain</p><p> • Organoïde rétinien dérivé de hPSC</p><p> • Organoïde rétinien dérivé de cellules iPSC</p><p> La deuxième catégorie : les synonymes et les hyperonymes.</p><p> • organoïde de la cupule optique</p><p> • Culture rétinienne 3D</p><p> • rétine dérivée de cellules souches</p><p> • Différenciation rétinienne</p><p> • Modèle de tissu rétinien</p><p> La troisième catégorie : termes liés au mécanisme et au phénotype.</p><p> • apoptose</p><p> • mort cellulaire</p><p> • dégénérescence</p><p> • survie</p><p> • stresser</p><p> • stress oxydatif</p><p> • Stress des ER</p><p> • dysfonctionnement mitochondrial</p><p> • hypoxie</p><p> • nécroptose</p><p> • ferroptose</p><p> Si l'utilisateur spécifie le type de cellule, ajoutez :</p><p> • photorécepteur</p><p> • cône</p><p> • tige</p><p> • cellule ganglionnaire rétinienne</p><p> • Müller glia</p><p> • cellule bipolaire</p><p> • cellule amacrine</p><p> Si l'utilisateur précise l'espèce ou l'origine, ajoutez :</p><p> • humain</p><p> • souris</p><p> • rat</p><p> • poisson-zèbre</p><p> • cellules souches embryonnaires humaines</p><p> • iPSC</p><p> • cellules souches pluripotentes</p><p> 1.3 Génération de requêtes de recherche hiérarchiques</p><p> Générez au moins 3 à 6 requêtes. Chaque requête correspond à un objectif de recherche.</p><p> Première étape : Collecte directe des preuves.</p><p> Utilisé pour trouver la littérature qui correspond directement au modèle et au phénotype cibles.</p><p> ```text</p><p> ("organoïde rétinien" OU "organoïde de la rétine" OU "organoïde rétinien humain") ET (apoptose OU "mort cellulaire" OU dégénérescence)</p><p> ```</p><p> Deuxième couche : Récupération de modèle étendue.</p><p> Utilisé pour recenser les publications où l'auteur n'utilise pas le terme précis « organoïde rétinien », mais où celui-ci est en réalité pertinent.</p><p> ```text</p><p> (« organoïde de la coupe optique » OU « culture rétinienne 3D » OU « rétine dérivée de cellules souches ») ET (survie OU apoptose OU stress)</p><p> ```</p><p> Troisième niveau : Recherche spécifique au mécanisme.</p><p> Utilisé pour vérifier des voies ou des mécanismes spécifiques.</p><p> ```text</p><p> (« organoïde rétinien » OU « organoïde de la rétine ») ET (« stress oxydatif » OU « stress du RE » OU hypoxie OU mitochondries)</p><p> ```</p><p> Quatrième niveau : Recherche spécifique au type cellulaire.</p><p> ```text</p><p> (« organoïde rétinien » OU « organoïde de la rétine ») ET (photorécepteur OU cône OU bâtonnet OU « cellule ganglionnaire rétinienne ») ET (mort OU apoptose OU dégénérescence)</p><p> ```</p><p> Cinquième niveau : Récupération du modèle de maladie.</p><p> ```text</p><p> (« organoïde rétinien » OU « organoïde de la rétine ») ET (maladie OU dégénérescence OU dystrophie OU rétinite OU glaucome)</p><p> ```</p><p> Sixième niveau : Examen/Recherche de renseignements.</p><p> ```text</p><p> ("organoïde rétinien" OU "organoïde de la rétine") ET (revue OU protocole OU modèle)</p><p> ```</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-microscope" aria-hidden="true"><path d="M6 18h8"></path><path d="M3 22h18"></path><path d="M14 22a7 7 0 1 0 0-14h-1"></path><path d="M9 14h2"></path><path d="M9 12a2 2 0 0 1-2-2V6h6v4a2 2 0 0 1-2 2Z"></path><path d="M12 6V3a1 1 0 0 0-1-1H9a1 1 0 0 0-1 1v3"></path></svg>リサーチ</div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>2. Quelles méthodes et quels sites web ont été utilisés pour la recherche ?</p><p> 2.1 Outils préférés : PubMed / NCBI E-utilities</p><p> PubMed est l'outil privilégié pour la recherche de littérature biomédicale. Évitez d'utiliser systématiquement l'extraction de données des pages PubMed. Privilégiez plutôt l'API NCBI E-utilities.</p><p> 2.1.1 ESearch : Récupération du PMID à l’aide d’une requête</p><p> interface:</p><p> ```text</p><p> https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi</p><p> ```</p><p> paramètre:</p><p> ```text</p><p> db=publié</p><p> terme=<terme de recherche></p><p> retmode=json</p><p> retmax=20</p><p> trier=pertinence</p><p> ```</p><p> Vous pouvez également trier par date :</p><p> ```text</p><p> trier=publication+date</p><p> ```</p><p> Exemple:</p><p> ```text</p><p> https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pubmed&term=(%22retinal%20organoid%22%20OR%20%22retina%20organoid%22)%20AND%20(apoptosis%20OR%20%22cell%20death%22)&retmode=json&retmax=20&sort=relevance</p><p> ```</p><p> Lisez le texte de retour :</p><p> ```text</p><p> esearchresult.idlist</p><p> ```</p><p> Voici la liste des PMID.</p><p> 2.1.2 ESummary : Obtention des métadonnées de la littérature</p><p> interface:</p><p> ```text</p><p> https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi</p><p> ```</p><p> paramètre:</p><p> ```text</p><p> db=publié</p><p> id=PMID1,PMID2,PMID3</p><p> retmode=json</p><p> ```</p><p> Champs extraits :</p><p> • PMID</p><p> • titre</p><p> • nom complet du journal</p><p> • abréviation de la source/de la revue</p><p> • date de publication</p><p> • auteurs</p><p> • DOI et PMCID dans les identifiants d'article</p><p> • volume, numéro, pages</p><p> 2.1.3 EFetch : Récupération du résumé et des détails XML</p><p> interface:</p><p> ```text</p><p> https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi</p><p> ```</p><p> paramètre:</p><p> ```text</p><p> db=publié</p><p> id=PMID1,PMID2</p><p> retmode=xml</p><p> rettype=abstrait</p><p> ```</p><p> Champs extraits :</p><p> • Titre de l'article</p><p> • Texte abstrait</p><p> • Titre de la revue</p><p> • Abréviation ISO</p><p> • ISSN / eISSN</p><p> • Date de publication</p><p> • DOI</p><p> • PMCID</p><p> • Termes MeSH</p><p> 2.1.4 Stratégie de récupération par lots</p><p> Processus recommandé :</p><p> 1. Appelez ESearch pour chaque requête.</p><p> 2. Pour chaque requête, sélectionnez les 5 à 20 premiers résultats.</p><p> 3. Fusionner tous les PMID.</p><p> 4. Utilisez PMID pour supprimer les doublons.</p><p> 5. Utilisez ESummary / EFetch pour récupérer les métadonnées et les données abstraites par lots.</p><p> 6. Lors de la phase de sélection initiale, ne lisez que les métadonnées et le résumé ; ne commencez pas par lire le texte intégral.</p><p> ────────────────</p><p> 2.2 Deuxième phase : Examen complet des documents PMC/BioC</p><p> Le texte intégral ne sera inclus que dans les cas suivants :</p><p> • Les utilisateurs demandent à lire attentivement le texte intégral.</p><p> • Le résumé est insuffisant pour déterminer le mécanisme.</p><p> • Nécessite des graphiques, des méthodes expérimentales, des concentrations, des dosages, IC50, EC50, Kd et Ki.</p><p> • Un petit nombre de PMID clés ont été identifiés et nécessitent un examen au cas par cas.</p><p> 2.2.1 PMID vers PMCID</p><p> interface:</p><p> ```text</p><p> https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/utils/idconv/v1.0/?ids=<PMID>&format=json</p><p> ```</p><p> Si le PMCID est renvoyé, cela signifie que le PMC peut avoir un accès au texte intégral.</p><p> 2.2.2 Prioriser le JSON BioC</p><p> interface:</p><p> ```text</p><p> https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/bionlp/RESTful/pmcoa.cgi/BioC_json/<PMCID>/unicode</p><p> ```</p><p> Avantages : Très structuré, convient à l'extraction des principaux paragraphes du texte.</p><p> 2.2.3 Essayez PMC XML lorsque BioC n'est pas disponible</p><p> interface:</p><p> ```text</p><p> https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/<PMCID>/?report=xml</p><p> ```</p><p> Ignorer lors de l'extraction du texte principal :</p><p> • références</p><p> • bibliographie</p><p> • Remerciements</p><p> • Contributions des auteurs</p><p> • intérêts concurrents</p><p> L'examen du texte intégral doit inclure un critère d'arrêt :</p><p> • Chaque document n'est scanné qu'une seule fois.</p><p> • Par défaut, seuls les paragraphes relatifs à la question sont extraits.</p><p> • Si le champ cible ne correspond pas, indiquez « Aucune preuve directe trouvée ».</p><p> • Évitez de récupérer des mots-clés de manière répétée.</p><p> ────────────────</p><p> 2.3 bioRxiv / medRxiv</p><p> Utilisé pour compléter les prépublications les plus récentes.</p><p> Vous pouvez utiliser l'API officielle :</p><p> ```text</p><p> https://api.biorxiv.org/details/biorxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD</p><p> https://api.biorxiv.org/details/medrxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD</p><p> ```</p><p> Vous pouvez également utiliser une recherche classique en complément :</p><p> ```text</p><p> site:biorxiv.org apoptose des organoïdes rétiniens</p><p> site:medrxiv.org dégénérescence des organoïdes rétiniens</p><p> ```</p><p> Les prépublications doivent être étiquetées :</p><p> ```text</p><p> Il s'agit d'une prépublication qui n'a pas encore été évaluée par des pairs.</p><p> ```</p><p> ────────────────</p><p> 2.4 Crossref/OpenAlex/Unpaywall</p><p> Utilisé pour compléter le DOI, l'adresse d'accès au texte intégral et les informations de publication.</p><p> Crossref :</p><p> ```text</p><p> https://api.crossref.org/works?query.title=<title></p><p> ```</p><p> OpenAlex :</p><p> ```text</p><p> https://api.openalex.org/works?search=<titre ou sujet></p><p> ```</p><p> Dépaywall :</p><p> ```text</p><p> https://api.unpaywall.org/v2/<DOI>?email=<votre_email></p><p> ```</p><p> utiliser:</p><p> • Achèvement du DOI.</p><p> • Recherche de liens PDF OA.</p><p> • Vérification du nom du journal.</p><p> • Vérification de l'année de publication.</p><p> ────────────────</p><p> 2.5 Page de l'éditeur</p><p> N'accédez à la page de l'éditeur que lorsque les informations de l'API sont insuffisantes.</p><p> Règles d'accès :</p><p> • Chaque URL d'éditeur ne sera testée qu'une seule fois.</p><p> • Si vous rencontrez des CAPTCHA, des barrières de connexion, des messages Cloudflare, d'accès refusé ou des barrières d'accès institutionnelles, arrêtez immédiatement.</p><p> • Évitez d’actualiser sans cesse, de changer de chemin d’accès au sein du même site ou de rester bloqué dans une boucle.</p><p> • Utilisez les métadonnées PubMed, PMC, Crossref, OpenAlex, Unpaywall et DOI comme solution de repli.</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-microscope" aria-hidden="true"><path d="M6 18h8"></path><path d="M3 22h18"></path><path d="M14 22a7 7 0 1 0 0-14h-1"></path><path d="M9 14h2"></path><path d="M9 12a2 2 0 0 1-2-2V6h6v4a2 2 0 0 1-2 2Z"></path><path d="M12 6V3a1 1 0 0 0-1-1H9a1 1 0 0 0-1 1v3"></path></svg>リサーチ</div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>3. Comment organiser les informations après leur récupération</p><p> 3.1 Établir une structure d'enregistrement unifiée</p><p> Chaque document est compilé dans un enregistrement unifié.</p><p> Champs :</p><p> ```text</p><p> PMID</p><p> doi</p><p> pmcid</p><p> titre</p><p> auteurs</p><p> journal</p><p> abréviation du journal</p><p> ISSN</p><p> eissn</p><p> année</p><p> abstrait</p><p> source de requête</p><p> niveau de preuve</p><p> balises de preuve</p><p> type_de_papier</p><p> URL</p><p> ```</p><p> 3.2 Déduplication</p><p> Priorité:</p><p> 1. Déduplication PMID.</p><p> 2. Utilisez le DOI pour supprimer les doublons si le PMID n'est pas disponible.</p><p> 3. S'il n'y a pas de DOI, utilisez lower(title) + année + premier_auteur pour supprimer les doublons.</p><p> Conservez la source de requête qui a été utilisée la première fois et enregistrez les requêtes qui ont accédé au document.</p><p> 3.3 Classification des preuves</p><p> Il est nécessaire de distinguer :</p><p> Preuve directe :</p><p> L’espèce cible, le tissu, le type cellulaire, le modèle et les conditions de traitement sont parfaitement alignés.</p><p> Preuves indirectes :</p><p> Les systèmes adjacents, les modèles similaires et les mécanismes similaires sont pris en charge, mais il ne s'agit pas de systèmes destinés directement à résoudre les problèmes des utilisateurs.</p><p> Aucune preuve directe n'a été trouvée :</p><p> On ne trouve que des informations générales, des spéculations, des analyses ou des modèles connexes ; il n'existe aucun résultat expérimental direct.</p><p> 3.4 Étiquetage des types de documents</p><p> Il convient au moins de noter les points suivants :</p><p> • recherche originale</p><p> • revoir</p><p> • protocole</p><p> • prépublication</p><p> • ensemble de données/ressource</p><p> • étude clinique</p><p> • document de méthodologie</p><p> 3.5 Règles de tri</p><p> Tri recommandé :</p><p> 1. Recherche originale fondée sur des preuves directes.</p><p> 2. Recherche sur les mécanismes clés.</p><p> 3. Dernières recherches importantes.</p><p> 4. Études fondamentales classiques.</p><p> 5. Avis de haute qualité.</p><p> 6. Preuve indirecte.</p><p> Ne triez pas uniquement selon le facteur d'impact. Le facteur d'impact est un indicateur au niveau de la revue et ne reflète pas la qualité d'un article individuel.</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-pen-tool" aria-hidden="true"><path d="M15.707 21.293a1 1 0 0 1-1.414 0l-1.586-1.586a1 1 0 0 1 0-1.414l5.586-5.586a1 1 0 0 1 1.414 0l1.586 1.586a1 1 0 0 1 0 1.414z"></path><path d="m18 13-1.375-6.874a1 1 0 0 0-.746-.776L3.235 2.028a1 1 0 0 0-1.207 1.207L5.35 15.879a1 1 0 0 0 .776.746L13 18"></path><path d="m2.3 2.3 7.286 7.286"></path><circle cx="11" cy="11" r="2"></circle></svg>書く</div><div class="flex h-[32px] items-center gap-1 px-2 rounded-[20px] min-w-0 max-md:w-[32px] max-md:justify-center max-md:px-0" type="button" aria-haspopup="dialog" aria-expanded="false" aria-controls="radix-_R_medhinpfivabtkqivb_" data-state="closed" disabled=""><div class="flex-shrink-0"><div class="overflow-hidden bg-cover bg-center bg-no-repeat" style="background-image:url(https://cdn.gooo.ai/assets/select_model_claude.png);width:16px;height:16px;border-radius:8px" role="img" aria-label="Claude Sonnet 4.5"></div></div><span class="text-sm font-normal px-[1px] truncate min-w-0 text-foreground max-md:hidden">Claude Sonnet 4.5</span></div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>4. Comment organiser les citations dans une réponse</p><p> 4.1 Format de citation du texte</p><p> Toutes les citations textuelles doivent être cliquables.</p><p> Format:</p><p> ```markdown</p><p> [[1. **Journal**, Année]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)</p><p> ```</p><p> Exemple:</p><p> ```markdown</p><p> Des études antérieures ont observé un stress et une dégénérescence des photorécepteurs liés au stade de développement dans les organoïdes rétiniens humains [[1. **Cell Stem Cell**, 2019]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/xxxxxxx/).</p><p> ```</p><p> Ne l'écrivez pas comme ceci :</p><p> ```text</p><p> [1]</p><p> (PMID : xxxxx)</p><p> Voir la référence 1</p><p> ```</p><p> 4.2 Structure de réponse recommandée</p><p> Premier paragraphe : Conclusion directe.</p><p> ```text</p><p> Conclusion : Des rapports pertinents ont été publiés, mais les preuves directes portent principalement sur… ; les preuves directes concernant… font encore défaut.</p><p> ```</p><p> Deuxième paragraphe : Classification des preuves.</p><p> ```text</p><p> Preuve directe :</p><p> - Référence A : ...</p><p></p><p> Preuves indirectes :</p><p> - Référence B : ...</p><p></p><p> Aucune preuve directe n'a été trouvée :</p><p> - Non trouvé lors de cette session...</p><p> ```</p><p> Troisième paragraphe : Résumé du mécanisme.</p><p> Regrouper par sujet, par exemple :</p><p> • voie d'apoptose/caspase</p><p> • stress oxydatif</p><p> • dysfonctionnement mitochondrial</p><p> • Stress des ER</p><p> • hypoxie/stress métabolique</p><p> • inflammation</p><p> • inadéquation du développement</p><p> Quatrième paragraphe : Lacune en matière de recherche.</p><p> Indiquez clairement les points qui manquent de preuves directes.</p><p> Cinquième paragraphe : Inspiration tirée de l'expérience.</p><p> Si l'utilisateur a besoin d'un plan expérimental, veuillez fournir le marqueur, le dosage, le point temporel et le contrôle.</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-pen-tool" aria-hidden="true"><path d="M15.707 21.293a1 1 0 0 1-1.414 0l-1.586-1.586a1 1 0 0 1 0-1.414l5.586-5.586a1 1 0 0 1 1.414 0l1.586 1.586a1 1 0 0 1 0 1.414z"></path><path d="m18 13-1.375-6.874a1 1 0 0 0-.746-.776L3.235 2.028a1 1 0 0 0-1.207 1.207L5.35 15.879a1 1 0 0 0 .776.746L13 18"></path><path d="m2.3 2.3 7.286 7.286"></path><circle cx="11" cy="11" r="2"></circle></svg>書く</div><div class="flex h-[32px] items-center gap-1 px-2 rounded-[20px] min-w-0 max-md:w-[32px] max-md:justify-center max-md:px-0" type="button" aria-haspopup="dialog" aria-expanded="false" aria-controls="radix-_R_midhinpfivabtkqivb_" data-state="closed" disabled=""><div class="flex-shrink-0"><div class="overflow-hidden bg-cover bg-center bg-no-repeat" style="background-image:url(https://cdn.gooo.ai/assets/select_model_claude.png);width:16px;height:16px;border-radius:8px" role="img" aria-label="Claude Sonnet 4.5"></div></div><span class="text-sm font-normal px-[1px] truncate min-w-0 text-foreground max-md:hidden">Claude Sonnet 4.5</span></div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>5. Liste complète des références à la fin de l'article</p><p> Si une référence spécifique est citée dans le texte, une liste complète doit être jointe à la fin de l'article.</p><p> Format:</p><p> ```markdown</p><p> ## Liste complète des informations de référence</p><p></p><p> 1. Smith J et al., **Nom du journal** (2021), [PMID : 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF＝X，Qn}*</p><p> 2. Wang X et al., **Nom de la revue** (2022), [DOI : 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *{IF=À vérifier}*</p><p> ```</p><p> Format de l'auteur :</p><p> • 1 à 3 auteurs : Veuillez tous les énumérer.</p><p> • Plus de 3 auteurs : Premier auteur et al.</p><p> Le PMID / DOI / URL doit être cliquable.</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-microscope" aria-hidden="true"><path d="M6 18h8"></path><path d="M3 22h18"></path><path d="M14 22a7 7 0 1 0 0-14h-1"></path><path d="M9 14h2"></path><path d="M9 12a2 2 0 0 1-2-2V6h6v4a2 2 0 0 1-2 2Z"></path><path d="M12 6V3a1 1 0 0 0-1-1H9a1 1 0 0 0-1 1v3"></path></svg>リサーチ</div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>6. Vérification et étiquetage du FI</p><p> 6.1 Tout d’abord, expliquons les limites pratiques des contrôles IF.</p><p> Normalement, le facteur d'impact officiel d'une revue est fourni par Clarivate Journal Citation Reports (JCR). Cependant, les organismes externes ne disposent généralement pas de compte Clarivate/JCR ni d'une table JCR locale ; il est donc déconseillé de le vérifier par cette voie.</p><p> ```</p><p> 6.2 Méthodes pratiques d'utilisation des compétences en intelligence artificielle</p><p> Route principale :</p><p> 1. Si l'entrée est un PMID, utilisez d'abord les utilitaires électroniques du NCBI pour obtenir les métadonnées PubMed.</p><p> - Récupérer le nom complet de la revue. - Récupérer la source/l'abréviation ISO. - Récupérer l'ISSN/eISSN. - Récupérer les champs auxiliaires tels que le titre, l'année et le DOI.</p><p> 2. Utilisez l'interface JSON mobile iikx/iscience, accessible au public, pour interroger les revues.</p><p> API de recherche :</p><p> ```text</p><p> https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci&c=index&a=info&keyword=<journal_query></p><p> ```</p><p> API de détails :</p><p> ```text</p><p> https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail&id=<id>&classid=<classid></p><p> ```</p><p> 3. Effectuer une correspondance prudente sur les résultats de la recherche.