สิบวันก่อนฉันได้รับอีเมลจาก Anthropic โปรเจกต์ของฉันได้เข้าร่วมโปรแกรม AI for Science ของพวกเขา พร้อมเครดิต Claude มูลค่า 30,000 ดอลลาร์ ขอบคุณทุกคนในโปรแกรมที่สนับสนุนสิ่งนี้ 🫶
โปรเจกต์ที่ว่าก็คือก้อนเนื้องอกของฉันเอง 🥹
ฉันอายุ 35 ปี และเป็นมะเร็งเต้านมระยะที่ 4 ฉันเป็นวิศวกรซอฟต์แวร์ และตั้งแต่เดือนมีนาคม ฉันก็สร้างเครื่องมือเพื่อทำความเข้าใจมะเร็งของตัวเอง วันนี้ฉันสามารถพิมพ์ชื่อยีนลงไป แล้วเห็นมันปรากฏอยู่ในเซลล์หลายพันเซลล์ของก้อนเนื้องอกตัวเองได้เลย
การแพร่กระจายไปที่ตับของฉัน แบบทีละเซลล์ แต่ละจุดคือหนึ่งเซลล์ และสีแสดงปริมาณของยีนหนึ่งตัว (ESR1) ที่มีอยู่ในเซลล์นั้น
ฉันยังต้องการคนที่สามารถผลิตวัคซีนเฉพาะบุคคลให้ฉันได้ และโรงพยาบาลที่สามารถฉีดให้ได้ด้วย เรื่องนี้จะเล่าเพิ่มเติมในตอนท้าย
จุดเริ่มต้น
นานมากที่หมอบอกว่าอาการปวดของฉันคือโรคปวดเส้นประสาทไซอาติก มันแย่ลงเรื่อย ๆ จนสุดท้ายฉันตัดสินใจจ่ายค่า MRI ด้วยตัวเอง ผลออกมาทางอีเมลในเดือนมกราคม 2024 และฉันอ่านมันอยู่คนเดียว ตอนนั้นฉันมั่นใจว่ามันต้องผิดพลาดแน่ ๆ
ในเดือนมีนาคมปีนี้ มะเร็งของฉันลุกลามขึ้น และฉันก็ตัดสินใจเรียนรู้ทุกอย่างเท่าที่จะทำได้เกี่ยวกับก้อนเนื้องอกของตัวเอง
สถานการณ์ตอนนี้
มะเร็งของฉันอยู่ที่ตับและกระดูก ก้อนเนื้องอกของฉันเป็นชนิดที่หายาก ไม่มีแนวทางรักษาเฉพาะสำหรับเคสแบบฉัน และการจะได้คำตอบแต่ละครั้งต้องรอเป็นสัปดาห์
ตับของฉันในรูปแบบ 3D สร้างจากภาพ CT scan ของฉันเอง จุดสีเหลืองคือรอยโรค บางจุดถูกค้นพบโดย AI และนักรังสีวิทยายังไม่ได้ยืนยัน
เป้าหมายคือการสร้างวัคซีนเฉพาะบุคคล จากก้อนเนื้องอกของฉันเอง เพื่อให้ระบบภูมิคุ้มกันเรียนรู้ว่าควรโจมตีอะไร
ตอนเริ่มทำ ฉันไม่รู้ด้วยซ้ำว่า neoantigen คืออะไร แต่ตอนนี้ฉันอ่านรายงาน sequencing ได้ คุยกับนักวิจัยรู้เรื่อง และไม่หลงทางบ่อยเหมือนแต่ก่อนแล้ว
สร้างขึ้นมาได้อย่างไร
ฉันสร้างมันด้วย Claude Code มันเป็นทีมที่มีเอเจนต์มากกว่า 30 ตัว และแต่ละตัวมีหน้าที่เดียว ตัวหนึ่งคอยอ่านเปเปอร์และหาการทดลองทางคลินิกในประเทศอื่น ๆ อีกตัวคอยตรวจสอบตัวเลขทุกตัวเทียบกับแหล่งที่มาเท่านั้น เวลาเจอคำถามยาก ๆ จะมีเอเจนต์สองหรือสามตัวตอบแยกกัน และถ้าคำตอบไม่ตรงกัน ฉันจะเห็นความต่างนั้น รายงานและไฟล์ต่าง ๆ จะส่งมาที่มือถือฉันผ่าน Telegram และไม่มีอะไรถูกส่งออกจนกว่าฉันจะกดอนุมัติ
หมอของฉันเป็นผู้ตัดสินใจทางการแพทย์ทั้งหมด เอเจนต์แค่ช่วยให้ฉันไปถึงนัดแต่ละครั้งด้วยคำถามที่ดีขึ้น แล้วผู้เชี่ยวชาญก็จะตรวจทานคำถามเหล่านั้นอีกที บางครั้งพวกเขาก็แก้เยอะเหมือนกัน
