Десять днів тому я отримала лист від Anthropic. Мій проєкт потрапив до їхньої програми AI for Science, і мені надали кредитів Claude на 30 000 доларів. Дякую всім учасникам програми за підтримку 🫶
Цей проєкт — моя власна пухлина 🥹
Мені 35, і в мене рак молочної залози 4 стадії. Я інженерка-програмістка, і з березня створюю інструменти, щоб краще розуміти свій рак. Сьогодні я можу ввести назву гена й побачити його у тисячах клітин своєї пухлини.
Моя метастаза в печінці, клітина за клітиною. Кожна крапка — це одна клітина, а колір показує, скільки в ній певного гена (ESR1).
Мені також потрібен хтось, хто зможе виготовити для мене персоналізовану вакцину, і лікарня, яка зможе її ввести. Про це детальніше в кінці.
Як усе почалося
Довгий час лікарі казали, що мій біль — це ішіас. Він ставав дедалі сильнішим, тож зрештою я оплатила МРТ самостійно. Результат прийшов електронною поштою в січні 2024 року, і я читала його наодинці. Була впевнена, що сталася помилка.
У березні цього року мій рак прогресував, і я вирішила дізнатися все можливе про свою пухлину.
Що маємо зараз
Рак поширився на печінку та кістки. Моя пухлина належить до рідкісного типу. Для такого випадку, як мій, немає конкретних протоколів, і кожна відповідь займає тижні.
Моя печінка у 3D, побудована на основі мого власного КТ-сканування. Жовті плями — це ураження. Деякі з них знайшов ШІ, і радіолог їх ще не підтвердив.
Мета — персоналізована вакцина, створена з моєї власної пухлини, щоб імунна система навчилася, що саме атакувати.
Коли я починала, то навіть не дуже розуміла, що таке неоантиген. Тепер я можу читати звіт із секвенування, спілкуватися з дослідниками й значно рідше гублюся в термінах.
Як це працює
Я будую це за допомогою Claude Code. Це команда з понад 30 агентів, і кожен має одне завдання. Один читає наукові статті та шукає клінічні випробування в інших країнах. Інший лише перевіряє кожну цифру за першоджерелом. Коли питання складне, два чи три агенти відповідають на нього незалежно, і якщо вони розходяться в думках, я це бачу. Звіти та файли приходять мені на телефон у Telegram, і нічого не надсилається далі, поки я не дам добро.
Усі медичні рішення ухвалюють мої лікарі. Агенти допомагають мені приходити на кожен прийом із кращими запитаннями, а експерти їх перевіряють. Іноді вони суттєво їх змінюють.
Протокол біопсії
Мені була потрібна нова біопсія, у Цюриху. Повторити біопсію непросто. Якщо зразок не взяли або зберегли неправильно, він втрачений.
Тому я написала протокол разом зі своєю системою: які зразки брати та як зберігати кожен із них залежно від того, що ми захочемо аналізувати пізніше. Потім команда лабораторії докторки Паломи Сехас у Dana-Farber, яка мала аналізувати ці зразки, переглянула його й покращила.
Моя пухлина, клітина за клітиною
Від цього в мене досі мурашки по шкірі.
Лабораторія докторки Сехас просеквенувала мої метастази в печінці та кістках клітина за клітиною за допомогою технології 10x Flex, яка працює зі збереженою тканиною. Усі дані лежать на моєму ноутбуці.
Поки без висновків. Ми повільно розбираємо їх разом із командою.
3D-карта моєї хвороби
У мене було два ПЕТ-сканування та купа звітів, але я не могла побачити загальну картину.
Ліворуч: усі ураження кісток із двох моїх ПЕТ-сканувань, забарвлені за типом трейсера. Праворуч: один із моїх хребців у 3D, як його видно на кожному ПЕТ-скануванні та на КТ.
Тому я побудувала 3D-карту своїх метастазів на основі цих двох сканувань. Ми використовували її разом із моєю медичною командою, щоб обговорити, з якого ураження робити біопсію. Рішення ухвалили вони. Допомогло те, що ми всі дивилися на одну й ту саму карту.
Коли мій порт-катетер перестав працювати, я відтворила його у 3D за трьома КТ-скануваннями, зробленими з різницею в кілька місяців, щоб перевірити, чи не змістився катетер.
Мій порт-катетер і його катетер у 3D, відтворені за трьома КТ-скануваннями. Фіолетовий пристрій — це ілюстрація.
Два роки аналізів крові на одному екрані
Кожен аналіз крові приходить у форматі PDF. За кілька місяців їх накопичуються десятки, і ніхто не читає їх усі.
Я зібрала їх в одну панель: понад 1800 показників із більш ніж 70 заборів крові, починаючи з грудня 2023 року. Лікар може швидко побачити, як змінювався кожен показник із часом.
Мені потрібен виробник вакцини та лікарня
Наступний крок — порівняння всього екзому моєї пухлини з моєю здоровою ДНК. Після цього ШІ вже мало чим зможе допомогти.
Дякую всім, хто робив донати або писав мені. Якщо ви можете виготовити чи ввести вакцину, або знаєте, хто це може зробити, напишіть мені. Мої особисті повідомлення відкриті, а вся інформація є на helpmiriam.com 💜