</p><p> - Priorise les correspondances exactes avec les titres normalisés des revues. - Priorise ensuite les correspondances exactes avec les abréviations. - Fait preuve d'une grande prudence avec les termes courts et généraux. - N'accepte pas les erreurs manifestes de correspondance avec des sous-chaînes, comme la confusion entre « Nature » et la série « Nature Reviews ». - Renvoie des résultats ambigus ou introuvables si la correspondance est instable, plutôt que de tenter une estimation.</p><p> 4. Si PubMed fournit une abréviation, essayez de la développer en nom complet ou en titre alternatif à l'aide du catalogue NLM.</p><p> L'interface de recherche du catalogue NLM reste NCBI E-utilities :</p><p> ```text</p><p> https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog&term=<abbr>[Abréviation du titre]&retmode=xml&retmax=1</p><p> ```</p><p> Utilisez ensuite ESummary pour obtenir le titre / le titre alternatif.</p><p> 5. Lisez les résultats détaillés de iikx :</p><p> - Facteur d'impact. - Année IF. - Quartile JCR. - Quartile CAS/CAS, le cas échéant. - URL source. - Niveau de confiance de la correspondance.</p><p> 6. N’incluez pas l’année IF dans le texte principal lors de l’annotation ; utilisez des annotations concises.</p><p> La dernière annotation devrait simplement indiquer :</p><p> ```text</p><p> *{SI＝X，Qn}*</p><p> ```</p><p> En cas d'échec :</p><p> ```text</p><p> *{IF=Vérification en attente}*</p><p> ```</p><p> ou:</p><p> ```text</p><p> *{IF=Non détecté}*</p><p> ```</p><p> 6.3 Étapes spécifiques</p><p> Effectuez la procédure suivante pour chaque document.</p><p> Étape 1 : Préparer le nom de la recherche dans la revue.</p><p> Prioriser la récupération des métadonnées PubMed :</p><p> ```text</p><p> Nom complet du journal</p><p> Abréviation ISO / Source</p><p> ISSN</p><p> eISSN</p><p> ```</p><p> Si seul un DOI est disponible, utilisez d'abord Crossref ou OpenAlex pour obtenir le nom de la revue.</p><p> Crossref :</p><p> ```text</p><p> https://api.crossref.org/works/<DOI></p><p> ```</p><p> OpenAlex :</p><p> ```text</p><p> https://api.openalex.org/works/https://doi.org/<DOI></p><p> ```</p><p> Étape 2 : Normaliser les noms des revues.</p><p> Règles de normalisation :</p><p> • Tout en minuscules.</p><p> • Décompression HTML.</p><p> • Remplacez & par et.</p><p> • Supprimez la ponctuation.</p><p> • Combiner plusieurs espaces.</p><p> • Pour faire des comparaisons, vous pouvez également utiliser la forme compacte, qui supprime tous les espaces.</p><p> Exemple de pseudocode :</p><p> Python</p><p> importer re, html</p><p></p><p> def norm(s) :</p><p> s = html.unescape(s ou '').lower()</p><p> s = re.sub(r'&', ' et ', s)</p><p> s = re.sub(r'[^a-z0-9]+', ' ', s)</p><p> retourner re.sub(r'\s+', ' ', s).strip()</p><p></p><p> def compact(s) :</p><p> retourner norm(s).replace(' ', '')</p><p> ```</p><p> Étape 3 : Interroger l'interface de recherche iikx.</p><p> ```text</p><p> https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci&c=index&a=info&keyword=<journal_query></p><p> ```</p><p> Il est recommandé de définir un User-Agent, par exemple :</p><p> ```text</p><p> Mozilla/5.0</p><p> ```</p><p> Si aucune correspondance exacte n'est trouvée sur la première page, vous pouvez feuilleter un nombre limité de pages, par exemple, jusqu'à 8 pages.</p><p> Les paramètres de changement de page sont généralement les suivants :</p><p> ```text</p><p> page=2</p><p> page=3</p><p> ```</p><p> Étape 4 : Sélectionner les candidats parmi les résultats de la recherche.</p><p> Les domaines candidats comprennent généralement :</p><p> ```text</p><p> identifiant</p><p> classifié</p><p> titre</p><p> petit titre</p><p> SI ou SI2024</p><p> zky2020</p><p> URL</p><p> ```</p><p> Règles de correspondance :</p><p> • Si compact(query) == compact(candidate.title), accepter.</p><p> • Si norm(query) == norm(candidate.title), accepter.</p><p> • Si compact(query) == compact(candidate.smalltitle), accepter.</p><p> • Si norm(query) == norm(candidate.smalltitle), accepter.</p><p> • N’acceptez pas une sous-chaîne à moins que la requête ne soit suffisamment longue et non ambiguë.</p><p> • Soyez particulièrement prudent avec les mots courts tels que Nature, Science, Cellule, Cerveau, Vision et Rétine.</p><p> Étape 5 : Si aucune correspondance n’est trouvée, utilisez l’abréviation étendue du catalogue NLM.</p><p> Par exemple, dans PubMed, la source est :</p><p> ```text</p><p> Biol Médicament des radicaux libres</p><p> ```</p><p> Vous pouvez vérifier :</p><p> ```text</p><p> https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog&term=Free%20Radic%20Biol%20Med%5BTitle%20Abbreviation%5D&retmode=xml&retmax=1</p><p> ```</p><p> Après avoir obtenu l'identifiant du catalogue NLM, utilisez-le comme suit :</p><p> ```text</p><p> https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi?db=nlmcatalog&id=<id>&retmode=xml</p><p> ```</p><p> Lire:</p><p> ```text</p><p> Titre</p><p> Titre alternatif</p><p> ```</p><p> Utilisez ensuite ces noms complets pour rechercher iikx.</p><p> Étape 6 : Vérifiez l'interface des détails iikx.</p><p> Si les résultats de la recherche contiennent :</p><p> ```text</p><p> id=<id></p><p> classid=<classid></p><p> ```</p><p> Appel:</p><p> ```text</p><p> https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail&id=<id>&classid=<classid></p><p> ```</p><p> Lire les détails :</p><p> ```text</p><p> IF2024, IF2023, IF2022…</p><p> SI</p><p> zky2020 ou autres champs de quartile JCR</p><p> jcr22 / jcr12 ou champ de partition</p><p> ISSN</p><p> eissn</p><p> titre</p><p> petit titre</p><p> catégorie</p><p> ```</p><p> Étape 7 : Sélectionnez la dernière instruction IF.</p><p> Recherchez dans les champs renvoyés toutes les occurrences du formulaire :</p><p> ```text</p><p> IF20xx</p><p> ```</p><p> Par exemple:</p><p> ```text</p><p> IF2024</p><p> IF2023</p><p> IF2022</p><p> ```</p><p> Choisissez l'année avec le plus grand chiffre significatif.</p><p> Si IF20xx est absent, essayez de lire :</p><p> ```text</p><p> SI</p><p> valeur_si</p><p> ```</p><p> Si aucune valeur valide n'est trouvée, elle est marquée comme non détectée.</p><p> Étape 8 : Afficher le niveau de confiance et l'étiquette.</p><p> Si le titre/l'abréviation correspond exactement et que les détails renvoient un IF valide :</p><p> ```text</p><p> *{SI＝X，Qn}*</p><p> ```</p><p> Si le match est incertain :</p><p> ```text</p><p> *{IF=Vérification en attente}*</p><p> ```</p><p> Si l'API publique ne renvoie aucun résultat :</p><p> ```text</p><p> *{IF=Non détecté}*</p><p> ```</p><p> 6.4 Format d'annotation IF</p><p> Format fixe :</p><p> ```text</p><p> *{SI＝X，Qn}*</p><p> ```</p><p> Exemple:</p><p> ```markdown</p><p> Smith J et al., **Neuron** (2020), [PMID : 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF = 15,0, Q1}*</p><p> ```</p><p> Avis:</p><p> • L’année JCR n’est pas inscrite dans l’annotation IF.</p><p> • N’écrivez pas « 2024 JCR IF ».</p><p> • N’écrivez pas « JCR 2024 ».</p><p> • Seule l'année de publication est conservée.</p><p> • Si la valeur IF est 0,0, nulle, a une source instable ou une correspondance instable, le nombre ne sera pas affiché.</p><p> 6.5 Gestion standard des échecs de vérification IF</p><p> Ne devinez pas.</p><p> N’utilisez pas le nom de la revue pour renseigner les numéros.</p><p> N’utilisez pas de grands modèles pour mémoriser et remplir des instructions IF.</p><p> Seuls trois états sont autorisés en cas d'échec :</p><p> ```text</p><p> *{IF=Vérification en attente}*</p><p> ```</p><p> Utilisé pour :</p><p> • Les résultats de la recherche sont vagues.</p><p> Il existe plusieurs revues similaires.</p><p> • Seule l'abréviation a été trouvée, mais le nom complet n'a pas pu être confirmé.</p><p> • Le facteur d'impact (FI) fourni par les sources publiques est discutable.</p><p> ```text</p><p> *{IF=Non détecté}*</p><p> ```</p><p> Utilisé pour :</p><p> • L'interface publique n'a renvoyé aucun résultat.</p><p> • La revue n'est pas indexée dans SCI/JCR.</p><p> • Ce nouveau numéro n'a pas encore de condition suspensive.</p><p> ```text</p><p> *{IF=Non vérifiable publiquement}*</p><p> ```</p><p> Utilisé pour :</p><p> • L’utilisateur a besoin d’un JCR officiel, mais l’agent actuel ne dispose pas des autorisations Clarivate/JCR.</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-microscope" aria-hidden="true"><path d="M6 18h8"></path><path d="M3 22h18"></path><path d="M14 22a7 7 0 1 0 0-14h-1"></path><path d="M9 14h2"></path><path d="M9 12a2 2 0 0 1-2-2V6h6v4a2 2 0 0 1-2 2Z"></path><path d="M12 6V3a1 1 0 0 0-1-1H9a1 1 0 0 0-1 1v3"></path></svg>リサーチ</div></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>7. Liste d'auto-vérification finale</p><p> À vérifier avant l'expédition :</p><p> • Faut-il répondre d'abord aux questions essentielles de l'utilisateur ?</p><p> • Faut-il faire une distinction entre preuves directes, preuves indirectes et absence de preuves directes ?</p><p> • Toutes les citations textuelles sont-elles cliquables ?</p><p> • L’article comporte-t-il une liste complète des références à la fin ?</p><p> • Chaque document comporte-t-il une étiquette IF (Entrée/Sortie) ou une étiquette indiquant une vérification en attente/non détectée ?</p><p> • Si le PMID/DOI/URL est cliquable.</p><p> • Permet-elle d'éviter de substituer des résultats globaux sur les tissus à des conclusions concernant des types cellulaires spécifiques ?</p><p> • Cela permet-il d'éviter de substituer l'activation/phosphorylation à une augmentation de l'expression totale ?</p><p> • Faut-il indiquer qu'il s'agit d'une prépublication ?</p><p> • Spécifie-t-il les limites de la recherche ?</p><p> • SI ce n'était pas basé sur la mémoire ou la conjecture.</p></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>8. Pseudocode reproductible</p><p> Python</p><p> requêtes = construire_requêtes(question_utilisateur)</p><p></p><p> tous_pmids = []</p><p> pour la requête dans les requêtes :</p><p> pmids = ncbi_esearch(query, retmax=20, sort='relevance')</p><p> all_pmids.extend(pmids)</p><p></p><p> pmids = deduplicate_keep_order(all_pmids)</p><p></p><p> métadonnées = ncbi_esummary(pmids)</p><p> résumés = ncbi_efetch_abstract(pmids)</p><p></p><p> enregistrements = fusionner_métadonnées_et_résumés(métadonnées, résumés)</p><p> enregistrements = étiquette_preuve(enregistrements, question_utilisateur)</p><p> enregistrements = rang_enregistrements(enregistrements)</p><p> sélectionné = sélectionner_meilleurs_enregistrements(enregistrements)</p><p></p><p> si besoin_texte_complet :</p><p> pour chaque enregistrement dans selected_key_records :</p><p> pmcid = idconv_pmid_to_pmcid(record.pmid)</p><p> si pmcid :</p><p> enregistrement.fulltext = fetch_bioc_or_pmc_xml(pmcid)</p><p></p><p> Pour enregistrer dans la sélection :</p><p> journal_query = record.full_journal_name ou record.journal_abbrev</p><p> si_résultat = lookup_if_public_iikx(requête_journal)</p><p> si_résultat.confiant :</p><p> record.if_annotation = f'*{IF＝{if_result.if_value}，{if_result.quartile}｝*'</p><p> elif if_result.ambiguous:</p><p> record.if_annotation = '*{IF＝Vérification en attente}*'</p><p> autre:</p><p> record.if_annotation = '*{IF＝Non détecté}*'</p><p></p><p> réponse = composer_réponse(</p><p> conclusion</p><p> groupes de preuves,</p><p> citations cliquables_corps,</p><p> liste_de_référence_complète_avec_si</p><p> )</p><p> ```</p></div></div><div class="flex flex-col rounded-[16px] bg-card p-3"><div class="skill-detail-content h-auto text-sm font-normal break-words whitespace-pre-wrap bg-transparent border-none rounded-xl instruction-content-container pb-4"><p>9. Modèle de livraison finale recommandé</p><p> ```markdown</p><p> en conclusion:</p><p> ...</p><p></p><p> Niveau de preuve :</p><p></p><p> Preuve directe :</p><p> - ……[[1. **Journal**, Année]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)</p><p></p><p> Preuves indirectes :</p><p> - …[[2. **Journal**, Année]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)</p><p></p><p> Aucune preuve directe n'a été trouvée :</p><p> - ……</p><p></p><p> Résumé du mécanisme :</p><p> 1. ……</p><p> 2. ……</p><p></p><p> Limites de recherche :</p><p> Cette série de recherches a principalement porté sur PubMed, PMC, BioC et bioRxiv ; la sélection initiale s’est basée sur les métadonnées et les résumés, seuls les documents clés faisant l’objet d’une analyse du texte intégral. Les annotations d’impact ont été établies à partir de sources accessibles au public ; les documents pour lesquels une correspondance avec certitude n’a pu être établie ont été marqués comme étant en attente de vérification ou non détectés.</p><p></p><p> Liste complète des informations bibliographiques :</p><p> 1. Smith J et al., **Nom du journal** (2021), [PMID : 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF＝X，Q1}*</p><p> 2. Wang X et al., **Nom de la revue** (2022), [DOI : 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *{IF=À vérifier}*</p><p> ```</p></div><div class="flex flex-row items-center gap-2 flex-1 min-w-0"><div class="relative flex h-[32px] items-center rounded-full px-2 text-xs text-foreground gap-[4px]"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="14" height="14" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-pen-tool" aria-hidden="true"><path d="M15.707 21.293a1 1 0 0 1-1.414 0l-1.586-1.586a1 1 0 0 1 0-1.414l5.586-5.586a1 1 0 0 1 1.414 0l1.586 1.586a1 1 0 0 1 0 1.414z"></path><path d="m18 13-1.375-6.874a1 1 0 0 0-.746-.776L3.235 2.028a1 1 0 0 0-1.207 1.207L5.35 15.879a1 1 0 0 0 .776.746L13 18"></path><path d="m2.3 2.3 7.286 7.286"></path><circle cx="11" cy="11" r="2"></circle></svg>書く</div><div class="flex h-[32px] items-center gap-1 px-2 rounded-[20px] min-w-0 max-md:w-[32px] max-md:justify-center max-md:px-0" type="button" aria-haspopup="dialog" aria-expanded="false" aria-controls="radix-_R_n6dhinpfivabtkqivb_" data-state="closed" disabled=""><div class="flex-shrink-0"><div class="overflow-hidden bg-cover bg-center bg-no-repeat" style="background-image:url(https://cdn.gooo.ai/assets/select_model_claude.png);width:16px;height:16px;border-radius:8px" role="img" aria-label="Claude Sonnet 4.5"></div></div><span class="text-sm font-normal px-[1px] truncate min-w-0 text-foreground max-md:hidden">Claude Sonnet 4.5</span></div></div></div></div></div><div class="flex flex-col gap-4"><p class="text-xl font-semibold leading-7 text-primary">description</p><p class="text-sm leading-5 text-secondary-fg whitespace-pre-wrap break-words">Scénarios d'application : Effectuer une recherche bibliographique complète en biologie/biomédecine et fournir aux utilisateurs des résultats détaillés et fiables. 1. Après le lancement d'une recherche par l'utilisateur, le système analyse la question et les mots-clés. 2. Rechercher des publications à partir de sources de données publiques et reproductibles. 3. Dédupliquer, stratifier, classer et trier les résultats de recherche. 4. Intégrer des citations cliquables dans la réponse. 5. Lister les informations bibliographiques complètes à la fin du document et indiquer le facteur d'impact (FI) avec les liens de recherche publics ; si une vérification avec un haut degré de confiance est impossible, la publication doit être marquée comme « à vérifier » ou « non détectée ».</p></div></div><div class="flex flex-col gap-5 px-5"><div class="flex items-center justify-between gap-3"><h3 class="font-semibold text-primary text-lg">Related Skills</h3><a class="inline-flex items-center gap-1 text-sm font-semibold text-secondary-fg transition-colors hover:text-primary" href="/skills/category/learn">View all<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-arrow-right size-4" aria-hidden="true"><path d="M5 12h14"></path><path d="m12 5 7 7-7 7"></path></svg></a></div><div class="relative -mx-5" role="region" aria-roledescription="carousel"><div class="overflow-hidden"><div class="flex -ml-4 pb-1 pl-5 pr-5"><div role="group" aria-roledescription="slide" class="min-w-0 shrink-0 grow-0 pl-4 basis-[85%] sm:basis-[70%]"><div class="group relative flex flex-col gap-3 pt-5 pb-4 px-5 rounded-xl border border-material-card-border overflow-hidden cursor-pointer transition-colors bg-material-card"><div class="flex h-12 items-center gap-4"><div class="relative size-10 overflow-hidden shrink-0 rounded-[10px]"><img src="https://cdn.gooo.ai/web-images/1c599e4ae9e505d5ef0587144f0c6cc076dcf9010a2c46506be9135717f2bb87" alt="Analyse en trois éléments : Comprendre le document" class="size-full object-cover"/></div><h3 class="text-base font-semibold leading-6 text-primary line-clamp-2 min-w-0 flex-1">Analyse en trois éléments : Comprendre le document</h3></div><p class="text-xs leading-[18px] text-caption-fg line-clamp-3 h-[54px]">Utilisant une méthode de décomposition en trois étapes (identification des éléments clés, compréhension des boucles de raisonnement et maîtrise de la boucle d'argumentation globale), cet outil analyse automatiquement ou interactivement le cadre argumentatif de tout document. Il comprend 14 modèles d'invites IA intégrés, adaptés à tous les lecteurs universitaires.</p><div class="flex h-6 items-center gap-3"><div class="flex items-center gap-1 py-0.5 pr-1"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-user-round size-4 text-secondary-fg" aria-hidden="true"><circle cx="12" cy="8" r="5"></circle><path d="M20 21a8 8 0 0 0-16 0"></path></svg><span class="text-sm leading-5 text-secondary-fg">1</span></div></div></div></div><div role="group" aria-roledescription="slide" class="min-w-0 shrink-0 grow-0 pl-4 basis-[85%] sm:basis-[70%]"><div class="group relative flex flex-col gap-3 pt-5 pb-4 px-5 rounded-xl border border-material-card-border overflow-hidden cursor-pointer transition-colors bg-material-card"><div class="flex h-12 items-center gap-4"><div class="relative size-10 overflow-hidden shrink-0 rounded-[10px]"><img src="https://cdn.gooo.ai/web-images/951c263fe03cfc65a1a35f6e0ed4aa832c9b819d03e6b0f3f3afb419be2ba60d" alt="Recherche bibliographique sur la méthode d'épluchage des oignons à l'envers" class="size-full object-cover"/></div><h3 class="text-base font-semibold leading-6 text-primary line-clamp-2 min-w-0 flex-1">Recherche bibliographique sur la méthode d'épluchage des oignons à l'envers</h3></div><p class="text-xs leading-[18px] text-caption-fg line-clamp-3 h-[54px]">Saisissez une expression-clé, et l'outil décompose automatiquement la structure du sujet selon la méthode de l'oignon → développe les synonymes → génère des requêtes de recherche à quatre niveaux (CNKI + WoS/Google Scholar) et fournit une liste d'exécution et une stratégie de filtrage. Applicables à toutes les disciplines, les requêtes de recherche peuvent être directement copiées-collées et utilisées. 🎯 Quels problèmes résout-il ? ❌ Saisie directe d'une phrase complète dans le champ de recherche → 0 résultat ❌ Recherche d'un seul mot-clé → 5000 résultats sans savoir par où commencer ❌ Ne pas savoir comment segmenter un sujet → Recherche sans orientation ✅ Saisie de « Anxiété scolaire de la classe moyenne et pratiques d'enseignement parallèle » → Plus de 30 requêtes de recherche directement utilisables + un thésaurus + une liste d'exécution par niveaux 📐 Méthode principale : La méthode de l'oignon se développe de l'intérieur vers l'extérieur, du plus étroit au plus large, en trois couches de profondeur croissante : la couche principale identifie précisément 4 articles de lecture essentiels, la couche d'expansion trouve 48 études directement liées et la couche panoramique établit une compréhension globale de la portée du domaine. 