โปรโตคอลการตัดชิ้นเนื้อ
ฉันต้องตัดชิ้นเนื้อใหม่ที่ซูริก การตัดชิ้นเนื้อซ้ำไม่ใช่เรื่องง่าย ถ้าเก็บตัวอย่างไม่ได้ หรือเก็บไม่ถูกวิธี ตัวอย่างนั้นก็หายไปเลย
ดังนั้นฉันจึงเขียนโปรโตคอลด้วยระบบของฉันเอง: ต้องเก็บตัวอย่างไหนบ้าง และจะเก็บแต่ละตัวอย่างอย่างไร ขึ้นอยู่กับว่าเราต้องการวิเคราะห์อะไรในภายหลัง จากนั้นทีมที่ห้องแล็บของ Dr. Paloma Cejas ที่ Dana-Farber ซึ่งเป็นผู้วิเคราะห์ตัวอย่าง ก็ได้ช่วยตรวจทานและปรับปรุงให้ดีขึ้น
ก้อนเนื้องอกของฉัน ทีละเซลล์
เรื่องนี้ยังคงทำให้ฉันขนลุกเสมอ
ห้องแล็บของ Dr. Cejas ทำ sequencing การแพร่กระจายไปที่ตับและกระดูกของฉันแบบทีละเซลล์ ด้วยเทคโนโลยีที่เรียกว่า 10x Flex ซึ่งใช้กับเนื้อเยื่อที่เก็บรักษาไว้ได้ ตอนนี้ฉันมีข้อมูลนั้นอยู่ในแล็ปท็อป
ยังไม่มีข้อสรุปอะไร เรากำลังค่อย ๆ ดูไปทีละนิดร่วมกับทีมงาน
แผนที่ 3D ของโรคของฉัน
ฉันมีผล PET scan สองครั้งและรายงานอีก一大堆 แต่กลับมองไม่เห็นภาพรวมเลย
ซ้าย: รอยโรคที่กระดูกทุกรอยจาก PET scan ทั้งสองครั้งของฉัน แบ่งสีตามสารเภสัชรังสี ขวา: กระดูกสันหลังชิ้นหนึ่งของฉันในรูปแบบ 3D มองผ่าน PET แต่ละครั้งและผ่าน CT
ฉันเลยสร้างแผนที่ 3D ของการแพร่กระจายจากผลสแกนทั้งสองครั้งนั้น เราใช้มันร่วมกับทีมแพทย์เพื่อหารือว่าจะตัดชิ้นเนื้อจากรอยโรคไหน พวกเขาเป็นคนตัดสินใจ การที่เราทุกคนมองแผนที่เดียวกันช่วยได้มาก
ตอนที่สาย port ให้ยาของฉันใช้งานไม่ได้ ฉันก็สร้างมันขึ้นมาใหม่ในรูปแบบ 3D จาก CT scan สามครั้งที่ถ่ายห่างกันหลายเดือน เพื่อดูว่าสายสวนขยับไปหรือเปล่า
port และสายสวนของฉันในรูปแบบ 3D สร้างใหม่จาก CT scan สามครั้ง อุปกรณ์สีม่วงเป็นเพียงภาพประกอบ
ผลเลือดสองปีในหน้าจอเดียว
ผลตรวจเลือดทุกครั้งมาเป็นไฟล์ PDF ผ่านไปไม่กี่เดือนคุณจะมีเป็นสิบ ๆ ไฟล์ และไม่มีใครอ่านมันทั้งหมดหรอก
ฉันเอามันมารวมไว้ในแดชบอร์ดเดียว: ค่ามากกว่า 1,800 รายการ จากการเจาะเลือดกว่า 70 ครั้งตั้งแต่เดือนธันวาคม 2023 หมอสามารถดูได้ทันทีว่าค่าแต่ละตัวเปลี่ยนแปลงไปอย่างไรเมื่อเวลาผ่านไป
ฉันต้องการผู้ผลิตวัคซีนและโรงพยาบาล
ขั้นตอนต่อไปคือการนำ whole exome ของก้อนเนื้องอกมาเทียบกับ DNA ปกติของฉัน หลังจากนั้น AI ก็ช่วยฉันได้ไม่มากนัก
ขอบคุณทุกคนที่บริจาคหรือเขียนข้อความถึงฉัน ถ้าคุณผลิตวัคซีนหรือฉีดให้ได้ หรือรู้จักคนที่ทำได้ เขียนมาหาฉันนะ DM ของฉันเปิดรับเสมอ และข้อมูลทั้งหมดอยู่ที่ helpmiriam.com 💜