🔧 Les résultats comprennent : • Analyse des trois éléments de sélection du sujet (qualificatifs + unité de recherche + dimension de recherche) • 5 à 8 concepts associés pour chaque élément + comparaison chinois-anglais + concepts généraux/subordonnés • Premier niveau : 8 ensembles de formules de recherche par combinaison de trois éléments (titre → sujet, précis → général) • Deuxième niveau : 3 types de paires d’éléments (marquage des usages principaux/de fond) • Troisième niveau : Formule de recherche panoramique mono-élément • Quatrième niveau : Stratégie d’expansion des concepts généraux • 📋 Liste de contrôle d’exécution en six étapes + critères de sélection pour chaque niveau (articles fréquemment cités + articles de pointe) 👥 À qui s’adresse ce service ? Aux chercheurs débutants, aux étudiants de master et de doctorat, aux jeunes chercheurs – à toute personne souhaitant effectuer des recherches bibliographiques de manière systématique plutôt que de se fier à son intuition pour la recherche par mots-clés.</p><div class="flex h-6 items-center gap-3"><div class="flex items-center gap-1 py-0.5 pr-1"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-user-round size-4 text-secondary-fg" aria-hidden="true"><circle cx="12" cy="8" r="5"></circle><path d="M20 21a8 8 0 0 0-16 0"></path></svg><span class="text-sm leading-5 text-secondary-fg">1</span></div></div></div></div><div role="group" aria-roledescription="slide" class="min-w-0 shrink-0 grow-0 pl-4 basis-[85%] sm:basis-[70%]"><div class="group relative flex flex-col gap-3 pt-5 pb-4 px-5 rounded-xl border border-material-card-border overflow-hidden cursor-pointer transition-colors bg-material-card"><div class="flex h-12 items-center gap-4"><div class="relative size-10 overflow-hidden shrink-0 rounded-[10px]"><img src="https://cdn.gooo.ai/web-images/7e758e98d4432be97cf48bea1a6bc163e8d876b076ef4a29f6a349b8e7bdb657" alt="stratégie d'investissement pour le démantèlement de chaînes et la détection des goulots d'étranglement" class="size-full object-cover"/></div><h3 class="text-base font-semibold leading-6 text-primary line-clamp-2 min-w-0 flex-1">stratégie d'investissement pour le démantèlement de chaînes et la détection des goulots d'étranglement</h3></div><p class="text-xs leading-[18px] text-caption-fg line-clamp-3 h-[54px]">Saisissez une tendance sectorielle et le système se connectera automatiquement à Internet pour analyser la chaîne d'approvisionnement, identifier les goulets d'étranglement physiques incontournables et mettre en évidence les entreprises qui en tirent réellement profit, ainsi que les mesures à contre-courant. L'objectif principal est de repérer les barrières physiques infranchissables lorsqu'une tendance prend de l'ampleur, plutôt que de suivre aveuglément les entreprises leaders.</p><div class="flex h-6 items-center gap-3"><div class="flex items-center gap-1 py-0.5 pr-1"><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-user-round size-4 text-secondary-fg" aria-hidden="true"><circle cx="12" cy="8" r="5"></circle><path d="M20 21a8 8 0 0 0-16 0"></path></svg><span class="text-sm leading-5 text-secondary-fg">0</span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><div class="px-5 md:px-[168px]"><div class="relative overflow-hidden rounded-[36px] border border-black/[0.06] bg-card px-6 py-10 md:rounded-[40px] md:px-10 md:py-14"><div class="pointer-events-none absolute inset-0 bg-[radial-gradient(circle_at_left_center,rgba(191,219,254,0.12),transparent_34%),radial-gradient(circle_at_right_center,rgba(254,240,138,0.14),transparent_36%)] opacity-75"></div><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-zap absolute left-6 top-6 size-5 text-[#F5D36A] md:left-8 md:top-8" aria-hidden="true"><path d="M4 14a1 1 0 0 1-.78-1.63l9.9-10.2a.5.5 0 0 1 .86.46l-1.92 6.02A1 1 0 0 0 13 10h7a1 1 0 0 1 .78 1.63l-9.9 10.2a.5.5 0 0 1-.86-.46l1.92-6.02A1 1 0 0 0 11 14z"></path></svg><svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="21" height="21" viewBox="0 0 21 21" fill="none" class="absolute bottom-6 right-6 size-5 rotate-180 text-[#D9C2FF] md:bottom-8 md:right-8"><path d="M19.4661 9.58712C19.466 9.4839 19.4373 9.38273 19.3831 9.29488C19.3289 9.20703 19.2514 9.13594 19.1592 9.08953L15.2511 7.13147L13.2972 3.2157C13.1083 2.83826 12.4921 2.83826 12.3036 3.2157L10.3497 7.13147L6.44156 9.08953C6.34885 9.13551 6.27082 9.20647 6.21627 9.29441C6.16172 9.38236 6.13281 9.4838 6.13281 9.5873C6.13281 9.69079 6.16172 9.79223 6.21627 9.88018C6.27082 9.96813 6.34885 10.0391 6.44156 10.0851L10.3497 12.0431L12.3036 15.9589C12.3497 16.0512 12.4206 16.1288 12.5084 16.183C12.5961 16.2372 12.6973 16.266 12.8004 16.266C12.9035 16.266 13.0047 16.2372 13.0924 16.183C13.1802 16.1288 13.2511 16.0512 13.2972 15.9589L15.2511 12.0431L19.1592 10.0858C19.2516 10.0392 19.3291 9.96798 19.3833 9.87994C19.4375 9.79189 19.4662 9.69052 19.4661 9.58712Z" fill="#1F1F1F"></path><path d="M4.1235 5.15516L2.46852 4.46495C2.43161 4.44649 2.40058 4.41812 2.37888 4.38302C2.35719 4.34792 2.3457 4.30748 2.3457 4.26622C2.3457 4.22496 2.35719 4.18451 2.37888 4.14941C2.40058 4.11431 2.43161 4.08594 2.46852 4.06748L4.1235 3.37755L4.81348 1.72269C4.83191 1.68572 4.86029 1.65461 4.89542 1.63287C4.93055 1.61113 4.97105 1.59961 5.01237 1.59961C5.05369 1.59961 5.09419 1.61113 5.12932 1.63287C5.16445 1.65461 5.19283 1.68572 5.21126 1.72269L5.90125 3.37755L7.55622 4.06748C7.59313 4.08594 7.62416 4.11431 7.64586 4.14941C7.66755 4.18451 7.67904 4.22496 7.67904 4.26622C7.67904 4.30748 7.66755 4.34792 7.64586 4.38302C7.62416 4.41812 7.59313 4.44649 7.55622 4.46495L5.90125 5.15516L5.21126 6.81002C5.19283 6.84699 5.16445 6.8781 5.12932 6.89984C5.09419 6.92158 5.05369 6.9331 5.01237 6.9331C4.97105 6.9331 4.93055 6.92158 4.89542 6.89984C4.86029 6.8781 4.83191 6.84699 4.81348 6.81002L4.1235 5.15516Z" fill="#C2C2C2"></path><path d="M3.73302 17.5998L1.25063 16.5645C1.19527 16.5368 1.14871 16.4942 1.11618 16.4416C1.08364 16.389 1.06641 16.3283 1.06641 16.2664C1.06641 16.2045 1.08364 16.1438 1.11618 16.0912C1.14871 16.0385 1.19527 15.996 1.25063 15.9683L3.73302 14.9334L4.76797 12.4512C4.79561 12.3958 4.83817 12.3491 4.89087 12.3165C4.94357 12.2839 5.00431 12.2666 5.06629 12.2666C5.12826 12.2666 5.18901 12.2839 5.24171 12.3165C5.2944 12.3491 5.33696 12.3958 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text-base font-semibold text-primary-fg transition-opacity hover:opacity-90 md:px-8" href="/skills">Explore all skills<svg xmlns="http://www.w3.org/2000/svg" width="24" height="24" viewBox="0 0 24 24" fill="none" stroke="currentColor" stroke-width="2" stroke-linecap="round" stroke-linejoin="round" class="lucide lucide-arrow-right size-4" aria-hidden="true"><path d="M5 12h14"></path><path d="m12 5 7 7-7 7"></path></svg></a></div></div></div></div></div></div></div><div class="footer relative flex flex-col px-6 pb-[90px] pt-[64px] font-sans-title text-sm bg-card sm:px-[8%] md:pt-[80px] md:text-base"><div class="footer-overview-halo-mask" aria-hidden="true"><div class="footer-overview-halo"></div></div><div class="footer-content relative z-[1] mx-auto mt-4 flex w-full max-w-[1440px] flex-col gap-8 lg:flex-row"><div class="mb-8 min-w-0 flex-1 md:mb-0 lg:max-w-[320px] text-[rgba(0,0,0,0.88)]"><svg width="118" height="20" viewBox="0 0 118 20" fill="none" 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2xl:whitespace-nowrap text-[rgba(0,0,0,0.6)]" href="/fr-FR/abti"><span class="inline-flex items-center gap-1.5">Test de personnalité ABTI</span></a></div></div><div class="min-w-0"><div class="mb-[16px] text-base font-semibold">Produit</div><div class="flex flex-col gap-[20px] text-sm"><a class="break-words 2xl:whitespace-nowrap text-[rgba(0,0,0,0.6)]" href="/fr-FR/skills"><span class="inline-flex items-center gap-1.5">Skills</span></a><a class="break-words 2xl:whitespace-nowrap text-[rgba(0,0,0,0.6)]" href="/fr-FR#download"><span class="inline-flex items-center gap-1.5">Extension</span></a><a class="break-words 2xl:whitespace-nowrap text-[rgba(0,0,0,0.6)]" href="/fr-FR#download"><span class="inline-flex items-center gap-1.5">App</span></a><a class="break-words 2xl:whitespace-nowrap text-[rgba(0,0,0,0.6)]" href="/fr-FR/pricing"><span class="inline-flex items-center gap-1.5">Tarifs</span></a><a class="break-words 2xl:whitespace-nowrap text-[rgba(0,0,0,0.6)]" href="/fr-FR/blog"><span 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query 在 PubMed / NCBI E-utilities 做可复现初筛，再用 PMID 去重和摘要证据分级；只有少量关键文献进入 PMC / BioC 全文复核；正文引用必须可点击；文末必须列完整文献信息；IF 只能通过公开可访问来源保守核查，不能默认有 JCR 或本地数据库，不能猜，不能把低置信匹配当成确定结果。\n\n1. 用户发起检索后的预处理\n1.1 先解析用户问题\n收到用户问题后，先把自然语言问题拆成结构化要素。\n必须识别：\n• 研究对象：基因、蛋白、药物、通道、细胞类型、组织、疾病、模型。\n• 生物系统：人、小鼠、大鼠、斑马鱼、类器官、视网膜、脑区、细胞系等。\n• 关系类型：表达、调控、功能、机制、表型、死亡、生存、治疗、毒性、发育、退化等。\n• 证据需求：是否需要直接证据、机制证据、全文证据、图表、剂量参数、实验方法。\n• 时间范围：不限时间、近 5 年、近 1 年、最新进展、经典文献。\n• 输出类型：简答、代表文献、综述式总结、实验设计建议、证据表、机制图谱。\n示例：\n用户问题：\n“帮我找视网膜类器官死亡相关文献。”\n结构化拆解（示例）：\n• 核心模型：retinal organoid, retina organoid, hPSC-derived retinal organoid, optic cup organoid。\n• 表型：cell death, apoptosis, degeneration, survival loss, stress, necrosis。\n• 相关细胞：photoreceptor, cone, rod, retinal ganglion cell, Müller glia。\n• 潜在机制：oxidative stress, ER stress, mitochondrial dysfunction, hypoxia, inflammation, ferroptosis, necroptosis。\n• 证据目标：优先找直接在人源或动物源 retinal organoid 中观察到细胞死亡/凋亡/退化的原始研究；再找间接机制文献。\n1.2 关键词拆分原则（示例）\n不要只写一个检索式。每个概念至少准备三类词。\n第一类：精确词。\n"])</script><script>self.__next_f.push([1,"• retinal organoid\n• retina organoid\n• human retinal organoid\n• hPSC-derived retinal organoid\n• iPSC-derived retinal organoid\n第二类：同义词和上位词。\n• optic cup organoid\n• 3D retinal culture\n• stem cell-derived retina\n• retinal differentiation\n• retinal tissue model\n第三类：机制和表型词。\n• apoptosis\n• cell death\n• degeneration\n• survival\n• stress\n• oxidative stress\n• ER stress\n• mitochondrial dysfunction\n• hypoxia\n• necroptosis\n• ferroptosis\n如果用户限定细胞类型，加入：\n• photoreceptor\n• cone\n• rod\n• retinal ganglion cell\n• Müller glia\n• bipolar cell\n• amacrine cell\n如果用户限定物种或来源，加入：\n• human\n• mouse\n• rat\n• zebrafish\n• hESC\n• iPSC\n• pluripotent stem cell\n1.3 生成分层检索式\n至少生成 3–6 组 query。每组 query 对应一个检索目的。\n第一层：直接证据检索。\n用于找目标模型 + 目标表型直接命中的文献。\n```text\n(\"retinal organoid\" OR \"retina organoid\" OR \"human retinal organoid\") AND (apoptosis OR \"cell death\" OR degeneration)\n```\n第二层：扩展模型检索。\n用于捕捉作者没有使用 retinal organoid 精确词但实际相关的文献。\n```text\n(\"optic cup organoid\" OR \"3D retinal culture\" OR \"stem cell-derived retina\") AND (survival OR apoptosis OR stress)\n```\n第三层：机制专项检索。\n用于验证具体通路或机制。\n```text\n(\"retinal organoid\" OR \"retina organoid\") AND (\"oxidative stress\" OR \"ER stress\" OR hypoxia OR mitochondria)\n```\n第四层：细胞类型专项检索。\n```text\n(\"retinal organoid\" OR \"retina organoid\") AND (photoreceptor OR cone OR rod OR \"retinal ganglion cell\") AND (death OR apoptosis OR degeneration)\n```\n第五层：疾病模型检索。\n```text\n(\"retinal organoid\" OR \"retina organoid\") AND (disease OR degeneration OR dystrophy OR retinitis OR glaucoma)\n```\n第六层：综述/背景检索。\n```text\n(\"retinal organoid\" OR \"retina organoid\") AND (review OR protocol OR model)\n```39:T12a5,\u003cp\u003e这套流程的核心是：先用多 query 在 PubMed / NCBI E-utilities 做可复现初筛，再用 PMID 去重和摘要证据分级；只有少量关键文献进入 PMC / BioC 全文复核；正文引用必须可点击；文末必须列完整文献信息；IF 只能通过公开可访问来源保守核查，不能默认有 JCR 或本地数据库，不能猜，不能把低置信匹配当成确定结果。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e1. 用户发起检索后的预处理\u003c/p\u003e\u003cp\u003e1.1 先解析用户问题\u003c/p\u003e\u003cp\u003e收到用户问题后，先把自然语言问题拆成结构化要素。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e必须识别：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 研究对象：基因、蛋白、药物、通道、细胞类型、组织、疾病、模型。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 生物系统：人、小鼠、大鼠、斑马鱼、类器官、视网膜、脑区、细胞系等。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 关系类型：表达、调控、功能、机制、表型、死亡、生存、治疗、毒性、发育、退化等。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 证据需求：是否需要直接证据、机制证据、全文证据、图表、剂量参数、实验方法。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 时间范围：不限时间、近 5 年、近 1 年、最新进展、经典文献。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 输出类型：简答、代表文献、综述式总结、实验设计建议、证据表、机制图谱。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e示例：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e用户问题：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e“帮我找视网膜类器官死亡相关文献。”\u003c/p\u003e\u003cp\u003e结构化拆解（示例）：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 核心模型：retinal organoid, retina organoid, hPSC-derived retinal organoid, optic cup organoid。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 表型：cell death, apoptosis, degeneration, survival loss, stress, necrosis。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 相关细胞：photoreceptor, cone, rod, retinal ganglion cell, Müller glia。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 潜在机制：oxidative stress, ER stress, mitochondrial dysfunction, hypoxia, inflammation, ferroptosis, necroptosis。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 证据目标：优先找直接在人源或动物源 retinal organoid 中观察到细胞死亡/凋亡/退化的原始研究；再找间接机制文献。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e1.2 关键词拆分原则（示例）\u003c/p\u003e\u003cp\u003e不"])</script><script>self.__next_f.push([1,"要只写一个检索式。每个概念至少准备三类词。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第一类：精确词。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• retinal organoid\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• retina organoid\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• human retinal organoid\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• hPSC-derived retinal organoid\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• iPSC-derived retinal organoid\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第二类：同义词和上位词。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• optic cup organoid\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 3D retinal culture\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• stem cell-derived retina\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• retinal differentiation\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• retinal 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stress)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第三层：机制专项检索。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e用于验证具体通路或机制。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e(\u0026quot;retinal organoid\u0026quot; OR \u0026quot;retina organoid\u0026quot;) AND (\u0026quot;oxidative stress\u0026quot; OR \u0026quot;ER stress\u0026quot; OR hypoxia OR mitochondria)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第四层：细胞类型专项检索。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e(\u0026quot;retinal organoid\u0026quot; OR \u0026quot;retina organoid\u0026quot;) AND (photoreceptor OR cone OR rod OR \u0026quot;retinal ganglion cell\u0026quot;) AND (death OR apoptosis OR degeneration)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第五层：疾病模型检索。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e(\u0026quot;retinal organoid\u0026quot; OR \u0026quot;retina organoid\u0026quot;) AND (disease OR degeneration OR dystrophy OR retinitis OR glaucoma)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第六层：综述/背景检索。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e(\u0026quot;retinal organoid\u0026quot; OR \u0026quot;retina organoid\u0026quot;) AND (review OR protocol OR model)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e3a:T1a5b,\u003cp\u003eCe processus repose sur trois piliers : premièrement, l’utilisation de plusieurs requêtes pour effectuer un premier tri reproductible dans les utilitaires électroniques PubMed/NCBI ; deuxièmement, l’utilisation de PMID pour la déduplication et l’évaluation des preuves dans les résumés ; seul un petit nombre de documents clés sont soumis à l’examen du texte intégral dans PMC/BioC ; les citations dans le texte doivent être cliquables ; les informations bibliographiques complètes doivent figurer à la fin de l’article ; le facteur d’impact (FI) ne peut être vérifié qu’avec prudence à partir de sources accessibles au public et ne peut être présumé présent dans le JCR ou les bases de données locales, ni être deviné, et les correspondances de faible confiance ne peuvent être considérées comme des résultats définitifs.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1. Prétraitement après qu'un utilisateur a initié une recherche\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1.1 Tout d'abord, analysez la question de l'utilisateur.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Après réception de la question d'un utilisateur, celle-ci, formulée en langage naturel, est d'abord décomposée en éléments structurés.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Doit être identifié :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Sujets de recherche : gènes, protéines, médicaments, canaux, types cellulaires, tissus, maladies et modèles.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Systèmes biologiques : h"])</script><script>self.__next_f.push([1,"umains, souris, rats, poissons-zèbres, organoïdes, rétine, régions du cerveau, lignées cellulaires, etc.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Types de relations : expression, régulation, fonction, mécanisme, phénotype, mort, survie, traitement, toxicité, développement, dégénérescence, etc.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Exigences en matière de preuves : Sont-elles requises des preuves directes, des preuves mécanistiques, des preuves en texte intégral, des graphiques, des paramètres de dosage et des méthodes expérimentales ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Période : illimitée, les 5 dernières années, la dernière année, les développements les plus récents et la littérature classique.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Types de résultats : réponse courte, littérature représentative, résumé de l’analyse, suggestions de conception expérimentale, tableau des preuves, schéma du mécanisme.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Exemple:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Problème utilisateur :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e « Veuillez m'aider à trouver de la documentation relative à la mort des organoïdes rétiniens. »\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Décomposition structurée (exemple) :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Modèles de base : organoïde rétinien, organoïde de rétine, organoïde rétinien dérivé de hPSC, organoïde de la cupule optique.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Phénotype : mort cellulaire, apoptose, dégénérescence, perte de survie, stress, nécrose.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Cellules apparentées : photorécepteur, cône, bâtonnet, cellule ganglionnaire rétinienne, glie de Müller.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Mécanismes potentiels : stress oxydatif, stress du réticulum endoplasmique, dysfonctionnement mitochondrial, hypoxie, inflammation, ferroptose, nécroptose.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Objectifs de recherche de preuves : Prioriser les études originales qui observent directement la mort cellulaire/l'apoptose/la dégénérescence dans les organoïdes rétiniens humains ou animaux ; puis rechercher des publications sur les mécanismes indirects.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1.2 Principes de segmentation par mots clés (Exemple)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Ne vous contentez pas d'une seule requête de recherche. Préparez au moins trois catégories de termes pour chaque concept.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Catégorie 1 : Mots précis.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • organoïde rétinien\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • organoïde rétinien\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • organoïde rétinien humain\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Organoïde rétinien dérivé de hPSC\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Organoïde rétinien dérivé de cellules iPSC\u003c/p\u003e\u003cp\u003e La deuxième catégorie : les synonymes et les hyperonymes.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • organoïde de la cupule optique\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Culture rétinienne 3D\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • rétine dérivée de cellules souches\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Différenciation rétinienne\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Modèle de tissu rétinien\u003c/p\u003e\u003cp\u003e La troisième catégorie : termes liés au mécanisme et au phénotype.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • apoptose\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • mort cellulaire\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • dégénérescence\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • survie\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • stresser\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • stress oxydatif\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Stress des ER\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • dysfonctionnement mitochondrial\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • hypoxie\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • nécroptose\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • ferroptose\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si l'utilisateur spécifie le type de cellule, ajoutez :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • photorécepteur\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • cône\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • tige\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • cellule ganglionnaire rétinienne\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Müller glia\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • cellule bipolaire\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • cellule amacrine\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si l'utilisateur précise l'espèce ou l'origine, ajoutez :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • humain\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • souris\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • rat\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • poisson-zèbre\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • cellules souches embryonnaires humaines\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • iPSC\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • cellules souches pluripotentes\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1.3 Génération de requêtes de recherche hiérarchiques\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Générez au moins 3 à 6 requêtes. Chaque requête correspond à un objectif de recherche.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Première étape : Collecte directe des preuves.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Utilisé pour trouver la littérature qui correspond directement au modèle et au phénotype cibles.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e (\"organoïde rétinien\" OU \"organoïde de la rétine\" OU \"organoïde rétinien humain\") ET (apoptose OU \"mort cellulaire\" OU dégénérescence)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Deuxième couche : Récupération de modèle étendue.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Utilisé pour recenser les publications où l'auteur n'utilise pas le terme préc"])</script><script>self.__next_f.push([1,"is « organoïde rétinien », mais où celui-ci est en réalité pertinent.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e (« organoïde de la coupe optique » OU « culture rétinienne 3D » OU « rétine dérivée de cellules souches ») ET (survie OU apoptose OU stress)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Troisième niveau : Recherche spécifique au mécanisme.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Utilisé pour vérifier des voies ou des mécanismes spécifiques.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e (« organoïde rétinien » OU « organoïde de la rétine ») ET (« stress oxydatif » OU « stress du RE » OU hypoxie OU mitochondries)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Quatrième niveau : Recherche spécifique au type cellulaire.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e (« organoïde rétinien » OU « organoïde de la rétine ») ET (photorécepteur OU cône OU bâtonnet OU « cellule ganglionnaire rétinienne ») ET (mort OU apoptose OU dégénérescence)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Cinquième niveau : Récupération du modèle de maladie.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e (« organoïde rétinien » OU « organoïde de la rétine ») ET (maladie OU dégénérescence OU dystrophie OU rétinite OU glaucome)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Sixième niveau : Examen/Recherche de renseignements.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e (\"organoïde rétinien\" OU \"organoïde de la rétine\") ET (revue OU protocole OU modèle)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e3b:T10ea,2. 使用什么方法、在什么网站检索\n2.1 首选：PubMed / NCBI E-utilities\nPubMed 是生物医学文献检索首选。不要默认抓 PubMed 网页。应使用 NCBI E-utilities API。\n2.1.1 ESearch：用 query 获取 PMID\n接口：\n```text\nhttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi\n```\n参数：\n```text\ndb=pubmed\nterm=\u003c检索式\u003e\nretmode=json\nretmax=20\nsort=relevance\n```\n也可按时间排序：\n```text\nsort=pub+date\n```\n示例：\n```text\nhttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pubmed\u0026term=(%22retinal%20organoid%22%20OR%20%22retina%20organoid%22)%20AND%20(apoptosis%20OR%20%22cell%20death%22)\u0026retmode=json\u0026retmax=20\u0026sort=relevance\n```\n返回中读取：\n```text\nesearchresult.idlist\n```\n这就是 PMID 列表。\n2.1.2 ESummary：获取文献 metadata\n接口：\n```text\nhttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi\n```\n参数：\n```text\ndb=pubmed\nid=PMID1,PMID2,PMID3\nretmode=json\n```\n提取字段：\n• PMID\n• title\n• fulljournalname\n• source / journal abbreviation\n• pubdate\n• authors\n• articleids 中的 DOI、PMCID\n• volume、issue、pages\n2.1.3 EFetch：获取摘要和 XML 细节\n接口：\n```text\nhttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi\n```\n参数：\n```text\ndb=pubmed\nid=PMID1,PMID2\nretmode=xml\nrettype=abstract\n```\n提取字段：\n• ArticleTitle\n• AbstractText\n• Journal Title\n• ISOAbbreviation\n• ISSN / eISSN\n• PubDate\n• DOI\n• PMCID\n• MeSH terms\n2.1.4 批量检索策略\n推荐流程：\n1. 对每个 query 调用 ESearch。\n2. 每个 query 取前 5–20 篇。\n3. 合并所有 PMID。\n4. 按 PMID 去重。\n5. 用 ESummary / EFetch 批量获取 metadata 和 abstract。\n6. 初筛阶段只读 metadata + abstract，不要一开始抓全文。\n────────────────\n2.2 第二阶段：PMC / BioC 全文复核\n只有以下情况才进入全文：\n• 用户要求精读全文。\n• 摘要不足以判断机制。\n• 需要图表、实验方法、浓度、剂量、IC50、EC50、Kd、Ki。\n• 已筛出少量关键 PMID，需要逐篇机制复核。\n2.2.1 PMID 转 PMCID\n接口：\n```text\nhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/utils/idconv/v1.0/?ids=\u003cPMID\u003e\u0026format=json\n```\n如果返回 PMCID，说明可能有 PMC 开放全文。\n2.2.2 优先 BioC JSON\n接口：\n```text\nhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/bionlp/RESTful/pmcoa.cgi/BioC_json/\u003cPMCID\u003e/unicode\n```\n优点：结构化程度高，适合抽取正文段落。\n2.2.3 BioC 不可用时尝试 PMC XML\n接口：\n```text\nhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/\u003cPMCID\u003e/?report=xml\n```\n抽取正文时跳过：\n• references\n• bibliography\n• acknowledgements\n• author contributions\n• competing interests\n全文复核必须设置停止判据：\n• 每篇文献只扫描一次。\n•"])</script><script>self.__next_f.push([1," 默认只抽取与问题相关的段落。\n• 如果未命中目标字段，标注“未见直接证据”。\n• 不要无限换关键词重复抓取。\n────────────────\n2.3 bioRxiv / medRxiv\n用于补充最新预印本。\n可以使用官方 API：\n```text\nhttps://api.biorxiv.org/details/biorxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD\nhttps://api.biorxiv.org/details/medrxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD\n```\n也可用普通搜索作为补充：\n```text\nsite:biorxiv.org retinal organoid apoptosis\nsite:medrxiv.org retina organoid degeneration\n```\n预印本必须标注：\n```text\n预印本，未经同行评议。\n```\n────────────────\n2.4 Crossref / OpenAlex / Unpaywall\n用于补全 DOI、开放全文地址、出版信息。\nCrossref：\n```text\nhttps://api.crossref.org/works?query.title=\u003ctitle\u003e\n```\nOpenAlex：\n```text\nhttps://api.openalex.org/works?search=\u003ctitle or topic\u003e\n```\nUnpaywall：\n```text\nhttps://api.unpaywall.org/v2/\u003cDOI\u003e?email=\u003cyour_email\u003e\n```\n用途：\n• DOI 补全。\n• OA PDF 链接查找。\n• 期刊名核验。\n• 出版年份核验。\n────────────────\n2.5 出版商页面\n只有在 API 信息不足时才访问出版商页面。\n访问规则：\n• 每个出版商 URL 只尝试一次。\n• 遇到验证码、登录墙、Cloudflare、Access Denied、机构权限墙，立即停止。\n• 不要反复刷新、换同站路径、循环等待。\n• 改用 PubMed、PMC、Crossref、OpenAlex、Unpaywall、DOI metadata 兜底。3c:T14e9,\u003cp\u003e2. 使用什么方法、在什么网站检索\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.1 首选：PubMed / NCBI E-utilities\u003c/p\u003e\u003cp\u003ePubMed 是生物医学文献检索首选。不要默认抓 PubMed 网页。应使用 NCBI E-utilities API。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.1.1 ESearch：用 query 获取 PMID\u003c/p\u003e\u003cp\u003e接口：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e参数：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003edb=pubmed\u003c/p\u003e\u003cp\u003eterm=\u0026lt;检索式\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003eretmode=json\u003c/p\u003e\u003cp\u003eretmax=20\u003c/p\u003e\u003cp\u003esort=relevance\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e也可按时间排序：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003esort=pub+date\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e示例：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pubmed\u0026amp;term=(%22retinal%20organoid%22%20OR%20%22retina%20organoid%22)%20AND%20(apoptosis%20OR%20%22cell%20death%22)\u0026amp;retmode=json\u0026amp;retmax=20\u0026amp;sort=relevance\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e返回中读取：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eesearchresult.idlist\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e这就是 PMID 列表。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.1.2 ESummary：获取文献 metadata\u003c/p\u003e\u003cp\u003e接口：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e参数：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003edb=pubmed\u003c/p\u003e\u003cp\u003eid=PMID1,PMID2,PMID3\u003c/p\u003e\u003cp\u003eretmode=json\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e提取字段：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• PMID\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• title\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• fulljournalname\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• source / journal abbreviation\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• pubdate\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• authors\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• articleids 中的 DOI、PMCID\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• volume、issue、pages\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.1.3 EFetch：获取摘要和 XML 细节\u003c/p\u003e\u003cp\u003e接口：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e参数：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003edb=pubmed\u003c/p\u003e\u003cp\u003eid=PMID1,PMID2\u003c/p\u003e\u003cp\u003eretmode=xml\u003c/p\u003e\u003cp\u003erettype=abstract\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e提取字段：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• ArticleTitle\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• AbstractText\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• Journal Title\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• ISOAbbreviation\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• ISSN / eISSN\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• PubDate\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• DOI\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• PMCID\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• MeSH terms\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.1.4 批量检索策略\u003c/p\u003e\u003cp\u003e推荐流程：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e1. 对每个 query 调用 ESearch。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2. 每个 query 取前 5–20 篇。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e3. 合并所有 PMID。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e4. 按 PMID 去重。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e5. 用 ESummary / EFetch 批量获取 metadata 和 abstract。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e6. 初筛阶段只读 metadata + abstract，不要一开始抓全文。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e────────────────\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.2 第二阶段：PMC / BioC 全文复核\u003c/p\u003e\u003cp\u003e只有以下情况才进入全文：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 用户要求精读全文。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 摘要不足以判断机制。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 需要图表、实验方法、浓度、剂量、IC50、E"])</script><script>self.__next_f.push([1,"C50、Kd、Ki。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 已筛出少量关键 PMID，需要逐篇机制复核。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.2.1 PMID 转 PMCID\u003c/p\u003e\u003cp\u003e接口：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/utils/idconv/v1.0/?ids=\u0026lt;PMID\u0026gt;\u0026amp;format=json\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果返回 PMCID，说明可能有 PMC 开放全文。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.2.2 优先 BioC JSON\u003c/p\u003e\u003cp\u003e接口：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/bionlp/RESTful/pmcoa.cgi/BioC_json/\u0026lt;PMCID\u0026gt;/unicode\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e优点：结构化程度高，适合抽取正文段落。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.2.3 BioC 不可用时尝试 PMC XML\u003c/p\u003e\u003cp\u003e接口：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/\u0026lt;PMCID\u0026gt;/?report=xml\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e抽取正文时跳过：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• references\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• bibliography\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• acknowledgements\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• author contributions\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• competing interests\u003c/p\u003e\u003cp\u003e全文复核必须设置停止判据：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 每篇文献只扫描一次。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 默认只抽取与问题相关的段落。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 如果未命中目标字段，标注“未见直接证据”。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 不要无限换关键词重复抓取。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e────────────────\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.3 bioRxiv / medRxiv\u003c/p\u003e\u003cp\u003e用于补充最新预印本。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e可以使用官方 API：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://api.biorxiv.org/details/biorxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://api.biorxiv.org/details/medrxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e也可用普通搜索作为补充：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003esite:biorxiv.org retinal organoid apoptosis\u003c/p\u003e\u003cp\u003esite:medrxiv.org retina organoid degeneration\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e预印本必须标注：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e预印本，未经同行评议。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e────────────────\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.4 Crossref / OpenAlex / Unpaywall\u003c/p\u003e\u003cp\u003e用于补全 DOI、开放全文地址、出版信息。\u003c/p\u003e\u003cp\u003eCrossref：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://api.crossref.org/works?query.title=\u0026lt;title\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003eOpenAlex：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://api.openalex.org/works?search=\u0026lt;title or topic\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003eUnpaywall：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://api.unpaywall.org/v2/\u0026lt;DOI\u0026gt;?email=\u0026lt;your_email\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e用途：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• DOI 补全。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• OA PDF 链接查找。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 期刊名核验。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 出版年份核验。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e────────────────\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2.5 出版商页面\u003c/p\u003e\u003cp\u003e只有在 API 信息不足时才访问出版商页面。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e访问规则：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 每个出版商 URL 只尝试一次。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 遇到验证码、登录墙、Cloudflare、Access Denied、机构权限墙，立即停止。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 不要反复刷新、换同站路径、循环等待。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 改用 PubMed、PMC、Crossref、OpenAlex、Unpaywall、DOI metadata 兜底。\u003c/p\u003e3d:T1b22,\u003cp\u003e2. Quelles méthodes et quels sites web ont été utilisés pour la recherche ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.1 Outils préférés : PubMed / NCBI E-utilities\u003c/p\u003e\u003cp\u003e PubMed est l'outil privilégié pour la recherche de littérature biomédicale. Évitez d'utiliser systématiquement l'extraction de données des pages PubMed. Privilégiez plutôt l'API NCBI E-utilities.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.1.1 ESearch : Récupération du PMID à l’aide d’une requête\u003c/p\u003e\u003cp\u003e interface:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e paramètre:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e db=publié\u003c/p\u003e\u003cp\u003e terme=\u003cterme de recherche\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e retmode=json\u003c/p\u003e\u003cp\u003e retmax=20\u003c/p\u003e\u003cp\u003e trier=pertinence\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Vous pouvez également trier par date :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e trier=publication+date\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Exemple:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=pubmed\u0026term=(%22retinal%20organoid%22%20OR%20%22retina%20organoid%22)%20AND%20(apoptosis%20OR%20%22cell%20death%22)\u0026retmode=json\u0026retmax=20\u0026sort=relevance\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Lisez le texte de retour :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e esearchresult.idlist\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Voici la liste des PMID.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.1.2 ESummary : Obtention des métadonnées de la littérature\u003c/p\u003e\u003cp\u003e interface:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```tex"])</script><script>self.__next_f.push([1,"t\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e paramètre:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e db=publié\u003c/p\u003e\u003cp\u003e id=PMID1,PMID2,PMID3\u003c/p\u003e\u003cp\u003e retmode=json\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Champs extraits :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • PMID\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • titre\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • nom complet du journal\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • abréviation de la source/de la revue\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • date de publication\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • auteurs\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • DOI et PMCID dans les identifiants d'article\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • volume, numéro, pages\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.1.3 EFetch : Récupération du résumé et des détails XML\u003c/p\u003e\u003cp\u003e interface:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e paramètre:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e db=publié\u003c/p\u003e\u003cp\u003e id=PMID1,PMID2\u003c/p\u003e\u003cp\u003e retmode=xml\u003c/p\u003e\u003cp\u003e rettype=abstrait\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Champs extraits :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Titre de l'article\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Texte abstrait\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Titre de la revue\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Abréviation ISO\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • ISSN / eISSN\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Date de publication\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • DOI\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • PMCID\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Termes MeSH\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.1.4 Stratégie de récupération par lots\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Processus recommandé :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1. Appelez ESearch pour chaque requête.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2. Pour chaque requête, sélectionnez les 5 à 20 premiers résultats.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 3. Fusionner tous les PMID.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 4. Utilisez PMID pour supprimer les doublons.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 5. Utilisez ESummary / EFetch pour récupérer les métadonnées et les données abstraites par lots.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 6. Lors de la phase de sélection initiale, ne lisez que les métadonnées et le résumé ; ne commencez pas par lire le texte intégral.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ────────────────\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.2 Deuxième phase : Examen complet des documents PMC/BioC\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Le texte intégral ne sera inclus que dans les cas suivants :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Les utilisateurs demandent à lire attentivement le texte intégral.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Le résumé est insuffisant pour déterminer le mécanisme.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Nécessite des graphiques, des méthodes expérimentales, des concentrations, des dosages, IC50, EC50, Kd et Ki.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Un petit nombre de PMID clés ont été identifiés et nécessitent un examen au cas par cas.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.2.1 PMID vers PMCID\u003c/p\u003e\u003cp\u003e interface:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/utils/idconv/v1.0/?ids=\u003cPMID\u003e\u0026format=json\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si le PMCID est renvoyé, cela signifie que le PMC peut avoir un accès au texte intégral.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.2.2 Prioriser le JSON BioC\u003c/p\u003e\u003cp\u003e interface:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/bionlp/RESTful/pmcoa.cgi/BioC_json/\u003cPMCID\u003e/unicode\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Avantages : Très structuré, convient à l'extraction des principaux paragraphes du texte.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.2.3 Essayez PMC XML lorsque BioC n'est pas disponible\u003c/p\u003e\u003cp\u003e interface:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/\u003cPMCID\u003e/?report=xml\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Ignorer lors de l'extraction du texte principal :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • références\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • bibliographie\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Remerciements\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Contributions des auteurs\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • intérêts concurrents\u003c/p\u003e\u003cp\u003e L'examen du texte intégral doit inclure un critère d'arrêt :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Chaque document n'est scanné qu'une seule fois.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Par défaut, seuls les paragraphes relatifs à la question sont extraits.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Si le champ cible ne correspond pas, indiquez « Aucune preuve directe trouvée ».\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Évitez de récupérer des mots-clés de manière répétée.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ────────────────\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.3 bioRxiv / medRxiv\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Utilisé pour compléter les prépublications les plus récentes.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Vous pouvez utiliser l'API officielle :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://api.biorxiv.org/details/biorxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://api.biorxiv.org/details/medrxiv/YYYY-MM-DD/YYYY-MM-DD\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Vous pouvez également utiliser une recherche classique en complément :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e site:biorxiv.org apoptose des organoïdes rétiniens\u003c/p\u003e\u003cp\u003e site:medrxiv.org dégénérescence des organoïdes rétiniens\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Les prépublications doivent être "])</script><script>self.__next_f.push([1,"étiquetées :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Il s'agit d'une prépublication qui n'a pas encore été évaluée par des pairs.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ────────────────\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.4 Crossref/OpenAlex/Unpaywall\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Utilisé pour compléter le DOI, l'adresse d'accès au texte intégral et les informations de publication.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Crossref :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://api.crossref.org/works?query.title=\u003ctitle\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e OpenAlex :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://api.openalex.org/works?search=\u003ctitre ou sujet\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Dépaywall :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://api.unpaywall.org/v2/\u003cDOI\u003e?email=\u003cvotre_email\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e utiliser:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Achèvement du DOI.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Recherche de liens PDF OA.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Vérification du nom du journal.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Vérification de l'année de publication.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ────────────────\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2.5 Page de l'éditeur\u003c/p\u003e\u003cp\u003e N'accédez à la page de l'éditeur que lorsque les informations de l'API sont insuffisantes.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Règles d'accès :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Chaque URL d'éditeur ne sera testée qu'une seule fois.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Si vous rencontrez des CAPTCHA, des barrières de connexion, des messages Cloudflare, d'accès refusé ou des barrières d'accès institutionnelles, arrêtez immédiatement.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Évitez d’actualiser sans cesse, de changer de chemin d’accès au sein du même site ou de rester bloqué dans une boucle.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Utilisez les métadonnées PubMed, PMC, Crossref, OpenAlex, Unpaywall et DOI comme solution de repli.\u003c/p\u003e3e:T966,\u003cp\u003e3. Comment organiser les informations après leur récupération\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 3.1 Établir une structure d'enregistrement unifiée\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Chaque document est compilé dans un enregistrement unifié.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Champs :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e PMID\u003c/p\u003e\u003cp\u003e doi\u003c/p\u003e\u003cp\u003e pmcid\u003c/p\u003e\u003cp\u003e titre\u003c/p\u003e\u003cp\u003e auteurs\u003c/p\u003e\u003cp\u003e journal\u003c/p\u003e\u003cp\u003e abréviation du journal\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ISSN\u003c/p\u003e\u003cp\u003e eissn\u003c/p\u003e\u003cp\u003e année\u003c/p\u003e\u003cp\u003e abstrait\u003c/p\u003e\u003cp\u003e source de requête\u003c/p\u003e\u003cp\u003e niveau de preuve\u003c/p\u003e\u003cp\u003e balises de preuve\u003c/p\u003e\u003cp\u003e type_de_papier\u003c/p\u003e\u003cp\u003e URL\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 3.2 Déduplication\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Priorité:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1. Déduplication PMID.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2. Utilisez le DOI pour supprimer les doublons si le PMID n'est pas disponible.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 3. S'il n'y a pas de DOI, utilisez lower(title) + année + premier_auteur pour supprimer les doublons.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Conservez la source de requête qui a été utilisée la première fois et enregistrez les requêtes qui ont accédé au document.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 3.3 Classification des preuves\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Il est nécessaire de distinguer :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Preuve directe :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e L’espèce cible, le tissu, le type cellulaire, le modèle et les conditions de traitement sont parfaitement alignés.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Preuves indirectes :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Les systèmes adjacents, les modèles similaires et les mécanismes similaires sont pris en charge, mais il ne s'agit pas de systèmes destinés directement à résoudre les problèmes des utilisateurs.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Aucune preuve directe n'a été trouvée :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e On ne trouve que des informations générales, des spéculations, des analyses ou des modèles connexes ; il n'existe aucun résultat expérimental direct.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 3.4 Étiquetage des types de documents\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Il convient au moins de noter les points suivants :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • recherche originale\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • revoir\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • protocole\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • prépublication\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • ensemble de données/ressource\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • étude clinique\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • document de méthodologie\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 3.5 Règles de tri\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Tri recommandé :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1. Recherche originale fondée sur des preuves directes.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2. Recherche sur les mécanismes clés.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 3. Dernières recherches importantes.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 4. Études fondamentales classiques.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 5. Avis de haute qualité.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 6. Preuve indirecte.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Ne triez pas uniquement selon le facteur d'impact. Le facteur d'impact est un indicateur au niveau de la revue et ne reflète pas la qualité d'un article individuel.\u003c/p\u003e3f:T7bb,\u003cp\u003e4. Comment organiser les citations dans une réponse\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 4.1 Format de citation du texte\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Toutes les c"])</script><script>self.__next_f.push([1,"itations textuelles doivent être cliquables.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Format:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```markdown\u003c/p\u003e\u003cp\u003e [[1. **Journal**, Année]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Exemple:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```markdown\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Des études antérieures ont observé un stress et une dégénérescence des photorécepteurs liés au stade de développement dans les organoïdes rétiniens humains [[1. **Cell Stem Cell**, 2019]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/xxxxxxx/).\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Ne l'écrivez pas comme ceci :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e [1]\u003c/p\u003e\u003cp\u003e (PMID : xxxxx)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Voir la référence 1\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 4.2 Structure de réponse recommandée\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Premier paragraphe : Conclusion directe.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Conclusion : Des rapports pertinents ont été publiés, mais les preuves directes portent principalement sur… ; les preuves directes concernant… font encore défaut.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Deuxième paragraphe : Classification des preuves.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Preuve directe :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e - Référence A : ...\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Preuves indirectes :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e - Référence B : ...\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Aucune preuve directe n'a été trouvée :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e - Non trouvé lors de cette session...\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Troisième paragraphe : Résumé du mécanisme.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Regrouper par sujet, par exemple :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • voie d'apoptose/caspase\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • stress oxydatif\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • dysfonctionnement mitochondrial\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Stress des ER\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • hypoxie/stress métabolique\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • inflammation\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • inadéquation du développement\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Quatrième paragraphe : Lacune en matière de recherche.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Indiquez clairement les points qui manquent de preuves directes.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Cinquième paragraphe : Inspiration tirée de l'expérience.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si l'utilisateur a besoin d'un plan expérimental, veuillez fournir le marqueur, le dosage, le point temporel et le contrôle.\u003c/p\u003e40:T1831,6. IF 核查与标注\n6.1 先说明 IF 核查的现实限制\n正常情况下，官方 Journal Impact Factor 来自 Clarivate Journal Citation Reports（JCR）。但任意外部 Agent 通常没有 Clarivate/JCR 账号，也没有本地 JCR 表，所以不要通过这个路径核查。\n```\n6.2 IF skill 的实际方法\n主要路线：\n1. 如果输入是 PMID，先用 NCBI E-utilities 获取 PubMed metadata。\n- 获取 FullJournalName。 - 获取 Source / ISO abbreviation。 - 获取 ISSN / eISSN。 - 获取标题、年份、DOI 等辅助字段。\n2. 用公开的 iikx / 爱科学移动端 JSON 接口查询期刊。\n搜索接口：\n```text\nhttps://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci\u0026c=index\u0026a=info\u0026keyword=\u003cjournal_query\u003e\n```\n详情接口：\n```text\nhttps://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail\u0026id=\u003cid\u003e\u0026classid=\u003cclassid\u003e\n```\n3. 对搜索结果做保守匹配。\n- 优先 exact normalized journal title match。 - 其次 exact abbreviation match。 - 对短词和宽泛词非常谨慎。 - 不接受明显 substring 误配，例如 Nature 被误配成 Nature Reviews 系列。 - 如果匹配不稳，返回 ambiguous / not_found，而不是猜。\n4. 如果 PubMed 给的是缩写，尝试用 NLM Catalog 扩展为全称或 alternate title。\nNLM Catalog 搜索接口仍然是 NCBI E-utilities：\n```text\nhttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog\u0026term=\u003cabbr\u003e[Title Abbreviation]\u0026retmode=xml\u0026retmax=1\n```\n然后用 ESummary 取 Title / TitleAlternate。\n5. 从 iikx detail 结果中读取：\n- impact factor。 - IF 年份。 - JCR quartile。 - CAS / 中科院分区，如果有。 - source URL。 - match confidence。\n6. 标注时不把 IF 年份写进正文紧凑标注。\n最终标注只写：\n```text\n*｛IF＝X，Qn｝*\n```\n如果失败：\n```text\n*｛IF＝待核验｝*\n```\n或：\n```text\n*｛IF＝未检出｝*\n```\n6.3 具体步骤\n对每篇文献执行以下流程。\n第一步：准备期刊查询名。\n优先从 PubMed metadata 取：\n```text\nFullJournalName\nISOAbbreviation / Source\nISSN\neISSN\n```\n如果只有 DOI，则先用 Crossref 或 OpenAlex 取期刊名。\nCrossref：\n```text\nhttps://api.crossref.org/works/\u003cDOI\u003e\n```\nOpenAlex：\n```text\nhttps://api.openalex.org/wor"])</script><script>self.__next_f.push([1,"ks/https://doi.org/\u003cDOI\u003e\n```\n第二步：规范化期刊名。\n规范化规则：\n• 全部小写。\n• HTML unescape。\n• 将 \u0026 替换为 and。\n• 去除标点。\n• 多个空格合并。\n• 比较时可同时使用 compact 形式，即去除所有空格。\n示例伪代码：\n```python\nimport re, html\n \ndef norm(s):\n s = html.unescape(s or '').lower()\n s = re.sub(r'\u0026', ' and ', s)\n s = re.sub(r'[^a-z0-9]+', ' ', s)\n return re.sub(r'\\s+', ' ', s).strip()\n \ndef compact(s):\n return norm(s).replace(' ', '')\n```\n第三步：查询 iikx 搜索接口。\n```text\nhttps://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci\u0026c=index\u0026a=info\u0026keyword=\u003cjournal_query\u003e\n```\n建议设置 User-Agent，例如：\n```text\nMozilla/5.0\n```\n如果第一页没找到 exact match，可以有限翻页，例如最多 8 页。\n翻页参数通常为：\n```text\npage=2\npage=3\n```\n第四步：从搜索结果中选候选。\n候选字段通常包括：\n```text\nid\nclassid\ntitle\nsmalltitle\nIF 或 IF2024\nzky2020\nurl\n```\n匹配规则：\n• 如果 compact(query) == compact(candidate.title)，接受。\n• 如果 norm(query) == norm(candidate.title)，接受。\n• 如果 compact(query) == compact(candidate.smalltitle)，接受。\n• 如果 norm(query) == norm(candidate.smalltitle)，接受。\n• 如果只是 substring，不要直接接受，除非 query 足够长且无歧义。\n• 对 Nature、Science、Cell、Brain、Vision、Retina 等短词尤其谨慎。\n第五步：如果没有匹配，用 NLM Catalog 扩展缩写。\n例如 PubMed 里 Source 是：\n```text\nFree Radic Biol Med\n```\n可以查：\n```text\nhttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog\u0026term=Free%20Radic%20Biol%20Med%5BTitle%20Abbreviation%5D\u0026retmode=xml\u0026retmax=1\n```\n拿到 NLM Catalog ID 后，再用：\n```text\nhttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi?db=nlmcatalog\u0026id=\u003cid\u003e\u0026retmode=xml\n```\n读取：\n```text\nTitle\nTitleAlternate\n```\n然后用这些全称再查 iikx。\n第六步：查 iikx 详情接口。\n如果搜索结果里有：\n```text\nid=\u003cid\u003e\nclassid=\u003cclassid\u003e\n```\n调用：\n```text\nhttps://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail\u0026id=\u003cid\u003e\u0026classid=\u003cclassid\u003e\n```\n从 detail 中读取：\n```text\nIF2024, IF2023, IF2022 ...\nIF\nzky2020 或其他 JCR quartile 字段\njcr22 / jcr12 或分区字段\nissn\neissn\ntitle\nsmalltitle\ncategory\n```\n第七步：选择最新 IF。\n在返回字段中查找所有形如：\n```text\nIF20xx\n```\n例如：\n```text\nIF2024\nIF2023\nIF2022\n```\n选年份最大的有效数字。\n如果没有 IF20xx，则尝试读取：\n```text\nIF\nif_value\n```\n如果没有有效值，则标为未检出。\n第八步：输出置信度和标注。\n如果 exact title / abbreviation 命中，并且 detail 返回有效 IF：\n```text\n*｛IF＝X，Qn｝*\n```\n如果匹配不确定：\n```text\n*｛IF＝待核验｝*\n```\n如果公开接口没有结果：\n```text\n*｛IF＝未检出｝*\n```\n6.4 IF 标注格式\n固定格式：\n```text\n*｛IF＝X，Qn｝*\n```\n示例：\n```markdown\nSmith J et al., **Neuron** (2020), [PMID: 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *｛IF＝15.0，Q1｝*\n```\n注意：\n• IF 标注内部不写 JCR 年份。\n• 不写“2024 JCR IF”。\n• 不写“JCR 2024”。\n• 年份只保留在文献发表年份处。\n• 如果 IF 为 0.0、空值、来源不稳、匹配不稳，不展示数字。\n6.5 IF 核查失败时的标准处理\n不要猜。\n不要用期刊名印象补数字。\n不要用大模型记忆补 IF。\n失败时只允许三种状态：\n```text\n*｛IF＝待核验｝*\n```\n用于：\n• 搜索结果模糊。\n• 有多个相似期刊。\n• 只找到缩写但无法确认全称。\n• 公开来源返回的 IF 可疑。\n```text\n*｛IF＝未检出｝*\n```\n用于：\n• 公开接口没有结果。\n• 期刊不在 SCI / JCR 覆盖范围。\n• 新刊暂无 IF。\n```text\n*｛IF＝不可公开核验｝*\n```\n用于：\n• 用户要求必须官方 JCR，但当前 Agent 没有 Clarivate/JCR 权限。41:T1e64,\u003cp\u003e6. IF 核查与标注\u003c/p\u003e\u003cp\u003e6.1 先说明 IF 核查的现实限制\u003c/p\u003e\u003cp\u003e正常情况下，官方 Journal Impact "])</script><script>self.__next_f.push([1,"Factor 来自 Clarivate Journal Citation Reports（JCR）。但任意外部 Agent 通常没有 Clarivate/JCR 账号，也没有本地 JCR 表，所以不要通过这个路径核查。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e6.2 IF skill 的实际方法\u003c/p\u003e\u003cp\u003e主要路线：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e1. 如果输入是 PMID，先用 NCBI E-utilities 获取 PubMed metadata。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e- 获取 FullJournalName。 - 获取 Source / ISO abbreviation。 - 获取 ISSN / eISSN。 - 获取标题、年份、DOI 等辅助字段。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2. 用公开的 iikx / 爱科学移动端 JSON 接口查询期刊。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e搜索接口：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci\u0026amp;c=index\u0026amp;a=info\u0026amp;keyword=\u0026lt;journal_query\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e详情接口：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail\u0026amp;id=\u0026lt;id\u0026gt;\u0026amp;classid=\u0026lt;classid\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e3. 对搜索结果做保守匹配。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e- 优先 exact normalized journal title match。 - 其次 exact abbreviation match。 - 对短词和宽泛词非常谨慎。 - 不接受明显 substring 误配，例如 Nature 被误配成 Nature Reviews 系列。 - 如果匹配不稳，返回 ambiguous / not_found，而不是猜。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e4. 如果 PubMed 给的是缩写，尝试用 NLM Catalog 扩展为全称或 alternate title。\u003c/p\u003e\u003cp\u003eNLM Catalog 搜索接口仍然是 NCBI E-utilities：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog\u0026amp;term=\u0026lt;abbr\u0026gt;[Title Abbreviation]\u0026amp;retmode=xml\u0026amp;retmax=1\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e然后用 ESummary 取 Title / TitleAlternate。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e5. 从 iikx detail 结果中读取：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e- impact factor。 - IF 年份。 - JCR quartile。 - CAS / 中科院分区，如果有。 - source URL。 - match confidence。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e6. 标注时不把 IF 年份写进正文紧凑标注。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e最终标注只写：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e*｛IF＝X，Qn｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果失败：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e*｛IF＝待核验｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e或：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e*｛IF＝未检出｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e6.3 具体步骤\u003c/p\u003e\u003cp\u003e对每篇文献执行以下流程。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第一步：准备期刊查询名。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e优先从 PubMed metadata 取：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eFullJournalName\u003c/p\u003e\u003cp\u003eISOAbbreviation / Source\u003c/p\u003e\u003cp\u003eISSN\u003c/p\u003e\u003cp\u003eeISSN\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果只有 DOI，则先用 Crossref 或 OpenAlex 取期刊名。\u003c/p\u003e\u003cp\u003eCrossref：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://api.crossref.org/works/\u0026lt;DOI\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003eOpenAlex：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://api.openalex.org/works/https://doi.org/\u0026lt;DOI\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第二步：规范化期刊名。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e规范化规则：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 全部小写。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• HTML unescape。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 将 \u0026amp; 替换为 and。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 去除标点。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 多个空格合并。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 比较时可同时使用 compact 形式，即去除所有空格。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e示例伪代码：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```python\u003c/p\u003e\u003cp\u003eimport re, html\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003edef norm(s):\u003c/p\u003e\u003cp\u003e s = html.unescape(s or \u0026apos;\u0026apos;).lower()\u003c/p\u003e\u003cp\u003e s = re.sub(r\u0026apos;\u0026amp;\u0026apos;, \u0026apos; and \u0026apos;, s)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e s = re.sub(r\u0026apos;[^a-z0-9]+\u0026apos;, \u0026apos; \u0026apos;, s)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e return re.sub(r\u0026apos;\\s+\u0026apos;, \u0026apos; \u0026apos;, s).strip()\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003edef compact(s):\u003c/p\u003e\u003cp\u003e return norm(s).replace(\u0026apos; \u0026apos;, \u0026apos;\u0026apos;)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第三步：查询 iikx 搜索接口。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci\u0026amp;c=index\u0026amp;a=info\u0026amp;keyword=\u0026lt;journal_query\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e建议设置 User-Agent，例如：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eMozilla/5.0\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果第一页没找到 exact match，可以有限翻页，例如最多 8 页。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e翻页参数通常为：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003epage=2\u003c/p\u003e\u003cp\u003epage=3\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第四步：从搜索结果中选候选。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e候选字段通常包括：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eid\u003c/p\u003e\u003cp\u003eclassid\u003c/p\u003e\u003cp\u003etitle\u003c/p\u003e\u003cp\u003esmalltitle\u003c/p\u003e\u003cp\u003eIF 或 IF2024\u003c/p\u003e\u003cp\u003ezky2020\u003c/p\u003e\u003cp\u003eurl\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e匹配规则：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 如果 compact(query) == compact(candidate.title)，接受。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 如果 norm(query) == norm(candidate.title)，接受。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 如果 compa"])</script><script>self.__next_f.push([1,"ct(query) == compact(candidate.smalltitle)，接受。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 如果 norm(query) == norm(candidate.smalltitle)，接受。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 如果只是 substring，不要直接接受，除非 query 足够长且无歧义。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 对 Nature、Science、Cell、Brain、Vision、Retina 等短词尤其谨慎。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第五步：如果没有匹配，用 NLM Catalog 扩展缩写。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e例如 PubMed 里 Source 是：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eFree Radic Biol Med\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e可以查：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog\u0026amp;term=Free%20Radic%20Biol%20Med%5BTitle%20Abbreviation%5D\u0026amp;retmode=xml\u0026amp;retmax=1\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e拿到 NLM Catalog ID 后，再用：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi?db=nlmcatalog\u0026amp;id=\u0026lt;id\u0026gt;\u0026amp;retmode=xml\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e读取：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eTitle\u003c/p\u003e\u003cp\u003eTitleAlternate\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e然后用这些全称再查 iikx。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第六步：查 iikx 详情接口。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果搜索结果里有：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eid=\u0026lt;id\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003eclassid=\u0026lt;classid\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e调用：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003ehttps://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail\u0026amp;id=\u0026lt;id\u0026gt;\u0026amp;classid=\u0026lt;classid\u0026gt;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e从 detail 中读取：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eIF2024, IF2023, IF2022 ...\u003c/p\u003e\u003cp\u003eIF\u003c/p\u003e\u003cp\u003ezky2020 或其他 JCR quartile 字段\u003c/p\u003e\u003cp\u003ejcr22 / jcr12 或分区字段\u003c/p\u003e\u003cp\u003eissn\u003c/p\u003e\u003cp\u003eeissn\u003c/p\u003e\u003cp\u003etitle\u003c/p\u003e\u003cp\u003esmalltitle\u003c/p\u003e\u003cp\u003ecategory\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第七步：选择最新 IF。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e在返回字段中查找所有形如：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eIF20xx\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e例如：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eIF2024\u003c/p\u003e\u003cp\u003eIF2023\u003c/p\u003e\u003cp\u003eIF2022\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e选年份最大的有效数字。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果没有 IF20xx，则尝试读取：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003eIF\u003c/p\u003e\u003cp\u003eif_value\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果没有有效值，则标为未检出。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第八步：输出置信度和标注。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果 exact title / abbreviation 命中，并且 detail 返回有效 IF：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e*｛IF＝X，Qn｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果匹配不确定：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e*｛IF＝待核验｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果公开接口没有结果：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e*｛IF＝未检出｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e6.4 IF 标注格式\u003c/p\u003e\u003cp\u003e固定格式：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e*｛IF＝X，Qn｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e示例：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```markdown\u003c/p\u003e\u003cp\u003eSmith J et al., **Neuron** (2020), [PMID: 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *｛IF＝15.0，Q1｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e注意：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• IF 标注内部不写 JCR 年份。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 不写“2024 JCR IF”。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 不写“JCR 2024”。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 年份只保留在文献发表年份处。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 如果 IF 为 0.0、空值、来源不稳、匹配不稳，不展示数字。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e6.5 IF 核查失败时的标准处理\u003c/p\u003e\u003cp\u003e不要猜。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e不要用期刊名印象补数字。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e不要用大模型记忆补 IF。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e失败时只允许三种状态：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e*｛IF＝待核验｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e用于：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 搜索结果模糊。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 有多个相似期刊。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 只找到缩写但无法确认全称。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 公开来源返回的 IF 可疑。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e*｛IF＝未检出｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e用于：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 公开接口没有结果。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 期刊不在 SCI / JCR 覆盖范围。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 新刊暂无 IF。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e*｛IF＝不可公开核验｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e用于：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 用户要求必须官方 JCR，但当前 Agent 没有 Clarivate/JCR 权限。\u003c/p\u003e42:T2657,\u003cp\u003e6. Vérification et étiquetage du FI\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 6.1 Tout d’abord, expliquons les limites pratiques des contrôles IF.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Normalement, le facteur d'impact officiel d'une revue est fourni par Clarivate Journal Citation Reports (JCR). Cependant, les organismes externes ne disposent généralement pas de compte Clarivate/JCR ni d'une table JCR locale ; il est donc déconseillé de le vérifier par cette voie.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 6.2 Méthodes pratiques d'utilisation des compétences en intelligence artificielle\u003c/"])</script><script>self.__next_f.push([1,"p\u003e\u003cp\u003e Route principale :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1. Si l'entrée est un PMID, utilisez d'abord les utilitaires électroniques du NCBI pour obtenir les métadonnées PubMed.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e - Récupérer le nom complet de la revue. - Récupérer la source/l'abréviation ISO. - Récupérer l'ISSN/eISSN. - Récupérer les champs auxiliaires tels que le titre, l'année et le DOI.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2. Utilisez l'interface JSON mobile iikx/iscience, accessible au public, pour interroger les revues.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e API de recherche :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci\u0026c=index\u0026a=info\u0026keyword=\u003cjournal_query\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e API de détails :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail\u0026id=\u003cid\u003e\u0026classid=\u003cclassid\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 3. Effectuer une correspondance prudente sur les résultats de la recherche.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e - Priorise les correspondances exactes avec les titres normalisés des revues. - Priorise ensuite les correspondances exactes avec les abréviations. - Fait preuve d'une grande prudence avec les termes courts et généraux. - N'accepte pas les erreurs manifestes de correspondance avec des sous-chaînes, comme la confusion entre « Nature » et la série « Nature Reviews ». - Renvoie des résultats ambigus ou introuvables si la correspondance est instable, plutôt que de tenter une estimation.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 4. Si PubMed fournit une abréviation, essayez de la développer en nom complet ou en titre alternatif à l'aide du catalogue NLM.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e L'interface de recherche du catalogue NLM reste NCBI E-utilities :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog\u0026term=\u003cabbr\u003e[Abréviation du titre]\u0026retmode=xml\u0026retmax=1\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Utilisez ensuite ESummary pour obtenir le titre / le titre alternatif.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 5. Lisez les résultats détaillés de iikx :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e - Facteur d'impact. - Année IF. - Quartile JCR. - Quartile CAS/CAS, le cas échéant. - URL source. - Niveau de confiance de la correspondance.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 6. N’incluez pas l’année IF dans le texte principal lors de l’annotation ; utilisez des annotations concises.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e La dernière annotation devrait simplement indiquer :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e *{SI＝X，Qn}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e En cas d'échec :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e *{IF=Vérification en attente}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ou:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e *{IF=Non détecté}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 6.3 Étapes spécifiques\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Effectuez la procédure suivante pour chaque document.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Étape 1 : Préparer le nom de la recherche dans la revue.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Prioriser la récupération des métadonnées PubMed :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Nom complet du journal\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Abréviation ISO / Source\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ISSN\u003c/p\u003e\u003cp\u003e eISSN\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si seul un DOI est disponible, utilisez d'abord Crossref ou OpenAlex pour obtenir le nom de la revue.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Crossref :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://api.crossref.org/works/\u003cDOI\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e OpenAlex :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://api.openalex.org/works/https://doi.org/\u003cDOI\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Étape 2 : Normaliser les noms des revues.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Règles de normalisation :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Tout en minuscules.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Décompression HTML.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Remplacez \u0026 par et.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Supprimez la ponctuation.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Combiner plusieurs espaces.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Pour faire des comparaisons, vous pouvez également utiliser la forme compacte, qui supprime tous les espaces.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Exemple de pseudocode :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Python\u003c/p\u003e\u003cp\u003e importer re, html\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e def norm(s) :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e s = html.unescape(s ou '').lower()\u003c/p\u003e\u003cp\u003e s = re.sub(r'\u0026', ' et ', s)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e s = re.sub(r'[^a-z0-9]+', ' ', s)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e retourner re.sub(r'\\s+', ' ', s).strip()\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e def compact(s) :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e retourner norm(s).replace(' ', '')\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Étape 3 : Interroger l'interface de recherche iikx.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci\u0026c=index\u0026a=info\u0026keyword=\u003cjournal_query\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Il est recommandé de définir un User-Agent, par exemple :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Mozilla/5.0\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si aucune correspondance exacte n'est trouvée sur"])</script><script>self.__next_f.push([1," la première page, vous pouvez feuilleter un nombre limité de pages, par exemple, jusqu'à 8 pages.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Les paramètres de changement de page sont généralement les suivants :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e page=2\u003c/p\u003e\u003cp\u003e page=3\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Étape 4 : Sélectionner les candidats parmi les résultats de la recherche.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Les domaines candidats comprennent généralement :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e identifiant\u003c/p\u003e\u003cp\u003e classifié\u003c/p\u003e\u003cp\u003e titre\u003c/p\u003e\u003cp\u003e petit titre\u003c/p\u003e\u003cp\u003e SI ou SI2024\u003c/p\u003e\u003cp\u003e zky2020\u003c/p\u003e\u003cp\u003e URL\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Règles de correspondance :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Si compact(query) == compact(candidate.title), accepter.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Si norm(query) == norm(candidate.title), accepter.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Si compact(query) == compact(candidate.smalltitle), accepter.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Si norm(query) == norm(candidate.smalltitle), accepter.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • N’acceptez pas une sous-chaîne à moins que la requête ne soit suffisamment longue et non ambiguë.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Soyez particulièrement prudent avec les mots courts tels que Nature, Science, Cellule, Cerveau, Vision et Rétine.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Étape 5 : Si aucune correspondance n’est trouvée, utilisez l’abréviation étendue du catalogue NLM.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Par exemple, dans PubMed, la source est :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Biol Médicament des radicaux libres\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Vous pouvez vérifier :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esearch.fcgi?db=nlmcatalog\u0026term=Free%20Radic%20Biol%20Med%5BTitle%20Abbreviation%5D\u0026retmode=xml\u0026retmax=1\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Après avoir obtenu l'identifiant du catalogue NLM, utilisez-le comme suit :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi?db=nlmcatalog\u0026id=\u003cid\u003e\u0026retmode=xml\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Lire:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Titre\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Titre alternatif\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Utilisez ensuite ces noms complets pour rechercher iikx.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Étape 6 : Vérifiez l'interface des détails iikx.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si les résultats de la recherche contiennent :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e id=\u003cid\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e classid=\u003cclassid\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Appel:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e https://m.iikx.com/api/restfull/?m=sci/index/detail\u0026id=\u003cid\u003e\u0026classid=\u003cclassid\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Lire les détails :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e IF2024, IF2023, IF2022…\u003c/p\u003e\u003cp\u003e SI\u003c/p\u003e\u003cp\u003e zky2020 ou autres champs de quartile JCR\u003c/p\u003e\u003cp\u003e jcr22 / jcr12 ou champ de partition\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ISSN\u003c/p\u003e\u003cp\u003e eissn\u003c/p\u003e\u003cp\u003e titre\u003c/p\u003e\u003cp\u003e petit titre\u003c/p\u003e\u003cp\u003e catégorie\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Étape 7 : Sélectionnez la dernière instruction IF.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Recherchez dans les champs renvoyés toutes les occurrences du formulaire :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e IF20xx\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Par exemple:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e IF2024\u003c/p\u003e\u003cp\u003e IF2023\u003c/p\u003e\u003cp\u003e IF2022\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Choisissez l'année avec le plus grand chiffre significatif.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si IF20xx est absent, essayez de lire :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e SI\u003c/p\u003e\u003cp\u003e valeur_si\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si aucune valeur valide n'est trouvée, elle est marquée comme non détectée.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Étape 8 : Afficher le niveau de confiance et l'étiquette.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si le titre/l'abréviation correspond exactement et que les détails renvoient un IF valide :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e *{SI＝X，Qn}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si le match est incertain :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e *{IF=Vérification en attente}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si l'API publique ne renvoie aucun résultat :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e *{IF=Non détecté}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 6.4 Format d'annotation IF\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Format fixe :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e *{SI＝X，Qn}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Exemple:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```markdown\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Smith J et al., **Neuron** (2020), [PMID : 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF = 15,0, Q1}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Avis:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • L’année JCR n’est pas inscrite dans l’annotation IF.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • N’écrivez pas « 2024 JCR IF ».\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • N’écrivez pas « JCR 2024 ».\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Seule l'année de publication est conservée.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Si la valeur IF est 0,0, nulle, a une source instable ou une correspondance instable, le nombre ne sera pas affiché.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 6.5 Gestion standard des échecs de vérification IF\u003c"])</script><script>self.__next_f.push([1,"/p\u003e\u003cp\u003e Ne devinez pas.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e N’utilisez pas le nom de la revue pour renseigner les numéros.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e N’utilisez pas de grands modèles pour mémoriser et remplir des instructions IF.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Seuls trois états sont autorisés en cas d'échec :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e *{IF=Vérification en attente}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Utilisé pour :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Les résultats de la recherche sont vagues.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Il existe plusieurs revues similaires.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Seule l'abréviation a été trouvée, mais le nom complet n'a pas pu être confirmé.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Le facteur d'impact (FI) fourni par les sources publiques est discutable.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e *{IF=Non détecté}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Utilisé pour :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • L'interface publique n'a renvoyé aucun résultat.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • La revue n'est pas indexée dans SCI/JCR.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Ce nouveau numéro n'a pas encore de condition suspensive.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e *{IF=Non vérifiable publiquement}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Utilisé pour :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • L’utilisateur a besoin d’un JCR officiel, mais l’agent actuel ne dispose pas des autorisations Clarivate/JCR.\u003c/p\u003e43:T456,\u003cp\u003e7. Liste d'auto-vérification finale\u003c/p\u003e\u003cp\u003e À vérifier avant l'expédition :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Faut-il répondre d'abord aux questions essentielles de l'utilisateur ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Faut-il faire une distinction entre preuves directes, preuves indirectes et absence de preuves directes ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Toutes les citations textuelles sont-elles cliquables ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • L’article comporte-t-il une liste complète des références à la fin ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Chaque document comporte-t-il une étiquette IF (Entrée/Sortie) ou une étiquette indiquant une vérification en attente/non détectée ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Si le PMID/DOI/URL est cliquable.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Permet-elle d'éviter de substituer des résultats globaux sur les tissus à des conclusions concernant des types cellulaires spécifiques ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Cela permet-il d'éviter de substituer l'activation/phosphorylation à une augmentation de l'expression totale ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Faut-il indiquer qu'il s'agit d'une prépublication ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Spécifie-t-il les limites de la recherche ?\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • SI ce n'était pas basé sur la mémoire ou la conjecture.\u003c/p\u003e44:T4d3,8. 可复现伪代码\n```python\nqueries = build_queries(user_question)\n \nall_pmids = []\nfor query in queries:\n pmids = ncbi_esearch(query, retmax=20, sort='relevance')\n all_pmids.extend(pmids)\n \npmids = deduplicate_keep_order(all_pmids)\n \nmetadata = ncbi_esummary(pmids)\nabstracts = ncbi_efetch_abstract(pmids)\n \nrecords = merge_metadata_and_abstracts(metadata, abstracts)\nrecords = tag_evidence(records, user_question)\nrecords = rank_records(records)\nselected = select_top_records(records)\n \nif need_fulltext:\n for record in selected_key_records:\n pmcid = idconv_pmid_to_pmcid(record.pmid)\n if pmcid:\n record.fulltext = fetch_bioc_or_pmc_xml(pmcid)\n \nfor record in selected:\n journal_query = record.full_journal_name or record.journal_abbrev\n if_result = lookup_if_public_iikx(journal_query)\n if if_result.confident:\n record.if_annotation = f'*｛IF＝{if_result.if_value}，{if_result.quartile}｝*'\n elif if_result.ambiguous:\n record.if_annotation = '*｛IF＝待核验｝*'\n else:\n record.if_annotation = '*｛IF＝未检出｝*'\n \nanswer = compose_answer(\n conclusion,\n evidence_groups,\n clickable_body_citations,\n full_reference_list_with_if\n)\n```45:T5f8,\u003cp\u003e8. 可复现伪代码\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```python\u003c/p\u003e\u003cp\u003equeries = build_queries(user_question)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003eall_pmids = []\u003c/p\u003e\u003cp\u003efor query in queries:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e pmids = ncbi_esearch(query, retmax=20, sort=\u0026apos;relevance\u0026apos;)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e all_pmids.extend(pmids)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003epmids = deduplicate_keep_order(all_pmids)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003emetadata = ncbi_esummary(pmids)\u003c/p\u003e\u003cp\u003eabstracts = ncbi_efetch_abstract(pmids)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003erecords = merge_metadata_and_abstracts(metadata, abstracts)\u003c/p\u003e\u003cp\u003erecords = tag_evidence(records, user_question)\u003c/p\u003e\u003cp\u003erecords = rank_records(records)\u003c/p\u003e\u003cp\u003eselected = select_top_records(records)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e"])</script><script>self.__next_f.push([1,"\u003cp\u003eif need_fulltext:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e for record in selected_key_records:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e pmcid = idconv_pmid_to_pmcid(record.pmid)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e if pmcid:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e record.fulltext = fetch_bioc_or_pmc_xml(pmcid)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003efor record in selected:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e journal_query = record.full_journal_name or record.journal_abbrev\u003c/p\u003e\u003cp\u003e if_result = lookup_if_public_iikx(journal_query)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e if if_result.confident:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e record.if_annotation = f\u0026apos;*｛IF＝{if_result.if_value}，{if_result.quartile}｝*\u0026apos;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e elif if_result.ambiguous:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e record.if_annotation = \u0026apos;*｛IF＝待核验｝*\u0026apos;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e else:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e record.if_annotation = \u0026apos;*｛IF＝未检出｝*\u0026apos;\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003eanswer = compose_answer(\u003c/p\u003e\u003cp\u003e conclusion,\u003c/p\u003e\u003cp\u003e evidence_groups,\u003c/p\u003e\u003cp\u003e clickable_body_citations,\u003c/p\u003e\u003cp\u003e full_reference_list_with_if\u003c/p\u003e\u003cp\u003e)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e46:T677,\u003cp\u003e8. Pseudocode reproductible\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Python\u003c/p\u003e\u003cp\u003e requêtes = construire_requêtes(question_utilisateur)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e tous_pmids = []\u003c/p\u003e\u003cp\u003e pour la requête dans les requêtes :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e pmids = ncbi_esearch(query, retmax=20, sort='relevance')\u003c/p\u003e\u003cp\u003e all_pmids.extend(pmids)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e pmids = deduplicate_keep_order(all_pmids)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e métadonnées = ncbi_esummary(pmids)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e résumés = ncbi_efetch_abstract(pmids)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e enregistrements = fusionner_métadonnées_et_résumés(métadonnées, résumés)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e enregistrements = étiquette_preuve(enregistrements, question_utilisateur)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e enregistrements = rang_enregistrements(enregistrements)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e sélectionné = sélectionner_meilleurs_enregistrements(enregistrements)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e si besoin_texte_complet :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e pour chaque enregistrement dans selected_key_records :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e pmcid = idconv_pmid_to_pmcid(record.pmid)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e si pmcid :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e enregistrement.fulltext = fetch_bioc_or_pmc_xml(pmcid)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Pour enregistrer dans la sélection :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e journal_query = record.full_journal_name ou record.journal_abbrev\u003c/p\u003e\u003cp\u003e si_résultat = lookup_if_public_iikx(requête_journal)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e si_résultat.confiant :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e record.if_annotation = f'*{IF＝{if_result.if_value}，{if_result.quartile}｝*'\u003c/p\u003e\u003cp\u003e elif if_result.ambiguous:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e record.if_annotation = '*{IF＝Vérification en attente}*'\u003c/p\u003e\u003cp\u003e autre:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e record.if_annotation = '*{IF＝Non détecté}*'\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e réponse = composer_réponse(\u003c/p\u003e\u003cp\u003e conclusion\u003c/p\u003e\u003cp\u003e groupes de preuves,\u003c/p\u003e\u003cp\u003e citations cliquables_corps,\u003c/p\u003e\u003cp\u003e liste_de_référence_complète_avec_si\u003c/p\u003e\u003cp\u003e )\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e47:T572,\u003cp\u003e9. Modèle de livraison finale recommandé\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```markdown\u003c/p\u003e\u003cp\u003e en conclusion:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ...\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Niveau de preuve :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Preuve directe :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e - ……[[1. **Journal**, Année]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Preuves indirectes :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e - …[[2. **Journal**, Année]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Aucune preuve directe n'a été trouvée :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e - ……\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Résumé du mécanisme :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1. ……\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2. ……\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Limites de recherche :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Cette série de recherches a principalement porté sur PubMed, PMC, BioC et bioRxiv ; la sélection initiale s’est basée sur les métadonnées et les résumés, seuls les documents clés faisant l’objet d’une analyse du texte intégral. Les annotations d’impact ont été établies à partir de sources accessibles au public ; les documents pour lesquels une correspondance avec certitude n’a pu être établie ont été marqués comme étant en attente de vérification ou non détectés.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Liste complète des informations bibliographiques :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1. Smith J et al., **Nom du journal** (2021), [PMID : 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF＝X，Q1}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 2. Wang X et al., **Nom de la revue** (2022), [DOI : 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *{IF=À vérifier}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e48:T981,Saisissez une expression-clé, et l'outil décompose automatiquement la structure du sujet selon la méthode de l'oign"])</script><script>self.__next_f.push([1,"on → développe les synonymes → génère des requêtes de recherche à quatre niveaux (CNKI + WoS/Google Scholar) et fournit une liste d'exécution et une stratégie de filtrage. Applicables à toutes les disciplines, les requêtes de recherche peuvent être directement copiées-collées et utilisées. 🎯 Quels problèmes résout-il ? ❌ Saisie directe d'une phrase complète dans le champ de recherche → 0 résultat ❌ Recherche d'un seul mot-clé → 5000 résultats sans savoir par où commencer ❌ Ne pas savoir comment segmenter un sujet → Recherche sans orientation ✅ Saisie de « Anxiété scolaire de la classe moyenne et pratiques d'enseignement parallèle » → Plus de 30 requêtes de recherche directement utilisables + un thésaurus + une liste d'exécution par niveaux 📐 Méthode principale : La méthode de l'oignon se développe de l'intérieur vers l'extérieur, du plus étroit au plus large, en trois couches de profondeur croissante : la couche principale identifie précisément 4 articles de lecture essentiels, la couche d'expansion trouve 48 études directement liées et la couche panoramique établit une compréhension globale de la portée du domaine. 🔧 Les résultats comprennent : • Analyse des trois éléments de sélection du sujet (qualificatifs + unité de recherche + dimension de recherche) • 5 à 8 concepts associés pour chaque élément + comparaison chinois-anglais + concepts généraux/subordonnés • Premier niveau : 8 ensembles de formules de recherche par combinaison de trois éléments (titre → sujet, précis → général) • Deuxième niveau : 3 types de paires d’éléments (marquage des usages principaux/de fond) • Troisième niveau : Formule de recherche panoramique mono-élément • Quatrième niveau : Stratégie d’expansion des concepts généraux • 📋 Liste de contrôle d’exécution en six étapes + critères de sélection pour chaque niveau (articles fréquemment cités + articles de pointe) 👥 À qui s’adresse ce service ? Aux chercheurs débutants, aux étudiants de master et de doctorat, aux jeunes chercheurs – à toute personne souhaitant effectuer des recherches bibliographiques de manière systématique plutôt que de se fier à son intuition pour la recherche par mots-clés.7:[\"$\",\"div\",null,{\"className\":\"container pt-[42px] md:pt-[100px]\",\"children\":[\"$\",\"div\",null,{\"className\":\"flex flex-col gap-5 md:gap-[60px]\",\"children\":[[\"$\",\"$L36\",null,{\"label\":\"Compétences\",\"fallbackHref\":\"/skills\"}],[\"$\",\"$L37\",null,{\"locale\":\"fr-FR\",\"skill\":{\"id\":\"019e00d2-78ba-73bc-93d4-eae7d91298a9\",\"created_at\":\"2026-05-07T05:04:14.010Z\",\"updated_at\":\"2026-06-20T14:21:17.427Z\",\"creator_id\":\"7d8d4986-6f56-4da7-8fb5-e8e0355a3ae3\",\"name\":\"Recherche approfondie et fiable en bio/médecine\",\"description\":\"Scénarios d'application : Effectuer une recherche bibliographique complète en biologie/biomédecine et fournir aux utilisateurs des résultats détaillés et fiables. 1. Après le lancement d'une recherche par l'utilisateur, le système analyse la question et les mots-clés. 2. Rechercher des publications à partir de sources de données publiques et reproductibles. 3. Dédupliquer, stratifier, classer et trier les résultats de recherche. 4. Intégrer des citations cliquables dans la réponse. 5. Lister les informations bibliographiques complètes à la fin du document et indiquer le facteur d'impact (FI) avec les liens de recherche publics ; si une vérification avec un haut degré de confiance est impossible, la publication doit être marquée comme « à vérifier » ou « non détectée ».\",\"type\":\"prompt-executer\",\"visibility\":\"public\",\"review_status\":\"approved\",\"icon_value\":\"Hedgehug\",\"icon_bg_color\":\"skill-bg13\",\"showcase\":[{\"url\":\"https://cdn.gooo.ai/web-images/a5f4973dccb5c12acd58034ffdea6d898802a4d4be1e9568bb3088c4f635cda2\",\"type\":\"image\"},{\"url\":\"https://cdn.gooo.ai/web-images/f697d3abe7d40284b9afc64c0ec008739ef2f24e668d3e36d7f7890b70206ad7\",\"type\":\"image\"}],\"fork_count\":8,\"earned_credits\":1600,\"price\":200,\"content\":{\"steps\""])</script><script>self.__next_f.push([1,":[{\"instructions\":\"$38\",\"instructions_raw\":\"$39\",\"localized_instructions_raw\":\"$3a\",\"tools\":{\"research\":{\"use_tool\":\"required\"}},\"tool_as_skill\":{\"id\":\"019c2855-1439-71b5-8699-936ec99b13c7\",\"name\":\"研究\"},\"at_references\":[]},{\"instructions\":\"$3b\",\"instructions_raw\":\"$3c\",\"localized_instructions_raw\":\"$3d\",\"tools\":{\"research\":{\"use_tool\":\"required\"}},\"tool_as_skill\":{\"id\":\"019c2855-1439-71b5-8699-936ec99b13c7\",\"name\":\"研究\"},\"at_references\":[]},{\"instructions\":\"3. 检索后如何整理信息\\n3.1 建立统一记录结构\\n每篇文献整理成统一 record。\\n字段：\\n```text\\npmid\\ndoi\\npmcid\\ntitle\\nauthors\\njournal\\njournal_abbrev\\nissn\\neissn\\nyear\\nabstract\\nquery_source\\nevidence_level\\nevidence_tags\\npaper_type\\nurl\\n```\\n3.2 去重\\n优先级：\\n1. PMID 去重。\\n2. 没有 PMID 时用 DOI 去重。\\n3. 没有 DOI 时用 lower(title) + year + first_author 去重。\\n保留第一次命中的 query_source，同时记录该文献被哪些 query 命中。\\n3.3 证据分级\\n必须区分：\\n直接证据：\\n目标物种、组织、细胞类型、模型、处理条件直接命中。\\n间接证据：\\n相邻系统、相似模型、相近机制支持，但不是用户问题的直接系统。\\n未见直接证据：\\n只能找到背景、推测、综述或相邻模型，没有直接实验结果。\\n3.4 文献类型标注\\n至少标注：\\n• original research\\n• review\\n• protocol\\n• preprint\\n• dataset/resource\\n• clinical study\\n• method paper\\n3.5 排序规则\\n推荐排序：\\n1. 直接证据原始研究。\\n2. 关键机制研究。\\n3. 最新重要研究。\\n4. 经典奠基研究。\\n5. 高质量综述。\\n6. 间接证据。\\n不要只按 IF 排序。IF 是期刊层面指标，不等于单篇文献质量。\",\"instructions_raw\":\"\u003cp\u003e3. 检索后如何整理信息\u003c/p\u003e\u003cp\u003e3.1 建立统一记录结构\u003c/p\u003e\u003cp\u003e每篇文献整理成统一 record。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e字段：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003epmid\u003c/p\u003e\u003cp\u003edoi\u003c/p\u003e\u003cp\u003epmcid\u003c/p\u003e\u003cp\u003etitle\u003c/p\u003e\u003cp\u003eauthors\u003c/p\u003e\u003cp\u003ejournal\u003c/p\u003e\u003cp\u003ejournal_abbrev\u003c/p\u003e\u003cp\u003eissn\u003c/p\u003e\u003cp\u003eeissn\u003c/p\u003e\u003cp\u003eyear\u003c/p\u003e\u003cp\u003eabstract\u003c/p\u003e\u003cp\u003equery_source\u003c/p\u003e\u003cp\u003eevidence_level\u003c/p\u003e\u003cp\u003eevidence_tags\u003c/p\u003e\u003cp\u003epaper_type\u003c/p\u003e\u003cp\u003eurl\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e3.2 去重\u003c/p\u003e\u003cp\u003e优先级：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e1. PMID 去重。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2. 没有 PMID 时用 DOI 去重。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e3. 没有 DOI 时用 lower(title) + year + first_author 去重。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e保留第一次命中的 query_source，同时记录该文献被哪些 query 命中。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e3.3 证据分级\u003c/p\u003e\u003cp\u003e必须区分：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e直接证据：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e目标物种、组织、细胞类型、模型、处理条件直接命中。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e间接证据：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e相邻系统、相似模型、相近机制支持，但不是用户问题的直接系统。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e未见直接证据：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e只能找到背景、推测、综述或相邻模型，没有直接实验结果。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e3.4 文献类型标注\u003c/p\u003e\u003cp\u003e至少标注：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• original research\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• review\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• protocol\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• preprint\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• dataset/resource\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• clinical study\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• method paper\u003c/p\u003e\u003cp\u003e3.5 排序规则\u003c/p\u003e\u003cp\u003e推荐排序：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e1. 直接证据原始研究。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2. 关键机制研究。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e3. 最新重要研究。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e4. 经典奠基研究。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e5. 高质量综述。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e6. 间接证据。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e不要只按 IF 排序。IF 是期刊层面指标，不等于单篇文献质量。\u003c/p\u003e\",\"localized_instructions_raw\":\"$3e\",\"tools\":{\"write\":{\"use_tool\":\"required\",\"model\":\"claude-4-5-sonnet\"}},\"tool_as_skill\":{\"id\":\"019c32a0-c571-74f0-8ae5-9262c15cced7\",\"name\":\"写作\",\"config\":{\"model\":\"claude-4-5-sonnet\"}},\"at_references\":[]},{\"instructions\":\"4. 回复中如何组织引用\\n4.1 正文引用格式\\n正文引用必须可点击。\\n格式：\\n```markdown\\n[[1. **Journal**, Year]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)\\n```\\n示例：\\n```markdown\\n已有研究在人源 retinal organoids 中观察到发育阶段相关的光感受器应激和退化现象[[1. **Cell Stem Cell**, 2019]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/xxxxxxx/)。\\n```\\n不要写成：\\n```text\\n[1]\\n(PMID: xxxxx)\\n见文献1\\n```\\n4.2 推荐回答结构\\n第一"])</script><script>self.__next_f.push([1,"段：直接结论。\\n```text\\n结论：已有相关报道，但直接证据主要集中在……；关于……仍缺少直接证据。\\n```\\n第二段：证据分级。\\n```text\\n直接证据：\\n- 文献 A：……\\n \\n间接证据：\\n- 文献 B：……\\n \\n未见直接证据：\\n- 本轮未找到……\\n```\\n第三段：机制归纳。\\n按主题分组，例如：\\n• apoptosis / caspase pathway\\n• oxidative stress\\n• mitochondrial dysfunction\\n• ER stress\\n• hypoxia / metabolic stress\\n• inflammation\\n• developmental mismatch\\n第四段：研究空白。\\n明确说明哪些问题没有直接证据。\\n第五段：实验启发。\\n如果用户需要实验设计，给出 marker、assay、time point、control。\",\"instructions_raw\":\"\u003cp\u003e4. 回复中如何组织引用\u003c/p\u003e\u003cp\u003e4.1 正文引用格式\u003c/p\u003e\u003cp\u003e正文引用必须可点击。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e格式：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```markdown\u003c/p\u003e\u003cp\u003e[[1. **Journal**, Year]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e示例：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```markdown\u003c/p\u003e\u003cp\u003e已有研究在人源 retinal organoids 中观察到发育阶段相关的光感受器应激和退化现象[[1. **Cell Stem Cell**, 2019]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/xxxxxxx/)。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e不要写成：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e[1]\u003c/p\u003e\u003cp\u003e(PMID: xxxxx)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e见文献1\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e4.2 推荐回答结构\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第一段：直接结论。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e结论：已有相关报道，但直接证据主要集中在……；关于……仍缺少直接证据。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第二段：证据分级。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```text\u003c/p\u003e\u003cp\u003e直接证据：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e- 文献 A：……\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003e间接证据：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e- 文献 B：……\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003e未见直接证据：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e- 本轮未找到……\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第三段：机制归纳。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e按主题分组，例如：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• apoptosis / caspase pathway\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• oxidative stress\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• mitochondrial dysfunction\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• ER stress\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• hypoxia / metabolic stress\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• inflammation\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• developmental mismatch\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第四段：研究空白。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e明确说明哪些问题没有直接证据。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e第五段：实验启发。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e如果用户需要实验设计，给出 marker、assay、time point、control。\u003c/p\u003e\",\"localized_instructions_raw\":\"$3f\",\"tools\":{\"write\":{\"use_tool\":\"required\",\"model\":\"claude-4-5-sonnet\"}},\"tool_as_skill\":{\"id\":\"019c32a0-c571-74f0-8ae5-9262c15cced7\",\"name\":\"写作\",\"config\":{\"model\":\"claude-4-5-sonnet\"}},\"at_references\":[]},{\"instructions\":\"5. 文末完整文献信息列表\\n只要正文引用具体文献，文末必须附完整列表。\\n格式：\\n```markdown\\n## 完整文献信息列表\\n \\n1. Smith J et al., **Journal Name** (2021), [PMID: 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *｛IF＝X，Qn｝*\\n2. Wang X et al., **Journal Name** (2022), [DOI: 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *｛IF＝待核验｝*\\n```\\n作者格式：\\n• 1–3 位作者：列出全部。\\n• 超过 3 位：第一作者 et al.\\nPMID / DOI / URL 必须可点击。\",\"instructions_raw\":\"\u003cp\u003e5. 文末完整文献信息列表\u003c/p\u003e\u003cp\u003e只要正文引用具体文献，文末必须附完整列表。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e格式：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```markdown\u003c/p\u003e\u003cp\u003e## 完整文献信息列表\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003e1. Smith J et al., **Journal Name** (2021), [PMID: 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *｛IF＝X，Qn｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2. Wang X et al., **Journal Name** (2022), [DOI: 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *｛IF＝待核验｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e作者格式：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 1–3 位作者：列出全部。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 超过 3 位：第一作者 et al.\u003c/p\u003e\u003cp\u003ePMID / DOI / URL 必须可点击。\u003c/p\u003e\",\"localized_instructions_raw\":\"\u003cp\u003e5. Liste complète des références à la fin de l'article\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Si une référence spécifique est citée dans le texte, une liste complète doit être jointe à la fin de l'article.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Format:\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```markdown\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ## Liste complète des informations de référence\u003c/p\u003e\u003cp\u003e\u003c/p\u003e\u003cp\u003e 1. Smith J et al., **Nom du journal** (2021), [PMID : 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *{IF＝X，Qn}*\u003c/"])</script><script>self.__next_f.push([1,"p\u003e\u003cp\u003e 2. Wang X et al., **Nom de la revue** (2022), [DOI : 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *{IF=À vérifier}*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e ```\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Format de l'auteur :\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • 1 à 3 auteurs : Veuillez tous les énumérer.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e • Plus de 3 auteurs : Premier auteur et al.\u003c/p\u003e\u003cp\u003e Le PMID / DOI / URL doit être cliquable.\u003c/p\u003e\",\"tools\":{\"research\":{\"use_tool\":\"required\"}},\"tool_as_skill\":{\"id\":\"019c2855-1439-71b5-8699-936ec99b13c7\",\"name\":\"研究\"},\"at_references\":[]},{\"instructions\":\"$40\",\"instructions_raw\":\"$41\",\"localized_instructions_raw\":\"$42\",\"tools\":{\"research\":{\"use_tool\":\"required\"}},\"tool_as_skill\":{\"id\":\"019c2855-1439-71b5-8699-936ec99b13c7\",\"name\":\"研究\"},\"at_references\":[]},{\"instructions\":\"7. 最终回复自检清单\\n发出前必须检查：\\n• 是否先回答用户核心问题。\\n• 是否区分直接证据、间接证据、未见直接证据。\\n• 是否所有正文引用都可点击。\\n• 是否文末有完整文献信息列表。\\n• 是否每篇文献都带 IF 标注或待核验/未检出标注。\\n• PMID/DOI/URL 是否可点击。\\n• 是否避免把整体组织结果偷换成特定细胞类型结论。\\n• 是否避免把活化/磷酸化偷换成总表达量升高。\\n• 是否标注预印本。\\n• 是否说明检索边界。\\n• IF 是否没有凭记忆猜测。\",\"instructions_raw\":\"\u003cp\u003e7. 最终回复自检清单\u003c/p\u003e\u003cp\u003e发出前必须检查：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 是否先回答用户核心问题。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 是否区分直接证据、间接证据、未见直接证据。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 是否所有正文引用都可点击。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 是否文末有完整文献信息列表。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 是否每篇文献都带 IF 标注或待核验/未检出标注。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• PMID/DOI/URL 是否可点击。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 是否避免把整体组织结果偷换成特定细胞类型结论。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 是否避免把活化/磷酸化偷换成总表达量升高。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 是否标注预印本。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• 是否说明检索边界。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e• IF 是否没有凭记忆猜测。\u003c/p\u003e\",\"localized_instructions_raw\":\"$43\",\"tools\":{},\"at_references\":[]},{\"instructions\":\"$44\",\"instructions_raw\":\"$45\",\"localized_instructions_raw\":\"$46\",\"tools\":{},\"at_references\":[]},{\"instructions\":\"9. 推荐最终交付模板\\n```markdown\\n结论：\\n……\\n \\n证据等级：\\n \\n直接证据：\\n- ……[[1. **Journal**, Year]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)\\n \\n间接证据：\\n- ……[[2. **Journal**, Year]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)\\n \\n未见直接证据：\\n- ……\\n \\n机制归纳：\\n1. ……\\n2. ……\\n \\n检索边界：\\n本轮主要检索 PubMed / PMC / BioC / bioRxiv；初筛基于 metadata + abstract，仅对关键文献进入全文复核。IF 标注基于公开可访问来源核查；无法高置信匹配时标为待核验或未检出。\\n \\n完整文献信息列表：\\n1. Smith J et al., **Journal Name** (2021), [PMID: 12345678](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12345678/). *｛IF＝X，Q1｝*\\n2. Wang X et al., **Journal Name** (2022), [DOI: 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *｛IF＝待核验｝*\\n```\",\"instructions_raw\":\"\u003cp\u003e9. 推荐最终交付模板\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```markdown\u003c/p\u003e\u003cp\u003e结论：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e……\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003e证据等级：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003e直接证据：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e- ……[[1. **Journal**, Year]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003e间接证据：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e- ……[[2. **Journal**, Year]](https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/PMID/)\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003e未见直接证据：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e- ……\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003e机制归纳：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e1. ……\u003c/p\u003e\u003cp\u003e2. ……\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003e检索边界：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e本轮主要检索 PubMed / PMC / BioC / bioRxiv；初筛基于 metadata + abstract，仅对关键文献进入全文复核。IF 标注基于公开可访问来源核查；无法高置信匹配时标为待核验或未检出。\u003c/p\u003e\u003cp\u003e \u003c/p\u003e\u003cp\u003e完整文献信息列表：\u003c/p\u003e\u003cp\u003e1. 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Wang X et al., **Journal Name** (2022), [DOI: 10.xxxx/xxxxx](https://doi.org/10.xxxx/xxxxx). *｛IF"])</script><script>self.__next_f.push([1,"＝待核验｝*\u003c/p\u003e\u003cp\u003e```\u003c/p\u003e\",\"localized_instructions_raw\":\"$47\",\"tools\":{\"write\":{\"use_tool\":\"required\",\"model\":\"claude-4-5-sonnet\"}},\"tool_as_skill\":{\"id\":\"019c32a0-c571-74f0-8ae5-9262c15cced7\",\"name\":\"写作\",\"config\":{\"model\":\"claude-4-5-sonnet\"}},\"at_references\":[]}]},\"content_visibility\":\"public\",\"origin\":\"custom\",\"suggested_categories\":[\"research\"],\"featured_reason\":\"Cette compétence constitue un guide fiable pour la recherche biomédicale, garantissant des informations de recherche très précises et vérifiables grâce à des recherches structurées, un examen de la littérature en plusieurs étapes et des vérifications rigoureuses du facteur d'impact (FI).\",\"seo_description\":\"La littérature reproductible est initialement sélectionnée à l'aide des utilitaires électroniques PubMed/NCBI, dédupliquée à l'aide de PMID, les résumés sont évalués et les textes intégraux sont examinés par PMC/BioC pour garantir que les citations sont cliquables et fournir des informations complètes sur la littérature ainsi que des facteurs d'impact vérifiés de manière prudente.\",\"input_hint\":\"Quelles questions biologiques/médicales souhaitez-vous explorer ? 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